Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | ACB122 | 65,165 | G→A | 6.0% | N31N (AAC→AAT) | CJ019_00068 ← | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB122 | 65,165 | 0 | G | A | 6.0% | 225.2 / 2.1 | 68 | N31N (AAC→AAT) | CJ019_00068 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/27); new base A (2/2); total (39/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CCGTCTTCCCACGCTTTGCGCGCCGCCGCCAGCTCGCCCTGCAGCTGATAGGCCTTACCCAGCAGCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTAGAAGAAACTCAAGCCGACGTGGAACAGC > ACB122/65031‑65299 | ccGTCTTCCCACGCTTTGCGCGCCGCCGCCAGCTCGCCCTGCAGCTGATAGGCCTTACCCAGCAGCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCg > 2:121482/1‑135 (MQ=255) cTTTGCGCGCCGCCGCCAGCTCGCCCTGCAGCTGATAGGCCTTACCCAGCAGCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATcca < 8:90606/135‑1 (MQ=255) cTTTGCGCGCCGCCGCCAGCTCGCCCTGCAGCTGATAGGCCTTACCCAGCAGCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATcca < 4:261423/135‑1 (MQ=255) cgccgccAGCTCGCCCTGCAGCTGATAGGCCTTACCCAGCAGCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGTTCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCtt < 1:87903/135‑1 (MQ=255) aGCTCGCCCTGCAGCTGATAGGCCTTACCCAGCAGCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAgg < 7:280680/135‑1 (MQ=255) aGCTCGCCCTGCAGCTGATAGGCCTTACCCAGCAGCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAgg < 6:64609/135‑1 (MQ=255) tCGCCCTGCAGCTGATAGGCCTTACCCAGCAGCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGTACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCa < 5:254927/135‑1 (MQ=255) aGCTGATAGGCCTTACCCAGCAGCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTca < 3:274656/133‑1 (MQ=255) aGCTGATAGGCCTTACCCAGCAGCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTca < 8:203984/133‑1 (MQ=255) aGCTGATAGGCCTTACCCAGCAGCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTca < 6:244384/133‑1 (MQ=255) tGATAGGCCTTACCCAGCAGCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCagcagc < 3:14819/135‑1 (MQ=255) ggCCTTACCCAGCAGCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCCGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCCGCAGCGGGtt > 5:144531/1‑135 (MQ=255) ggCCTTACCCAGCAGCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCTAACCTca < 5:179954/125‑1 (MQ=255) ggCCTTACCCAGCAGCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTca > 6:179954/1‑125 (MQ=255) tACCCAGCAGCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCca > 2:51008/1‑135 (MQ=255) cacagcagCTTCCATGCTGCCGACTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCAGTTGGCTTCATCAAGACAGTCCTTGCCCATGCAATACCTCAGCAGAGGGTTATGcaaa > 5:19023/3‑133 (MQ=255) ccAGCAGCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTCCCTTCCTCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCcacaa > 2:18811/1‑134 (MQ=255) cagcagCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCAcccc > 7:255445/1‑135 (MQ=255) cagcagCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACAcc > 8:3767/1‑135 (MQ=255) gcTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTgg < 1:121482/135‑1 (MQ=255) cTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTgg > 7:250189/1‑134 (MQ=255) cTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGc > 1:115957/1‑135 (MQ=255) ttCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTATACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGcc < 3:277323/135‑1 (MQ=255) aTGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCGTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCACACCTCAGCAGCGGGTTATCCACCCCTTTGGCCAGCa > 5:133215/1‑135 (MQ=255) gAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCAtcttct > 4:43679/1‑133 (MQ=255) ttCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGAt > 5:72495/1‑135 (MQ=255) aTCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTcgc > 8:36599/1‑134 (MQ=255) tCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCgcgc < 2:31020/135‑1 (MQ=255) agctACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGct < 1:292500/133‑1 (MQ=255) tctACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGctc > 4:37092/1‑135 (MQ=255) aGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTtctc > 1:199287/1‑135 (MQ=255) tGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCATTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTag < 1:192488/135‑1 (MQ=255) tGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCATTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTag < 1:188190/135‑1 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATcca < 6:195794/40‑1 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATcca > 5:195794/1‑40 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCa > 6:131439/1‑55 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCa > 6:255737/1‑55 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCa < 5:255737/55‑1 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCa < 5:131439/55‑1 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAgg > 2:74079/1‑57 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAgg < 1:74079/57‑1 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTca < 8:177170/67‑1 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTca > 7:177170/1‑67 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGtt > 3:38318/1‑77 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGtt < 4:38318/77‑1 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTa > 3:165786/1‑133 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTa > 3:275411/1‑133 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTa > 7:2161/1‑133 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTa > 2:168017/1‑133 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTa > 5:128057/1‑133 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTa > 5:61687/1‑133 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCCTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTATGCCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATTCTCTTTTCTCCTa > 8:80673/1‑133 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCATTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTa > 2:192488/1‑133 (MQ=255) gCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCATTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTa > 2:188190/1‑133 (MQ=255) aGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCCGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTGATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTagaag > 4:26522/1‑134 (MQ=255) aGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTagaat > 8:103230/1‑133 (MQ=255) aGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTagaag > 8:191897/1‑134 (MQ=255) aGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTagaag > 7:104920/1‑134 (MQ=255) aGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCGTCTCCCGCGATTCGCGCCTGCTGGTTTGTCCTagaact > 2:292500/1‑133 (MQ=255) ccGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCCCACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTAGAAGAAACTCaa > 2:33821/1‑135 (MQ=255) ctTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTAgaagaa < 7:193854/123‑1 (MQ=255) ctTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTAgaagaa > 8:193854/1‑123 (MQ=255) ttCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTAGAAGAAACTCAAGCCGa < 3:212643/133‑1 (MQ=255) tCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTAGAAGAAACTCAAGCCGACGt < 2:115957/135‑1 (MQ=255) cAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTAGAAGAAACTCAAGCCGACGt > 3:91249/1‑134 (MQ=255) gcgcCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTAGAAGAAACTCAAGCCGACGTgg < 6:288764/134‑1 (MQ=255) gcgcCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTAGAAGAAACTCAAGCCGACGTgg < 2:199287/134‑1 (MQ=255) cgcCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTAGAAGAAACTCAAGCCGACGTGGaa < 7:3767/135‑1 (MQ=255) ccGTTGCCGTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACCCCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCGTTTCTCCGAGAAGAAACTCAAGCCGACGAGGAAcc > 6:91247/1‑134 (MQ=255) gTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTAGAAGAAACTCAAGCCGACGTGGAACAGc < 3:202837/135‑1 (MQ=255) | CCGTCTTCCCACGCTTTGCGCGCCGCCGCCAGCTCGCCCTGCAGCTGATAGGCCTTACCCAGCAGCTTCCATGCTGCCGAGTATTTCGGATCCTGCTCTACACAGCGTGCCAGGTGCACCGCTGCTTCAGCGCCGTTGCCTTCATCCAGCCAGGCCTTGCCCAGGCCAAACCTCAGCAGCGGGTTATCCACACCTTTGGCCAGCATCTTCTCCAGCGATTCGCGCATGCTCTTTTCTCCTAGAAGAAACTCAAGCCGACGTGGAACAGC > ACB122/65031‑65299 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |