New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4588347 = | 96 (1.110) | 3 (0.040) | 3/252 | NT | 3.2% | coding (519/957 nt) | yjiA | metal‑binding GTPase |
? | NC_000913 | 4588379 = | 87 (1.050) | coding (487/957 nt) | yjiA | metal‑binding GTPase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CGTTTTGTTTATCTGCGATAAAGTGGAAACGCGGTTTGGTGCTGACGACGTTTTCTTCCAGCATAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGATCGATGTCGCCGTGGGTGACGGTGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCGCATCCACCAGCGCAATCACGCCGT > NC_000913/4588199‑4588495 | catgaagttttatgccagcgttatctgctggacggcgtgattgcgctggtggatgcggtacatgccgatgagcagatgaaccagttcaccatcgcccagtcacaggttggctacgccgaccgcattctgctgaccaaaaccgacgtcgc < 8:145765‑M1/1‑1 (MQ=255) atgaagttttatgccagcgttatctgctggacggcgtgattgcgctggtggatgcggtacatgccgatgagcagatgaaccagttcaccatcgcccagtcacaggttggctacgccgaccgcattctgctgaccaaaaccgacgtcgCa > 4:310672‑M1/148‑149 (MQ=255) tgaagttttatgccagcgttatctgctggacggcgtgattgcgctggtggatgcggtacatgccgatgagcagatgaaccagttcaccatcgcccagtcacaggttggctacgccgaccgcattctgctgaccaaaaccgacgtcgCAg < 7:133993‑M1/3‑1 (MQ=255) gaagttttatgccagcgttatctgctggacggcgtgattgcgctggtggatgcggtacatgccgatgcgcagatgaaccagttcaccatcgcccagtcacaggttggctccgccgaccgcattctgctgaccaacaccgacgtcgCAgg < 6:36250‑M1/4‑1 (MQ=255) tttATCTGCGATAAAGTGGAAACGCGGTTTGGTGCTGACGACGTTTTCTTCCAGCATAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGATCGATGTCGCCGTGGGTGACGGTGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGtt > 7:149935/1‑149 (MQ=255) tttATCTGCGATAAAGTGGAAACGCGGTTTGGTGCTGACGACGTTTTCTTCCAGCATAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGATCGATGTCGCCGTGGGTGACGGGGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGtt < 3:343779/149‑1 (MQ=255) tttATCTGCGATAAAGTGGAAACGCGGTGTGGTGCTGACGACGTTTTCTTCCAGCATAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGATCGATGTCGCCGTGGGTGACGGTGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGt < 1:26028/148‑1 (MQ=255) tATCTGCGATAAAGTGGAAACGCGGTTTGGTGCTGACGACGTTTTCTTCCAGCATAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGATCGATGTCGCCGTGGGTGACGGTGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTc < 5:84386/148‑1 (MQ=255) tCTGCGATAAAGTGGAAACGCGGTTTGGTGCTGACGACGTTTTCTTCCAGCATAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGATCGATGTCGCCGTGGGTGACGGTGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATg > 6:42472/1‑149 (MQ=255) tGCGATAAAGTGGAAACGCGGTTTGGTGCTGACGACGTTTTCTTCCAGCATAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGATCGATGTCGCCGTGGGTGACGGTGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATg > 6:114114/1‑147 (MQ=255) cGATAAAGTGGAAACGCGGTTTGGTGCTGACGACGTTTTCTTCCAGCATAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGATCGATGTCGCCGTGGGTGACGGTGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATg < 7:57092/145‑1 (MQ=255) cGATAAAGTGGAAACGCGGTTTGGTGCTGACGACGTTTTCTTCCAGCATAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGATCGATGTCGCCGTGGGTGACGGTGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATg < 6:352038/145‑1 (MQ=255) aTAAAGTGGAAACGCGGTTTGGTGCTGACGACGTTTTCTTCCAGCATAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGATCGATGTCGCCGTGGGTGACGGTGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGttt > 7:11187/1‑149 (MQ=255) 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cgacgTTTTCTTCCAGCATAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGATCGATGTCGCCGTGGGTGACGGTGTAGCCCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTg < 7:363003/149‑1 (MQ=255) gTTTTCTTCCAGCATAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGATCGATGTCGCCGGGGGTGACGGTGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTca < 5:227368/149‑1 (MQ=255) tcttcCAGCATAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGATCGATGTCGCCGTGGGTGACGGTGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTcagca < 1:139062/148‑1 (MQ=255) ttcCAGCATAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGATCGATGTCGCCGTGGGTGACGGTGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGaa > 2:196652/1‑149 (MQ=255) cAGCATAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGATCGATGTCGCCGTGGGTGACGGTGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATg < 4:253802/148‑1 (MQ=255) cAGCATAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGATCGATGTCGCCGTGGGTGACGGTGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGc > 5:191956/1‑149 (MQ=255) cAGCATAAAACCGTAGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGCTCGATGTCGCCGTGGGTGACGGTGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGGTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAAAGc > 3:206789/1‑149 (MQ=255) cATAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGCTCGATGTCGCCGTGGGTGACGGTGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGt > 7:264170/1‑149 (MQ=255) cATAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGATCGATGTCGCCGTGGGTGACGGTGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGt < 1:335667/149‑1 (MQ=255) aTAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGATCGATGTCGCCGTGGGTGACGGTGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTc > 3:17185/1‑149 (MQ=255) 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gtgtAGAGCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGc < 5:367214/149‑1 (MQ=255) gtgtAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGc < 8:11187/149‑1 (MQ=255) tAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCAt < 5:42472/148‑1 (MQ=255) gACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTc < 6:157899/130‑1 (MQ=255) gACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTc > 5:157899/1‑130 (MQ=255) cGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCg > 7:145765/1‑149 (MQ=255) cGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCg > 5:177242/1‑149 (MQ=255) tGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCGCAt < 8:187085/149‑1 (MQ=255) cgcgGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCGCATcc < 1:19923/149‑1 (MQ=255) gCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCGCATCCACCAg > 8:46961/1‑149 (MQ=255) cGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCGCATCCACCAgc < 3:94971/149‑1 (MQ=255) gTTGATGCGCGCCAGTCGTTCATGCAGTTTTTCTAATTCGCCTGCGAAGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTCACTGTGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCGCATCCACCcgcg > 2:43225/1‑149 (MQ=255) gTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCGCATCCACCAgcg > 3:3555/1‑149 (MQ=255) gTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCGCATCCACCAgcg > 6:234290/1‑149 (MQ=255) gTTAATGCGCGCCAGGCGTTAATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTGTTGGGCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCGCATCCACCAgc < 6:5254/148‑1 (MQ=255) ttGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCGCATCCACCAgcg > 3:187829/1‑148 (MQ=255) aTGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCGCATCCACCAGCGCAAt > 7:338085/1‑149 (MQ=255) aTGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGGCGGTTTTGGGCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCGCATCCACCAGCGCaa < 3:291856/148‑1 (MQ=255) tGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCGCATCCACCAGCGCAATc < 4:3555/149‑1 (MQ=255) tGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCGCATCCACCAGCGCAATc > 6:126847/1‑149 (MQ=255) tGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGAGGTCGTAGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCGCATCCACCAGCGCAATc < 4:146503/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCGCATCCACCAGCGCAATCACg < 2:184623/149‑1 (MQ=255) gcCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCGCATCCACCAGCGCAATCACGcc > 2:192365/1‑149 (MQ=255) | CGTTTTGTTTATCTGCGATAAAGTGGAAACGCGGTTTGGTGCTGACGACGTTTTCTTCCAGCATAAAACCGTTGGTGTTGAACAGCAGGCCCAGATCGATGTCGCCGTGGGTGACGGTGTAGACCGGTGCGCGGGCGTTGATGCGCGCCAGGCGTTCATGCAGTTTTTCTGCTTCGCCTGCGACGTCGGTTTTGGTCAGCAGAATGCGGTCGGCGTAGCCAACCTGTGACTGGGCGATGGTGAACTGGTTCATCTGCTCATCGGCATGTACCGCATCCACCAGCGCAATCACGCCGT > NC_000913/4588199‑4588495 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |