Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | ACB122 | 907,674 | G→A | 8.0% | A445A (GCG→GCA) | fruA → | PTS system fructose‑specific EIIB'BC component |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB122 | 907,674 | 0 | G | A | 8.0% | 152.5 / 4.0 | 50 | A445A (GCG→GCA) | fruA | PTS system fructose‑specific EIIB'BC component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (24/21); new base A (2/2); total (27/23) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.44e-01 |
ACCAATGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTC > ACB122/907543‑907802 | accaATGCCATCCTGCTGGGGCTGTGGCTGGGCGGCATGATGTGCGGCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGGGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGAcc < 4:76971/135‑1 (MQ=255) aaTGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATg > 4:129797/1‑135 (MQ=255) aaTGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATg > 7:286491/1‑135 (MQ=255) aaTCCCATACAGCTGGGGCAGTTGCTGGGCGGCATGATCTCCTACGACCATGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATCCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCCTCTAGCTACGCGACAATGGCGCCAACCAtt > 4:77050/1‑134 (MQ=255) tGCCAACCTGCGGGGGCTGGTGCTGGGCGGCATGATGTCCGTCGACCGTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGGGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGgc < 1:234940/135‑1 (MQ=255) cATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGACTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGgccgc > 8:152453/1‑135 (MQ=255) ctgctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGc > 3:292848/1‑135 (MQ=255) ctgctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGc > 7:158602/1‑135 (MQ=255) ctgctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGc > 3:209933/1‑135 (MQ=255) tgctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCGGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCa > 8:238158/1‑135 (MQ=255) ctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATg > 4:55772/1‑135 (MQ=255) gggCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTAGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCAACCATGGCCGCCGGCATCGTg > 2:58398/1‑135 (MQ=255) tGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTGCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTgccgc < 4:149139/135‑1 (MQ=255) tGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGGCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTgccgc < 3:242062/135‑1 (MQ=255) tGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGGCGACCTGGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGGGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTgccgc < 8:231081/135‑1 (MQ=255) cATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTgg > 1:6159/1‑134 (MQ=255) tgatgTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTa > 3:235931/1‑135 (MQ=255) tgatgTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTa > 4:285934/1‑135 (MQ=255) tgtgCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTg < 4:209933/135‑1 (MQ=255) gACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTc > 6:239845/1‑135 (MQ=255) cTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGGCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGTATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTg < 5:101230/135‑1 (MQ=255) gCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGccc > 8:119671/1‑135 (MQ=255) ccGTTCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGGGGGGCTGCTGGCCGCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCATCCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGgcgc < 3:77050/135‑1 (MQ=255) acaaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTc < 2:184460/134‑1 (MQ=255) cTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGATCTACGCGCCAATTGCGGCTACCATGGACGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCAACCTTCATGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagaga > 8:145647/1‑135 (MQ=255) cTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagcga > 1:131522/1‑135 (MQ=255) aTGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagcgagc > 5:186322/1‑135 (MQ=255) aTGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagcgagc > 1:163292/1‑135 (MQ=255) tcGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCg < 8:158602/135‑1 (MQ=255) ggTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGTCGACCATGGCCGCCGGCAAGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTACGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCgg > 7:19456/1‑134 (MQ=255) ggTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCgg > 8:280020/1‑134 (MQ=255) gTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCggg > 7:256495/1‑134 (MQ=255) ggggCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCaa > 1:7454/1‑135 (MQ=255) ctgctgGCCGCGGCGAGCAACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAggcg < 5:49948/135‑1 (MQ=255) gctgGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTGGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAggcggc < 8:99229/135‑1 (MQ=255) tgGCCTGGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGATTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGAAAggcggc < 8:213679/133‑1 (MQ=255) gCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCggcgctg > 7:284629/1‑135 (MQ=255) ccTCGGCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCggcgctgg < 8:166185/135‑1 (MQ=255) tcgAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGgcgctggcgctg < 4:268382/135‑1 (MQ=255) tcgAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGgcgctggcgctg < 8:284629/135‑1 (MQ=255) tcgAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGgcgctggcgctg < 2:241970/135‑1 (MQ=255) tcgAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGgcgctggcgctg > 3:80145/1‑135 (MQ=255) tcgAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGgcgctggcgctg < 4:273053/135‑1 (MQ=255) gAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTggg > 2:197222/1‑135 (MQ=255) cgcaccgcgCCAAGGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTgggg < 2:131522/130‑1 (MQ=255) cTACGCGCCAAGGCCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTGCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCt < 3:22294/135‑1 (MQ=255) cgcgCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCtgtg > 1:190997/1‑135 (MQ=255) gcgcGATTGGCGGCGACCAGGGCCGCCGGCTTGGTGCCGGCGATTGGCGTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCTAGTTCGCCCAGAGGGAGCGGGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGc < 7:152453/135‑1 (MQ=255) gcgcCACTGGCGGCAACCATGGCCGCCGGCATGGGGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCtgt < 1:58398/133‑1 (MQ=255) gcgcCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTGGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCtgtg < 8:37418/134‑1 (MQ=255) cggcgACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCAtctc > 2:53678/1‑133 (MQ=255) | ACCAATGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATGGCGGCGACCATGGCCGCCGGCATGGTGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTC > ACB122/907543‑907802 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |