New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1893763 | 120 (1.240) | 5 (0.050) | 5/262 | 9.3 | 4.2% | intergenic (+52/‑370) | yoaB/yoaC | putative reactive intermediate deaminase/DUF1889 family protein |
? | NC_000913 | = 1893776 | 117 (1.280) | intergenic (+65/‑357) | yoaB/yoaC | putative reactive intermediate deaminase/DUF1889 family protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
ATGCGCCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGATTAGCAACTCTGGTTTTCTTT > NC_000913/1893629‑1893924 | aTGCGCCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAAt < 4:309355/148‑1 (MQ=255) aTGCGCCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATc < 5:264053/149‑1 (MQ=255) tGCGCCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCAGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATAATGGTCGTTGTTACATAAATc > 5:178747/1‑148 (MQ=255) cgcCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCGGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGGCGGTTTTACATAAATCGa < 6:7960/148‑1 (MQ=255) gcTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATa < 6:134622/149‑1 (MQ=255) cACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGat < 1:176222/149‑1 (MQ=255) cACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGa > 1:288351/1‑148 (MQ=255) aCGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGata < 8:57616/149‑1 (MQ=255) ggTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGGCGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGatat > 1:425184/1‑148 (MQ=255) ggTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGatat > 5:122669/1‑148 (MQ=255) aaGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGt > 8:30728/1‑149 (MQ=255) aGCGGGTGTGATGAACACGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCTGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTAAGACGATAATTTATCGATAATACTGTTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGtt < 6:178747/149‑1 (MQ=255) cGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAATTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGa < 1:328856/149‑1 (MQ=255) cGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGa < 1:11483/149‑1 (MQ=255) cGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGa < 5:148140/149‑1 (MQ=255) cGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCGTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGa < 6:28470/149‑1 (MQ=255) ggTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATg < 7:189455/149‑1 (MQ=255) tgatgaACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTc > 1:29393/1‑149 (MQ=255) atgaACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTg < 6:122669/149‑1 (MQ=255) tgaACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGc > 3:69823/1‑149 (MQ=255) gaACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGc > 7:252938/1‑148 (MQ=255) ccGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAAtt > 5:105067/1‑149 (MQ=255) gAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCa < 3:270191/149‑1 (MQ=255) aaGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGa > 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aaGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGATGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCAttattta < 8:18981/148‑1 (MQ=255) gTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATtatttatat > 8:259381/1‑149 (MQ=255) gAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAAt < 5:283320/104‑1 (MQ=255) aTTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGa > 4:11966/1‑117 (MQ=255) aTTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATaa > 3:221347/1‑149 (MQ=255) aGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTc < 4:221347/149‑1 (MQ=255) gATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTc > 4:12862/1‑148 (MQ=255) ttGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGata > 5:268037/1‑100 (MQ=255) ttGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGata < 6:268037/100‑1 (MQ=255) ttGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAAt < 1:384688/149‑1 (MQ=255) tgGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAAttt < 7:47642/148‑1 (MQ=255) gCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCattat < 4:43440/125‑1 (MQ=255) gCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTa < 7:30728/148‑1 (MQ=255) cTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATc < 6:258820/149‑1 (MQ=255) tGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATc > 5:148286/1‑148 (MQ=255) cGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATc < 6:148286/146‑1 (MQ=255) tgtAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATaa > 6:141593/1‑148 (MQ=255) 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aGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAataaacataaa < 3:305960/149‑1 (MQ=255) aGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAataaacataaa < 7:79059/149‑1 (MQ=255) aGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAataaacataa < 2:294836/148‑1 (MQ=255) gTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAataaacataaac < 7:259381/149‑1 (MQ=255) gTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAataaacataaac < 1:69296/149‑1 (MQ=255) tCAGACGATAATTTATCGATAATACTTGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAAtaaacataaaca < 4:368004/149‑1 (MQ=255) tCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAaactaa > 6:136873/1‑128 (MQ=255) tCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAAtaaacataaaca < 3:88885/149‑1 (MQ=255) aGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTTATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATaaacataaacat < 4:240324/148‑1 (MQ=255) aGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATg > 4:313668/1‑149 (MQ=255) 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aCTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGAt > 7:176100/1‑149 (MQ=255) gTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGATTAg > 4:239544/1‑148 (MQ=255) gTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGATTAGc < 8:197035/149‑1 (MQ=255) gTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGATTa > 1:384874/1‑143 (MQ=255) gTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGATTa < 2:384874/143‑1 (MQ=255) 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aTCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGATTAGCAACTCTGGTtttctt > 2:239947/1‑149 (MQ=255) tCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGATTAGCAACTCTGGTtttcttt < 2:425184/149‑1 (MQ=255) | ATGCGCCGGTGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGATTAGCAACTCTGGTTTTCTTT > NC_000913/1893629‑1893924 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |