| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP034943 | 607713 = | 224 (1.000) | 11 (0.050) | 6/260 | 9.1 | 4.6% | coding (556/1125 nt) | EO946_RS03185 | collagen‑like protein |
| ? | NZ_CP034943 | = 607721 | 238 (1.100) | coding (564/1125 nt) | EO946_RS03185 | collagen‑like protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GTGGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP034943/607855‑607713‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctccTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGT < NZ_CP034943/607721‑607584 GTGGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGCCGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGC > 1:2655396/1‑140 TGGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCGCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT > 2:3365612/1‑140 TGGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT > 1:2355336/1‑140 TGGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT > 2:3436057/1‑140 TGGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT < 2:1600753/140‑1 GGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTCGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGTCGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGGTGGTCCGGGGTCCCCGGTAGCGGCTGTCGCTC > 1:411085/1‑140 GGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTC > 1:3136938/1‑140 TGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGGCGCTCCGGCTG > 1:2066797/1‑140 CGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTC > 1:208889/1‑140 CCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT > 2:3227713/1‑108 CCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT < 1:3227713/108‑1 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTggt < 1:1134174/83‑4 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTggt > 2:1134174/1‑80 CCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTC < 1:1611607/42‑1 CCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTC > 2:1611607/1‑42 CCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCGGC > 2:1740666/1‑50 ccgGTCGCTCCTGTCGCTGCGGCTGGTCCGGGGTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGGTGGTCCGGCGTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGC < 2:1593229/137‑1 ccgGTCGCTCCGGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCAGCCGCGGTAGCTCCTGTCGCTGCGTGTGGTCCGGTTTCCCCGGTCGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGC < 1:2867370/137‑1 CCTGTTGCTCCTGTGGCGCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGTTCGCTCCGGGCGCTCCGGTGGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGC < 2:2572137/140‑1 CCTGTCGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGT > 1:3209342/1‑41 GCTCCTGGGGGTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCGGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCGTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCC < 2:2218397/140‑1 CTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGC < 1:3226584/37‑1 CTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGC > 2:3226584/1‑37 CTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAG < 2:62848/36‑1 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGT < 2:2642489/140‑1 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGGAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTGGCTCCGGCTGGTCCGGCTGCCCCAGT > 1:2759921/1‑140 GTGGCTCCCGTGGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP034943/607855‑607713‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctccTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGT < NZ_CP034943/607721‑607584 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |