Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 2469008 | 2469812 | 805 | 40 [35] | [34] 42 | [gtrB]–[gtrS] | [gtrB],[gtrS] |
ACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGCACTCTTTTTATTGGTTAGCAAACCAAGCACCATCTTCAAACTTCCATTTGATGATGGTGTGATGTCT > NC_000913/2469544‑2470093 | acTTTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAAt < 2:863194/289‑1 (MQ=255) gTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTTCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTTATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTACTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAg > 1:455175/1‑289 (MQ=255) tGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAAt < 2:571526/194‑1 (MQ=255) tGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAAt > 1:571526/1‑194 (MQ=255) tAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGAT‑AGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGaa > 1:75694/1‑289 (MQ=255) gtgtATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATaaaa > 1:393666/1‑181 (MQ=255) gtgtATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATaaaa < 2:393666/181‑1 (MQ=255) atattatattTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATaaa > 2:727574/1‑289 (MQ=255) aCTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGa > 2:844765/1‑278 (MQ=255) aCTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGa < 1:844765/278‑1 (MQ=255) tattaAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGCACTCTTTTTATTg > 2:541199/1‑289 (MQ=255) aTCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAAc > 2:652070/1‑210 (MQ=255) aTCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAAc < 1:652070/210‑1 (MQ=255) aaTATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGCACTCTTTTTAtt > 1:193549/1‑276 (MQ=255) aaTATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGCACTCTTTTTAtt < 2:193549/276‑1 (MQ=255) ggtgTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGc > 2:681158/1‑255 (MQ=255) ggtgTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGc < 1:681158/255‑1 (MQ=255) ggtgTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGCAct < 2:128315/258‑1 (MQ=255) ggtgTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGCAct > 1:128315/1‑258 (MQ=255) tgcttgctTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAg > 2:209101/1‑40 (MQ=255) cGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGgcgc > 1:301085/1‑178 (MQ=255) cGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGgcgc < 2:301085/178‑1 (MQ=255) cGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGCACTCTTTTTATTGGTTAGCAAACCAAGCACCATCTTCAAACTTCCAtt > 1:679366/1‑289 (MQ=255) tttGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGCACTCTTTTTATTGGTTAGCAAACCAAGCACCATCTTCAAACTTCCATTTGatgatg < 1:541199/289‑1 (MQ=255) gCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACa > 1:27249/1‑177 (MQ=255) gCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACa < 2:27249/177‑1 (MQ=255) aaTATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGAT‑AGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGCACTCTTTTTATTGGTTAGCAAACCAAGCACCATCTTCAAACTTCCATTTGATGATGGTGTGa < 2:75694/289‑1 (MQ=255) tCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTa > 1:80363/1‑123 (MQ=255) tCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTa < 2:80363/123‑1 (MQ=255) ttATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGCACTCTTTTTATTGGTTAGCAAACCAAGCACCATCTTCAAACTTCCATTTGATGATGGTGTGATGtct < 1:727574/289‑1 (MQ=255) aTTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGCAct < 1:2271/223‑1 (MQ=255) aTTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGCAct > 2:2271/1‑223 (MQ=255) ttCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGCACTCTTTTTATTGGTTAGc < 1:755882/238‑1 (MQ=255) ttCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGCACTCTTTTTATTGGTTAGc > 2:755882/1‑238 (MQ=255) aaGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGAc > 1:719585/1‑137 (MQ=255) aaGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGAc < 2:719585/137‑1 (MQ=255) aaGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACat > 1:754630/1‑139 (MQ=255) aaGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACat < 2:754630/139‑1 (MQ=255) aaGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGaa > 2:550767/1‑185 (MQ=255) aaGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGaa < 1:550767/185‑1 (MQ=255) aaGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGCACTCTTTTTATTGGTTAGc < 1:51670/233‑1 (MQ=255) aaGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGCACTCTTTTTATTGGTTAGc > 2:51670/1‑233 (MQ=255) | ACTGTCAATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATTTTTTTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACAAACTAATTATTAAATCTGTAATATGCGTGGTGTGCTTGCTTGCGTCAATATTTGCAATATCTTATTCAAAAGGTGTTGTTGAATTAAATAAGTACCATGCAACATACTTCGGTAGTTATCTTTATATGAAAAACAACGGGTATAAAATGCCATCGTATGTTGATGATAAGTGTGTTGGGTTAGATGCCTGGGGTAATAAATTCGACATATCATTTGGCGCAACCCCAACAGAAGTTGGAACGGAATGTTTCGAATCTCATAAAGATGAAACGTTTTCGAATGCACTCTTTTTATTGGTTAGCAAACCAAGCACCATCTTCAAACTTCCATTTGATGATGGTGTGATGTCT > NC_000913/2469544‑2470093 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |