| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,448,094 | Δ1 bp | 5.4% | coding (576/1500 nt) | feaB → | phenylacetaldehyde dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,448,094 | 0 | T | . | 5.4% | 237.6 / 6.3 | 74 | coding (576/1500 nt) | feaB | phenylacetaldehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/30); new base . (2/2); total (42/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.03e-01 | |||||||||||
GACTTGTCGATTCCCTTACCCCAGGGGGCGCGTTATCAGGCCTGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCACCGGGTCAGGTGCTGTATGCGGCGCGGCCCTGACGTCACATCCTC > NC_000913/1447948‑1448242 | gACTTGTCGATTCCCTTACCCCCGGGGGCGCGTTATCAGGCCGGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGtt < 2:236870/148‑1 (MQ=255) cTTGTCGATTCCCTTACCCCAGGGGGCGCGTTATCAGGCCTGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCaa > 8:357235/1‑149 (MQ=255) gTCGATTCCCTTACCCCAGGGGGCGCGTTATCAGGCCTGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCg > 2:241514/1‑149 (MQ=255) gTCGATTCCCTTACCCCAGGGGGCGCGTTATCAGGCCTGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGGTCAATCg > 1:306586/1‑149 (MQ=255) gATTCCCTTACCCCAGGGGGCGCGTTATCAGGCCTGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGa > 4:220813/1‑149 (MQ=255) gATTCCCTTACCCCAGGGGGCGCGTTATCAGGCCTGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGa > 1:28174/1‑149 (MQ=255) gATTCCCTTACCCCAGGGGGCGCGTTATCAGGCCTGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGa > 1:88407/1‑149 (MQ=255) aTTCCCTTACCCCAGGGGGCGCGTTATCAGGCCTGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGAATGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGAt > 2:227810/1‑149 (MQ=255) ccTTACCCCAGGGGGCGCGTTATCAGGCCTGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTaa < 3:257313/148‑1 (MQ=255) ccTTACCCCAGGGGGCGCGTTATCAGGCCTGGACGCGTAAAGAGCCGGATGGCGTAGTGGCGGGAATTGAGCCATGGAACTATCCGTTGATGATTGGTATGTTGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAg > 5:172435/1‑149 (MQ=255) ccccAGGGGGCGCGTTATCAGGCCTGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTc < 8:146076/149‑1 (MQ=255) ggCGCGTTATCAGGCCTGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGGTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCa > 7:168682/1‑149 (MQ=255) gcgTTATCAGGCCTGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTc > 2:221248/1‑138 (MQ=255) gcgTTATCAGGCCTGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTc < 1:221248/138‑1 (MQ=255) gTTATCAGGCCTGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCa < 3:7177/149‑1 (MQ=255) aTCAGGCCTGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACt > 1:192559/1‑148 (MQ=255) aGGCCTGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAACCCACGCCACTGAc > 5:7151/1‑148 (MQ=255) ggCCTGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGa < 3:336436/149‑1 (MQ=255) tGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTG‑TCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTg > 7:329249/1‑149 (MQ=255) tGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTG‑TCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTg > 7:323711/1‑149 (MQ=255) gcgTAAAGAGCCGGTTGGCGTATTGGAGGGAATTTTGCCATGGAACTTTAATTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGAAGATGTTgc < 2:196926/146‑1 (MQ=255) gcgTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGcgcg < 6:85157/149‑1 (MQ=255) gcgTAAAGAGACTGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTCAAGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCAATGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGACTTCGGAAACCACGCCACAGACGATGTTga > 1:196926/1‑145 (MQ=255) cgTAAAGAGCCGGTTTGCGTAGTGGCGGTAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGATATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGt < 3:137819/149‑1 (MQ=255) gTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGa > 8:92997/1‑138 (MQ=255) gTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGa < 7:92997/138‑1 (MQ=255) gTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTg > 5:181545/1‑149 (MQ=255) tAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTgg > 5:112455/1‑149 (MQ=255) tAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTgg > 7:340748/1‑149 (MQ=255) aaGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCg > 7:331097/1‑149 (MQ=255) aaGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGAGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCg > 1:166420/1‑149 (MQ=255) gTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGTGGAACTGGc < 2:28174/149‑1 (MQ=255) gTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGc > 2:310172/1‑147 (MQ=255) gTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGc < 1:310172/149‑1 (MQ=255) gCGGGAATTGTTCCTTGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGAGGCGAGCACTGGCTGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAACCCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTTGCCAGCGAGGCTg < 1:233122/148‑1 (MQ=255) gCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCACTCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTg < 7:235699/148‑1 (MQ=255) gCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTg < 2:76176/148‑1 (MQ=255) gCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTg < 2:88407/148‑1 (MQ=255) gggAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTa < 1:298983/149‑1 (MQ=255) gtgCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTG‑TCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGa < 8:323711/148‑1 (MQ=255) gtgCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTG‑TCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGa < 8:329249/148‑1 (MQ=255) tgCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGTTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCTCTGTCGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGTCCAGCGTGGCTGGTATCCCTGa < 6:172435/148‑1 (MQ=255) tgCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGa < 8:340748/148‑1 (MQ=255) cATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGc > 1:42236/1‑149 (MQ=255) tGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGt > 8:397377/1‑149 (MQ=255) gAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGttt > 8:256802/1‑149 (MQ=255) caCTTTCCGTTGATGATGGGTTTGTTGAAGGGGATGCCAGCACAGGCAGGAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATTTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGtttt < 6:242708/148‑1 (MQ=255) aaCTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAATGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGtttt < 3:220813/149‑1 (MQ=255) aaCTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGa > 1:144936/1‑125 (MQ=255) aaCTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGa < 2:144936/125‑1 (MQ=255) aaCTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGtttt > 1:175235/1‑149 (MQ=255) tttCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTaa > 4:66634/1‑149 (MQ=255) tCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTaa < 6:112455/147‑1 (MQ=255) tCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAAt < 8:331097/148‑1 (MQ=255) tCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAAt < 5:189341/148‑1 (MQ=255) cGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATgtc < 1:241514/149‑1 (MQ=255) cGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATgt < 5:397368/148‑1 (MQ=255) tgatTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCAcc < 5:20959/149‑1 (MQ=255) tgatTGGTATGTGGAAGGGGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCAcc < 2:166420/149‑1 (MQ=255) gatTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCACCg > 4:75486/1‑149 (MQ=255) aGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCACCGGGTCAGGTGCTGTa > 5:323010/1‑149 (MQ=255) ggTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCACCGGGTCAGGTGCTGTAt > 3:359682/1‑149 (MQ=255) aTGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACGGACGATGTTGCGCGTGGCGGACCTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCACCGGGTCAGGTGCTGTATgcgg > 3:21223/1‑149 (MQ=255) tGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCACCGGGTCAGGTGCTGTa > 8:379075/1‑143 (MQ=255) tGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCACCGGGTCAGGTGCTGTa < 7:379075/143‑1 (MQ=255) tGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCACCGGGTCAGGTGCTGTATgcggc > 3:290102/1‑149 (MQ=255) tGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCACCGGGTCAGGTGCTGTATgcggc > 7:360269/1‑149 (MQ=255) ccAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCTGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCACCGGGTCAGGTGCTGTATgcggcgc > 3:71285/1‑149 (MQ=255) cAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCACCGGGTCAGGTGCTGTATgcggcgcg > 5:375112/1‑149 (MQ=255) tGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATgtcgt > 4:55340/1‑115 (MQ=255) tGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCACCGGGTCAGGTGCTGTATGCGGCGCGGCCCt > 2:174136/1‑148 (MQ=255) agcagGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCTGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCACCGGGTCAGGTGCTGTATGCGGCGCGGCCCTGACGt < 4:71285/149‑1 (MQ=255) gcagGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCACCGGGTCAGGTGCTGTATGCGGCGCGGCCCTGACGt > 7:161158/1‑148 (MQ=255) agGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCACCGGGTCAGGTGCTGTATGCGGCGCGGCCCTGACGTca > 8:345081/1‑148 (MQ=255) ggCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCACCGGGTCAGGTGCTGTATGCGGCGCGGCCCTGACGTcaca > 5:122345/1‑149 (MQ=255) ttCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCACCGGGTCAGGTGCTGTATGCGGCGCGGCCCTGACGTCACATCCTc < 2:42236/149‑1 (MQ=255) | GACTTGTCGATTCCCTTACCCCAGGGGGCGCGTTATCAGGCCTGGACGCGTAAAGAGCCGGTTGGCGTAGTGGCGGGAATTGTGCCATGGAACTTTCCGTTGATGATTGGTATGTGGAAGGTGATGCCAGCACTGGCAGCAGGCTGTTCAATCGTGATTAAGCCTTCGGAAACCACGCCACTGACGATGTTGCGCGTGGCGGAACTGGCCAGCGAGGCTGGTATCCCTGATGGCGTTTTTAATGTCGTCACCGGGTCAGGTGCTGTATGCGGCGCGGCCCTGACGTCACATCCTC > NC_000913/1447948‑1448242 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |