| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NZ_LN832404 | 3,292,993 | A→G | 100% | M25V (ATG→GTG) | yraP → | divisome‑associated lipoprotein YraP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_LN832404 | 3,292,993 | 0 | A | G | 100.0% | 325.3 / NA | 93 | M25V (ATG→GTG) | yraP | divisome‑associated lipoprotein YraP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (52/41); total (52/41) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
CAGTTGAAGCCGCCGTTACGCGTGATATGACCATTGTGGCATTGACCGGCTATGACGGCGGCGAACTTGCAGGTTTGTTAGGGCCACAGGATGTGGAGATCCGCATTCCTTCGCATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGATTAAGGAGAATACATGAAGGCATTATCGCCAATCGCAGTCCTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGCTGCCGTAATG‑GGTACCGCTGCTGTGGGTACCAAAGCCGCAACTGACCCACGCAGTGTCGGCACCCAGGTGGACGATGGTACCCTGGAAGTGCGCGTGAACAGCGCATTGTCGAAAGACGAACAGATTAAGAAAGAAGCGCGCATTAATGTAACGGCCTATCAGGGCAAAGTGCTGCTGGTTGGGCAGTCACCAAATGCTGAACTTTCGGCTCGCGCCAAACA‑GATTGCTATGGGCGTAGACGGTGCCAACGAAGTGTATAACGAGATTCGTCAGGGCCAGCCGATTGGTCTGGGCGAAG > NZ_LN832404/3292703‑3293284 | caggtgtggccgccGTTTCCGGTGATAGGACCAGTGTGGCATTGACCGGCTATGACTGCGGCGAACTGGCAGGTTTGTTAGGGCCACAGGATGTGGAGATCCGCATTCCTTCGCATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGATTAAGGAGAATACATGAAGGCATTATCGCCAATCGCAGTCCTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGCTGCCGTAGTg‑gg < 2:434067/287‑1 (MQ=255) gccgccGTTACGCGTGATATGCCCATTGTGGCATTGACCGGCTATGACGGCGGCGAACTTGCAGGTTTGTTAGGGCCACAGGATGTGGAGATCCGCATTCCTTCGCATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGATTAAGGAGTATACATGAAGGCATTATCACCAATCGCAGTCCTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGCTGCCGTAGCG‑GGTCCCgctg > 1:744874/1‑295 (MQ=255) ttACGCGTGATATGACCATTGTGGCATTGACCGGCTATGACGGCGGCGAACTTGCAGGTTTGTTAGGGCCACAGGATGTGGAGATCCGCATTCCTTCGCATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGATTAAGGAGAATACATGAAGGCATTATCGCCAATCGCAGTCCTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGCTGCCGTAGTG‑GGTACCGCTGCTGTggg < 1:132955/295‑1 (MQ=255) aCGCGTGATATGACCATTGTGGCATTGACCGGCTATGACGGCGGCGAACTTGCAGGTTTGTTAGGGCCACAGGATGTGGAGATCCGCATTCCTTCGCATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCCGGATGATTAAGGAGAATACATGAAGGCATTATCGCAAAACGCAATCCTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAGGGTTGTGTTGCCGCTTCCGTAGTG‑GGTACAGCTCCGGTGGGTa > 2:825345/1‑295 (MQ=255) aCGCGTGATATGACCATTGTGGCATTGACCGGCTATGACGGCGGCGAACTTGCAGGTTTGTTAGGGCCACAGGATGTGGAGATCCGCATTCCTTCGCATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGATTAAGGAGACTACATGAAGGCATTATCGCCACTCGCAGTCCTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGCTGCCGTAGTG‑GGTCCCGCTGCTGTGGGTa > 2:474990/1‑295 (MQ=255) gATATGACCATTGTGGCATTGACCGGCTATGACGGCGGCGAACTTGCAGGTTTGTTAGGGCCACAGGATGTGGAGATCCGCCTTCCTTCGCATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGATTAAGGAGAATACATGAAGGCATTATCGCCAATCGCAGTCCTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGCTGCCGTAGTG‑GGTACCGCTGCTGTGGGTACCAAAg < 2:58077/295‑1 (MQ=255) ttgttggctggACCGGCTATTACGGCGGCGAACATGGAGTTTTTGTAGGGCCACAGGTGATGGAGATCCGCAGTCCTTCGCAGCGTAGTGCTTGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGATTAAGGAGAATACATGAAGGCATTATCGCCAATCGCAGTCCTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGCTGCCGTAGTG‑GGTACCGCTGCTGTGGGTACCAAAGCCGCAACTGa < 2:449609/285‑1 (MQ=255) gCATTGACCGGCTATGACGGCGGCGAACTTGCAGGTTTGTTAGGGCCACAGGATGTGGAGATCCGCATTCCTTCGCATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGATTAAGGAGAATACATGAAGGCATTATCGCAAATCGCAGTACTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGCTGCCGTCGTG‑GGTCCCGCTGTTGTGGGTGCCAAAGCCGCAACTGGcccca > 2:658748/1‑293 (MQ=255) tGACCGGCTATGACGGCGGCGAACTTGCAGGTTTGTTAGGGCCACAGGATGTGGAGATCCGCATTCCTTCGCATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGATTAAGGAGAATACATGAAGGCATTATCGCCAATCGCAGTCCTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGCTGCCGTAGTG‑GGTACCGCTGCTGTGGGTACCAAAGCCGCAACTGACCCACGCAg > 2:148273/1‑295 (MQ=255) cgtgtgaggACGGCGGCGACCTTGCAGGTTGGTTAGGGCCACAGGTCGTGGAGATCCGCATTCCTTCGCATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGATTAAGGAGAATACATGAAGGCATTATCGCCAATCGCAGTCCTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGCTGCCGTAGTG‑GGTACCGCTGCTGTGGGTACCAAAGCCGCAACTGACCCACGCAgtgt < 2:376045/287‑1 (MQ=255) ccGGCTATGACGGCGGCGAACTTGCAGGTTTGTTAGGGCCACAGGATGTGGAGATCCGCATTCCTTCGCATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGCTTAAGGAGCATACCTGAAGGCATTATCGCCAATCGCAGTCCTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCCCTGCCGTAGTG‑GGTACCGCTGCTGTGGGTACCAAAGCCGCAACTGACACACGCAgtgt > 1:276437/1‑295 (MQ=255) cGGCTATGAGGGCGGCGAACTTGCAAGTTTGTGAGGGCCACAGGATGTGGAGAGCCGCATTCCTTCGCATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGATTAAGGAGAATACATGAAGGCATTATCGCCAATCGCAGTCCTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGCTGCCGTAGTG‑GGTACCGCTGCTGTGGGTACCAAAGCCGCAACTGACCCACGCAGTGTc < 1:814127/295‑1 (MQ=255) ggcgagtacagcggcgACCTTGCAGTTTTGTCACTGCCACAGGGTGTGGCGATCCGCATTCCGTCGCATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCAGATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGATTAAGGAGAATACATGAAGGCATTATCGCCAATCGCAGTCCTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGCTGCCGTAGTG‑GGTACCGCTGCTGTGGGTACCAAAGCCGCAACTGACCCACGCAGTGTCg < 2:185295/285‑1 (MQ=255) aTGACGGCGGCGAACTTGCAGGTTTGTTAGGGCCACAGGATGTGGAGATCCGCATTCCTTCGCATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGATTCAGGAGAATACATGAAGGCATTATCGCCAATCGCAGTCCTTATTTCCGCGCAGCTGTTGCCAGGTTGTGTTGCCGCTGCCGTAGTG‑GGTCCCGCTGCTGTGGGTACCAAGGCCGACACTG‑CCCAccgccggtacggccc > 2:16418/1‑281 (MQ=255) ggcgggggccacattGCAGGTTGGTTAGGGCCACAGGAGGTGGATATCCCGATTCCTTCGCATCGTAGGGCTCGCATTCCGGAAAGGCATATGCGGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGATGAAGGAGAATACATGAAGGCATTATCGCCAATCGCAGTCCTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGCTGCCGTAGTG‑GGTACCGCTGCTGTGGGTACCAAAGCCGCAACTGACCCACGCAGTGTCGGCAccc < 2:653266/282‑1 (MQ=255) gcgAACTTGCAGGTTTGTTAGGGCCACAGGATGTGGAGATCCGCATTCCTTCGCATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGATTAAGGAGAATACATGAAGGCATTATCGCCAATCGCAGTCCTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGCTGCCGTAGTG‑GGTACCGCTGCTGTGGGTACCAAAGCCGCAACTGACCCACGCCGTCTCGGCCCCCCGGTGGa > 2:644976/1‑295 (MQ=255) aaCTTGCAGGTTTGTTAGGGCCACAGGATGTGGAGATCCGCATTCCTTCGCATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGATTAAGGAGAATACATGAAGGCATTATCGCCAATCGCAGTCCTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGCTGCCGTAGTG‑GGTACCGCTGCTGTGGGTACCAAAGCCGCAACTGACCCACGCAGTGTCGGCACCCAGGTGGACGa < 1:738053/295‑1 (MQ=255) aaCTTGCAGGTTTGTTAGGGCCACAGGATGTGGAGATCCGCATTCCTTCGCATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGATTAAGGAGAATACATGAAGGCATTATCGCCAATCGCAGTCCTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGCTGCCGTAGTG‑GGTACCGCTGCTGTGGGTACCAAAGCCGCAACTGACCCACGCAGTGTCGGCACCCAGGTGGACGa > 1:146082/1‑295 (MQ=255) ttttgtAGGGCCACAGGATGTTGAGATCCGCATTCCTTCGCTTCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGATTAAGGAGAATACATGAAGGCATTATCGCCAATCGCAGTCCTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGCTGCCGTAGTG‑GGTACCGCTGCTGTGGGTACCAAAGCCGCAACTGACCCACGCAGTGTCGGCACCCAGGTGGACGATGGTACCCTg < 1:477374/290‑1 (MQ=255) 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gtggtgCCGCTGCCGTAGTG‑GGTACCGCTGCTGTGGGTACCAAAGCCGCAACTGACCCACGCAGTGTCGGCACCCAGGTGGACGATGGTACCCTGGAAGTGCGCGTGAACAGCGCATTGTCGAAAGACGAACAGATTAAGAAAGAAGCGCGCATTAATGTAACGGCCTATCAGGGCAAAGTGCTGCTGGTTGGGCAGTCACCAAATGCTGAACTTTCGGCTCGCGCCAAACA‑GATTGCTATGGGCGTAGACGGTGCCAACGAAGTGTATAACGAGATTCGTCAGGGCCAGCCGAt < 1:280981/295‑1 (MQ=255) cTGCCGTAGTG‑GGTACCGCTGCTGTGGGTACCAAAGCCGCAACTGACCCACGCAGTGTCGGCACCCAGGTGGACGATGGTACCCTGGAAGTGCGCGTGAACAGCGCATTGTCGAAAGACGAACAGATTAAGAAAGAAGCGCGCACTAATGTAACGGCCTACTAGGGCAAGGTGCTGCTGGCTGGGCAGTAACCCAATGCTGACCTTTCGTCCCGCGCCAAACA‑CATAGCAATGGGCGTAGCCGGCGCCACTGGAGTGTATGACGAGTTTCGCTCGGGCCAGCGGATTGGtgcggg > 2:102594/1‑290 (MQ=255) gCCGTAGTG‑GGTACCGCTGCTGTGGGTACCAAAGCCGCAACTGACCCACGCAGTGTCGGCACCCAGGTGGACGATGGTACCCTGGACGTGCGCGTGAACAGCGCATTGTCGAAAGACGAACGGATTAAGAAAGCAGCGCGCATTAATGTAACGGCCTATCAGTGCAAAGTGCTGCTGGTTGGGCAGTCACCAAATGCTGAACTTTCGGCTCGCGCCAAACA‑GATTGCTATGGGCGTAGACGGTGCCAACGAAGTGTATACCGAGATTCGTCAGGGCCAGCCGATTGGTCTGGGCg > 1:619905/1‑295 (MQ=255) cGTAGTG‑GGTACCGCTGCTGTGGGTACCAAAGCCGCAACTGACCCACGCAGTGTCGGCACCCAGGTGGACGATGGTACCCTGGAAGTGCGCGTGAACAGCGCATTGTCGAAAGACGAACAGATTAAGAAAGAAGCGCGCATTAATGTAACGGCCTATCAGGGCAAAGTGCTGCTGGTTGGGCAGTCACCAAATGCTGAACTTTCGGCTCGCGCCAAACA‑GATTGCTATGGGCGTAGACGGTGCCAACGAAGTGTATAACGAGATTCGTCAGGGCCAGCCGATTGGTCTGGGCGaa < 1:212683/295‑1 (MQ=255) gTAGTG‑GGTACCGCTGCTGTGGGTACCAAAGCCGCAACTGACCCACGCAGTGTCGGCACCCAGGTGGACGATGGTACCCTGGAAGTGCGCGTGAACAGCGCATTGTCGAAAGACGAACAGATTAAGAAAGAAGCGCGCATTAATGTAACGGCCTATCAGGGCAAAGTGCTGCTGGTTGGGCAGTCACCAAATGCTGAACTTTCGGCTCGCGCCAAACA‑GATTGCTATGGGCGTAGACGGTGCCAACGAAGTGTATAACGAGATTCGTCAGGGCCAGCCGATTGGTCTGGGCGAAg > 1:510246/1‑295 (MQ=255) | CAGTTGAAGCCGCCGTTACGCGTGATATGACCATTGTGGCATTGACCGGCTATGACGGCGGCGAACTTGCAGGTTTGTTAGGGCCACAGGATGTGGAGATCCGCATTCCTTCGCATCGTAGTGCTCGCATTCAGGAAATGCATATGCTGACGGTAAATTGCCTGTGCGATCTGATCGATAACACGCTTTTCCCTCACCAGGATGATTAAGGAGAATACATGAAGGCATTATCGCCAATCGCAGTCCTTATTTCCGCGCTGCTGTTGCAAGGTTGTGTTGCCGCTGCCGTAATG‑GGTACCGCTGCTGTGGGTACCAAAGCCGCAACTGACCCACGCAGTGTCGGCACCCAGGTGGACGATGGTACCCTGGAAGTGCGCGTGAACAGCGCATTGTCGAAAGACGAACAGATTAAGAAAGAAGCGCGCATTAATGTAACGGCCTATCAGGGCAAAGTGCTGCTGGTTGGGCAGTCACCAAATGCTGAACTTTCGGCTCGCGCCAAACA‑GATTGCTATGGGCGTAGACGGTGCCAACGAAGTGTATAACGAGATTCGTCAGGGCCAGCCGATTGGTCTGGGCGAAG > NZ_LN832404/3292703‑3293284 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |