| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,722,492 | C→A | T847K (ACG→AAG) | pka → | protein lysine acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,722,492 | 0 | C | A | 98.9% | 298.6 / NA | 88 | T847K (ACG→AAG) | pka | protein lysine acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base A (51/36); total (51/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.20e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCGATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTACGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGTTGGGCTTACGCTAAATCTTGCCCAGCGCGAGGAATCATGAGTAAGGTACTGGAAATGTTGACC > NC_000913/2722347‑2722636 | gCGATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGAt > 1:253008/1‑149 (MQ=255)gCGATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGAt > 6:338230/1‑149 (MQ=255) cGATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGAt < 7:193686/148‑1 (MQ=255) cGATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGAt < 5:117763/148‑1 (MQ=255) cGATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATg > 5:74563/1‑149 (MQ=255) gATTTCCGATCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGACGACGCTTAATGGATAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGc > 7:132992/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCTGATAACATCGATGACGTATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATGTCTAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCaaa < 8:132992/148‑1 (MQ=255) aTCCTGATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAAt < 3:316903/149‑1 (MQ=255) gATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTTAATGGTATTAAGATGCCaa < 6:295382/139‑1 (MQ=255) gATAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCaa > 5:295382/1‑139 (MQ=255) aTAACATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTg < 2:213610/147‑1 (MQ=255) aaCATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAt > 8:30352/1‑149 (MQ=255) aaCATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAt > 1:353435/1‑149 (MQ=255) aaCATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAt > 4:122838/1‑149 (MQ=255) aCATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAtg < 5:201359/149‑1 (MQ=255) cATCGATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAtgg > 1:43634/1‑149 (MQ=255) gATGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCAtggtgg < 4:110158/148‑1 (MQ=255) aTGCCGAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGgcg > 5:317743/1‑149 (MQ=255) gAATTTGCTGTACTGGTTCGCTCGGATCTCAAAGGGTTAGGCTTAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGc > 3:221432/1‑149 (MQ=255) 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ttAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAggg > 3:136381/1‑149 (MQ=255) ttAGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAggg > 2:163347/1‑149 (MQ=255) aGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAggg < 3:122838/147‑1 (MQ=255) aGGTCGACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAggg < 1:310128/147‑1 (MQ=255) gACGCTTAATGGAAAAGTTGATTACCTATACGCGAGATCACGGACTACAACGTCTGAATGGTATTAAGATGCCAAACAATCGTGGCATGGTGGCGCTAGCCCGCAAGCTCGGGTTTAACGTTGATATCCAGCTCGAAGAGGGGATCGtt > 7:261930/1‑149 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |