Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | ACB122 | 5,921,203 | G→A | 8.2% | L168L (CTG→TTG) | CJ019_05543 ← | putative binding protein component of ABC iron transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB122 | 5,921,203 | 0 | G | A | 8.2% | 227.8 / 6.5 | 73 | L168L (CTG→TTG) | CJ019_05543 | putative binding protein component of ABC iron transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/35); new base A (3/3); total (35/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CATTGCCCGGCCTCGATGGCCTGGATCACCGCGTTGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGC > ACB122/5921070‑5921334 | cttggCCCGGCGTCGATGGCCGGGATCACCGCGTTGTCGGGGGTGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCGCCGGCTTGGCCTCACCTGGGGTTTCGAGCAGGGTGGCGGGCAGc < 4:58496/131‑1 (MQ=255) catTGCCCGGCCTCGATGGCCTGGATCACCGCGTTGTCGGCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGc < 7:167405/135‑1 (MQ=255) catTGCCCGGCCTCGATGGCCTGGAGCCCCGCGTTGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGc < 4:289472/135‑1 (MQ=255) tGCCCGGCCTCGATGGCCTGGATCACCGCGTTGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGAc < 6:156189/135‑1 (MQ=255) tGCCCGGCCTCGATGGCCTGGATCACCGCGTTGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTGTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCgcc > 2:339646/1‑133 (MQ=255) ccGGCCTCGATGGCCTGGATCACCGCGTTGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTgg > 4:199442/1‑135 (MQ=255) gCCTCGATGGCCTGGATCACCGCGTTGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTg < 8:24709/135‑1 (MQ=255) gCCTCGATGGCCTGGATCACCGCGTTGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTg < 3:424392/135‑1 (MQ=255) gCCTCGATGGCCTGGATCACCGCGTTGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTg < 2:104264/135‑1 (MQ=255) gCCTCGATGGCCTGGATCACCGCGTTGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGGTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTg > 7:320086/1‑135 (MQ=255) gCCTCGATGGCCTGGATCACCGCGTTGTCGTCGGAGAACACATCGGGGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTg < 8:155275/135‑1 (MQ=255) gCCTCGATGGCCTGGATCACCGCGTTGTCGGCGGAGAACACATCGGTGGACTGGTTGTTGACCCACCCTTTGACTATTTGGTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGTTCAGCGACTGGTTg < 4:330329/135‑1 (MQ=255) gCCTCGATGGCCTGGAGCACCGCGTTGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCCCCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTg < 2:458798/135‑1 (MQ=255) gCCTCGATGGCCGGGATCACCGCGTTGTCGGCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTg < 2:393838/135‑1 (MQ=255) cTCGATGGCCTGGATCCCCGCGTTGTCGGCGGAGAACACCTCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGAGTGGCTAGGTCTTGGCCTCCCCGGGGGTTTCGCGCAGGGGGGCGGTCAGCGCCGGGTTgga > 2:124831/1‑133 (MQ=255) cTCGATGGCCTGGATCACCGCGTTGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTa > 5:33045/1‑135 (MQ=255) cGATGGCCTGGATCACCGCGTTGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTaca > 2:203229/1‑135 (MQ=255) gATCACCGCGTTGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACACACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGTTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGc > 6:278459/1‑135 (MQ=255) cgTTGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCg < 1:390905/105‑1 (MQ=255) cgTTGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCg > 2:390905/1‑105 (MQ=255) cgTTGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCa > 1:434185/1‑135 (MQ=255) gTTGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACACTCCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGAGCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTGCTTGGCGGTgcgcgg > 1:92222/1‑133 (MQ=255) tGTCGTCGGAGAACACATCGGTTGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAACGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCAGTGCGCAGGc > 1:277850/1‑135 (MQ=255) tGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAACGACTGGTTGTAGACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGc > 1:284901/1‑135 (MQ=255) tGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTGTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAACGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGc > 1:277851/1‑135 (MQ=255) tcgtcgGAGAACACATCGGGGGACAGGTTGGTGACCCACACTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGca < 6:431043/134‑1 (MQ=255) cgtcgGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGcaca < 1:287706/135‑1 (MQ=255) cgtcgGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGGGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGcaca < 5:134811/135‑1 (MQ=255) cgGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGAc < 8:320086/135‑1 (MQ=255) cgGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGAc < 5:455045/135‑1 (MQ=255) gTGGTCAGGTTGTTGACCCACGCTTTGAGGATTTGCTCGGTGTTGGTCTCTCGGTGGGTGTGGTTCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTGTTGGCCGTGGGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGt < 3:131348/135‑1 (MQ=255) aGGTTCATGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACAGGTTGTACACATACTAGGACGTGAGCAGGCACAGACGGCATTCCCACTGTAAGTCa > 2:376741/1‑135 (MQ=255) ttgttgACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGc < 2:434185/134‑1 (MQ=255) gttgACCCGCCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAg > 7:76480/1‑135 (MQ=255) gttgACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAg > 3:224012/1‑135 (MQ=255) gttgACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAg > 4:181802/1‑135 (MQ=255) ccacccTTTGACGATTTGCTCGTTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACACACGGCCTTCCCACTGTTTGACAGCCAGGCCTTc > 2:147744/1‑135 (MQ=255) tttGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGt > 4:344044/1‑135 (MQ=255) gCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAAct < 3:327998/132‑1 (MQ=255) gCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAAct > 4:327998/1‑132 (MQ=255) gCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGAACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAActcct > 4:253187/1‑135 (MQ=255) gTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGt < 6:184682/135‑1 (MQ=255) gCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGAc < 7:453793/134‑1 (MQ=255) ccTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGAccc < 3:199442/135‑1 (MQ=255) ccTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAACGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGTGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGAccc < 2:277850/135‑1 (MQ=255) ccTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAACGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGAccc < 2:284901/135‑1 (MQ=255) ccTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAACGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGAccc < 2:277851/135‑1 (MQ=255) ccGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCg < 5:399607/135‑1 (MQ=255) gTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGCCGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGt > 4:233187/1‑135 (MQ=255) gTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGCCCCGCTCGGt > 6:415175/1‑135 (MQ=255) gTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCt > 7:51538/1‑131 (MQ=255) gTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCt < 8:51538/131‑1 (MQ=255) gTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGt < 4:375113/135‑1 (MQ=255) gTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGt > 8:50812/1‑135 (MQ=255) gTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGt > 1:51877/1‑135 (MQ=255) gTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGt > 2:248402/1‑135 (MQ=255) gTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGt > 3:336222/1‑135 (MQ=255) gTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGt > 3:38096/1‑135 (MQ=255) gTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCAGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTTCTAAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGt > 8:432494/1‑135 (MQ=255) gTGGGTTTCGAGCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGt < 4:375115/135‑1 (MQ=255) tttCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGa > 8:1039/1‑133 (MQ=255) gATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGGTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAga < 4:244463/134‑1 (MQ=255) aTCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGACAGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAgatg > 6:79376/1‑135 (MQ=255) tCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGttt < 4:150190/112‑1 (MQ=255) tCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGttt > 3:150190/1‑112 (MQ=255) ggCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCg > 4:295789/1‑135 (MQ=255) gggcAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGgc < 1:197747/132‑1 (MQ=255) ggTCTGCGAGTGTTTGTACAGGTTGTGGGGGGTGCGAGGGCACAGACGGCGTTCCCAGTGTTTGTCAGCCTGGGATGCGTTGTTGCTAAAGTGGTCGGGTTTGCCGCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGgc < 2:218205/135‑1 (MQ=255) ggTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGgc < 1:324704/135‑1 (MQ=255) ggTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCGCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGgc < 2:345325/135‑1 (MQ=255) gTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTTGATGATGGTGCGGgcg < 1:339646/135‑1 (MQ=255) tCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGgcgc > 8:328960/1‑135 (MQ=255) cAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTATGTGCTCAACTCCTCTGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGggcgggcg < 2:118207/133‑1 (MQ=255) | CATTGCCCGGCCTCGATGGCCTGGATCACCGCGTTGTCGTCGGAGAACACATCGGTGGACAGGTTGTTGACCCACCCTTTGACGATTTGCTCGGTCTTGGCCTCACCGTGGGTTTCGATCAGGGTGGCGGTCAGCGACTGGTTGTACACCTTCTTGGCCGTGCGCAGGCACAGACGGCCTTCCCACTGTTTGTCAGCCAGGGCTTCGTAGGTGCTCAACTCCTCGGGTTTGACCCGCTCGGTGGAGTAGATGATGGTGCGGGCGC > ACB122/5921070‑5921334 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |