| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913_3_KO_pgi | 4,233,840 | +GCTCGACCAATGGTCTGATTAACCGCTATAAAGCGTGGCGCGGTTA | intergenic (‑607/‑500) | lysC ← / → yjbE | lysine‑sensitive aspartokinase 3/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_KO_pgi | = 4233840 | 0 (0.000) | 30 (1.150) +GCTCGACCAATGGTCTGATTAACCGCTATAAAGCGTGGCGCGGTTA |
21/188 | 0.3 | 100% | intergenic (‑607/‑500) | lysC/yjbE | lysine‑sensitive aspartokinase 3/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
| ? | NC_000913_3_KO_pgi | 4233841 = | NA (NA) | intergenic (‑608/‑499) | lysC/yjbE | lysine‑sensitive aspartokinase 3/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein | |||||
TGGCGCTACAATCTTCCAAAGTCACAATTCTCAAAATCAGAAGAGTATTGCTAGGTGTAGGCTGGAGCTGCTTCGAAGTTCCTATACTTTCTAGAGAATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAA > NC_000913_3_KO_pgi/4233705‑4233989 | gcactacggtgtaggctggagctgcttcgaagttcctatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccggaatgctcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGata > 1:124570‑M2/137‑149 (MQ=255)gcactacggtgtaggctggagctgcttcgaagttcctatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccggaatgctcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGata > 1:397771‑M2/137‑149 (MQ=255) acggtgtaggctggagctgcttcgaagttcctatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccggaatgctcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAg < 1:98076‑M2/18‑1 (MQ=255) tggagctgcttcgaagttcctatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccggaatgctcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAgg > 1:559643‑M2/121‑149 (MQ=255) ttcgaagttcctatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccggaatgctcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaat > 1:121321‑M2/112‑113 (MQ=255) ttcgaagttcctatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccggaatgctcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaat < 2:121321‑M2/2‑1 (MQ=255) ttcgaagttcctatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccggaatgctcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCAcgc > 1:586700‑M2/112‑149 (MQ=255) tatactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccggaatgctcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCa > 1:548383‑M2/101‑149 (MQ=255) atactttctagagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccggaatgctcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCaa > 1:412250‑M2/100‑149 (MQ=255) agagaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccggaatgctcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCt > 2:250421‑M2/91‑149 (MQ=255) gaataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccggaatgctcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcgtttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGAt < 1:96354‑M2/62‑1 (MQ=255) aataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccggaatgctcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCGGCATCCGGCAACCGATGCGTGATg > 1:176196‑M2/87‑149 (MQ=255) aataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccggaatgctcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATg < 2:89610‑M2/63‑1 (MQ=255) aataggaacttcgaactgcaggtcgacggatccccggaatgctcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATg > 1:175878‑M2/87‑149 (MQ=255) gaacttcgaactgcaggtcgacggatccccggaatgctcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGAcg > 1:63344‑M2/82‑149 (MQ=255) ttcgaactgcaggtcgacggatccccggaatgctcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGt > 2:311239‑M2/78‑149 (MQ=255) tcgaactgcaggtcgacggatccccggaatgctcgatcaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATAagacgcgacc < 1:175922‑M2/73‑4 (MQ=255) gaactgcaggtcgacggatccccggaatgctcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTcgc < 2:397771‑M2/75‑1 (MQ=255) actgcaggtcgacggatccccggaatgctcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGt > 1:149426‑M2/73‑149 (MQ=255) 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cggaatgctcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATACCTGATGCGACGCGGTCCCGTCTTCTCAGGCCTACAGGTCg > 2:37469‑M2/53‑149 (MQ=255) tcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtgggggggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGat > 1:167268‑M2/45‑149 (MQ=255) tcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGat > 2:392234‑M2/45‑149 (MQ=255) tcgaccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGat > 2:548065‑M2/45‑149 (MQ=255) gtcacccatggtctgattaaccgctagtaagcgtcgctgggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCACCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGat < 2:54470‑M2/105‑1 (MQ=255) ccaatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCCTCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGt < 2:674792‑M2/109‑1 (MQ=255) caatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTa > 1:508739‑M2/40‑149 (MQ=255) aatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTAc < 1:311239‑M2/111‑1 (MQ=255) aatggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTAc < 2:508739‑M2/111‑1 (MQ=255) atggtctgattaaccgctataaggcgtggagcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGTATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACa < 2:55960‑M2/112‑1 (MQ=255) atggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACa > 1:354117‑M2/38‑149 (MQ=255) ggtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGAAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGCCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATc < 1:425037‑M2/114‑1 (MQ=255) gtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCg > 1:226605‑M2/35‑149 (MQ=255) gtctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCg > 2:400930‑M2/35‑149 (MQ=255) tctgattaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGt > 2:534435‑M2/34‑149 (MQ=255) attaatcgcgagaaagcgtggcgcggttaAGCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTc < 1:227062‑M2/120‑1 (MQ=255) attaaccgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTc > 1:549659‑M2/30‑149 (MQ=255) cgctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGcaaa > 1:42385‑M2/24‑148 (MQ=255) gctataaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAAtt > 2:180673‑M2/23‑149 (MQ=255) aaagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGCGATGTACATCGTATTCGGCAATTGATAc > 1:17921‑M2/18‑149 (MQ=255) aagcgtggcgcggttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACa > 2:422711‑M2/17‑149 (MQ=255) gttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACgattga < 2:354117‑M2/145‑1 (MQ=255) gttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACgattga < 2:559643‑M2/145‑1 (MQ=255) gttaATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACgattga > 2:216675‑M2/5‑149 (MQ=255) ttaATCATCGTCGTTATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACgattgat < 1:87719‑M2/146‑1 (MQ=255) atcatcGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTaa > 1:132869/1‑149 (MQ=255) | TGGCGCTACAATCTTCCAAAGTCACAATTCTCAAAATCAGAAGAGTATTGCTAGGTGTAGGCTGGAGCTGCTTCGAAGTTCCTATACTTTCTAGAGAATAGGAACTTCGAACTGCAGGTCGACGGATCCCCGGAATATCATCGTCGATATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAA > NC_000913_3_KO_pgi/4233705‑4233989 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |