| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 1411899 = | 113 (1.250) | 6 (0.080) | 6/214 | NT | 7.1% | coding (50/936 nt) | ttcA | tRNA s(2)C32 thioltransferase, iron sulfur cluster protein |
| ? | NC_000913 | = 1434958 | 67 (0.920) | pseudogene (51/51 nt) | ttcC | pseudogene, prophage Rac integration site ttcA duplication;Phage or Prophage Related | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
AAAAATGGGGCAAAACGCTGCAAAAGGGGCAAAAAAGGGGCAAAAAAAGAGTGGATTATCGTAGCTTATTGTTGTCGCTGATGATATTTAACACATTGAAAAATAAGTAAAATACTTATGAGTCAGAGAGTTGTGATTTTTGCCCTTACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTGATATAAAAAACTGTGGCGTGTA > NC_000913/1434810‑1435105 | aaaaaTGGGGCAAAACGCTGCAAAAGGGGCAAAAAAGGGGCAAAAAAAGAGTGTATTATCGTAGCTTATTGTTGTCGCTGATGATATTTAACACATTGAAAAATAAGTAAAATACTTATGAGTCAGAGAGTTGTGATTTTTGCCCTTAc < 3:240557/149‑1 (MQ=255) aaaaTGGGGCAAAACGCTGCAAAAGGGGCAAAAAAGGGGCAAAAAAAGAGTGGATTATCGTAGCTTATTGTTGTCGCTGATGATATTTAACACATTGAAAAATAAGTAAAATACTTATGAGTCAGAGAGTTGTGATTTTTGCCCTTACt > 5:376177‑M2/1‑148 (MQ=255) aaaaTGGGGCAAAACGCTGCAAAAGGGGCAAAAAAGGGGCAAAAAAAGAGTGGATTATCGTAGCTTATTGTTGTCGCTGATGATATTTAACACATTGAAAAATAAGTAAAATACTTATGAGTCAGAGAGTTGTGATTTTTGCCCTTACt < 7:83065‑M2/149‑2 (MQ=255) aaTGGGGCAAAACGCTGCAAAAGGGGCAAAAAAGGGGCAAAAAAAGAGTGGATTATCGTAGCTTATTGTTGTCGCTGATGATATTTAACACATTGAAAAATAAGTAAAATACTTATGAGTAAGAGAGTTGTGATTTTTGCCCTTACttg < 1:157529‑M2/149‑4 (MQ=255) gCAAAACGCTGCAAAAGGGGCAAAAAAGGGGCAAAAAAAGAGTGGATTATCGTAGCTTATTGTTGTCGCTGATGATATTTAACACATTGAAAAATAAGTAAAATACTTATGAGTCAGAGAGTTGTGATTTTTGCCCTTACttgttcagg < 2:348243‑M2/149‑10 (MQ=255) gCAAAACGCTGCAAAAGGGGCAAAAAAGGGGCAAAAAAAGAGTGGATTATCGTAGCTTATTGTTGTCGCTGATGATATTTAACACATTGAAAAATAAGTAAAATACTTATGAGTCAGAGAGTTGTGATTTTTGCCCTTACttgttcagg > 7:381923‑M2/1‑140 (MQ=255) aattcgcttCAAAAGGGGCAAAAAAGGGGCAAAAAAAGAGTGGATTATCGTAGCTTATTGTTGTCGCTGATGATATTTAACACATTGAAAAATAAGTAAAATACTTATGAGTCAGAGAGTTGTGATTTTTGCCCTTACttgttcaggtt > 1:296055‑M2/5‑138 (MQ=255) aaaaCTCTGCAAAAGGGGCAAAAAAGTGTCAAAAAAAGAGTTGATTATCGTAGCTTATTGTTGTCGATGATTATATTTAACACATTGAAAAATAAGTAAAATAATTATGAGTCATAGAGTTGTGATTTTTGCCCTTACttgttcaggtt > 5:343084‑M2/1‑138 (MQ=255) aaaaCGCTGCAAAAGGGGAAAAAAAGGGGCAAAAAAAGAGTGGAATATCGTAGCTTATTGTTGTCGCTGAGGATATTTAACACATTGAAAAATAAGTAAAATACTTTTGAGTCAGAGAGTTGTGATTTTTGCCCTTACttcttcaggtt < 3:237599‑M2/149‑12 (MQ=255) aaaCGCTGCAAAAGGGGCAAAAAAGGGGCAAAAAAAGAGTGGATTATCGTAGCTTATTGTTGTCGCTGATGATATTTAACACATTGAAAAATAAGTAAAATACTTATGAGTCAGAGAGTTGTGATTTTTGCCCTTACttgttcaggttg < 5:213314‑M2/149‑13 (MQ=255) aaaCGCTGCAAAAGGGGCAAAAAAGGGGCAAAAAAAGAGTGGAGTATCGTAGCTTATTGTTGTCGCTGATGATATTTAACACATTGAAAAATAAGTAAAATACTTATGAGTCAGAGAGTTGTGATTTTTGCCCTTACttgttcaggttg < 8:139565‑M2/149‑13 (MQ=255) aCGCTGCAAAAGGGGCAAAAAAGGGGCAAAAAAAGAGTGGATTATCGTAGCTTATTGTTGTCGCTGATGATATTTAACACATTGAAAAATAAGTAAAATACTTATGAGTCAGAGAGTTGTGATTTTTGCCCTTACttgttcaggttgta > 4:156511‑M2/1‑135 (MQ=255) aCGCTGCAAAAGGGGCAAAAAAGGGGCAAAAAAAGAGTGGATTATCGTAGCTTATTGTTGTCGCTGATGATATTTAACACATTGAAAAATAAGTAAAATACTTATGAGTCAGAGAGTTGTGATTTTTGCCCTTACttgttcaggttgta > 7:400772‑M2/1‑135 (MQ=255) 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agagagTTGTGATTTTTGCCCTTACttgttcaggttgtattgttctttctttgtaatttgttgattttcttgcattatttcagttctctggtactaaatggggcaaattggggtcaaactttgcaactacgataaccgcgcattcaaca > 3:201847‑M2/1‑25 (MQ=255) agagagTTGTGATTTTTGCCCTTACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCt > 8:151004/1‑149 (MQ=255) gatagTTGTTATTTTTGCCCTTACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTg < 3:275543/146‑1 (MQ=255) gagagTTGTGATTTTTGCCCTTACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCt > 8:218242/1‑148 (MQ=255) ttGTGATTTTTGCCCTTACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTAGTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTTTATGGCATCAGAAGAGTATGCGTGATGCCGGAGCGCCCAGCATAAGAAATCTGattt > 8:379839/1‑146 (MQ=255) gtgATTTTTGCCCTTACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTGATATaa > 1:391137/1‑148 (MQ=255) gATTTTTGCCCTTACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTGATATaaaa > 7:299923/1‑148 (MQ=255) tttttGCCCTTACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTGATATaaaaaa < 6:220984/148‑1 (MQ=255) ttttGCCCTTACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTGATATAAAAAACt > 7:26729/1‑149 (MQ=255) tttGCCCTTACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTGATATAAAAAACt < 4:287448/148‑1 (MQ=255) cTTACttgttcaggttgtattgttctttctttgtaatttgttgattttcttgcattatttcagttctctggtactaaatggggcaaattgggggcaaactttgcaactacgataaccgcgcattcaacatggctatctgttcgtcgtt < 7:50726‑M2/148‑144 (MQ=255) cTTACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTGATATAAAAAACTGTGGCgt < 7:218242/149‑1 (MQ=255) cTTACTTGTTCAGGTTGTAATGTTCTTTCTTACTATTTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGAGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGACGGAACGCCCTGCATAAGAAATCTGATATAAAAAACTGTGGCgt < 1:115221/149‑1 (MQ=255) ttACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGAGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTGATATAAAAAACTGTGGCgtg < 1:17922/149‑1 (MQ=255) tACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTGATATAAAAAACTGTGGCgtg > 2:84533/1‑148 (MQ=255) aCTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTGATATAAAAAACTGTGGCgtgt < 4:36828/148‑1 (MQ=255) | AAAAATGGGGCAAAACGCTGCAAAAGGGGCAAAAAAGGGGCAAAAAAAGAGTGGATTATCGTAGCTTATTGTTGTCGCTGATGATATTTAACACATTGAAAAATAAGTAAAATACTTATGAGTCAGAGAGTTGTGATTTTTGCCCTTACTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTACTAATTTCTTGATTTTGCGACATTTAAAAGCGACTCAATTCGTTATATGGCATCAGAAGAGTATGCGTCATGCCGGAACGCCCAGCATAAGAAATCTGATATAAAAAACTGTGGCGTGTA > NC_000913/1434810‑1435105 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |