Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB143 | 2,076,865 | 0 | T | G | 37.9% | 67.2 / 10.5 | 66 | G154G (GGT→GGG) | CJ019_01978 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (23/18); new base G (0/25); total (23/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.33e-07 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
CGGTGTGGAACGTGGTGCGGATGTTCATGAAGGTGTCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTCACGCTGGTGACCTATGGCGTGCACCACA > ACB143/2076738‑2076995 | cGGTGTGGAACGTGGTGCGGATGTTCATGAAGGTGTCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGGTCGGGCTGGGTGGGGCCg > 1:183713/1‑135 (MQ=255) ggTGTGGAACGTGGTGCGGATGTTCATGAAGGTGTCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTg > 4:342982/1‑136 (MQ=255) tgtgGAACGGGGTGCGGATGTTCATGACGGTGGCGCCGCCGAGTGCCGCGCTGCGTCATGCCTGGCGGTGGCTGGGTGGGCGGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGt < 3:95942/136‑1 (MQ=255) ggggAACGTGGTGCGGATGTTCATGACGGGGTCGCCGCCGCGGGCCGAGCTGCGTCAGGCCGGGCGGTGGCTGGGGGGGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTGCGGGGGGGGGGGGGCCGTGGt < 5:334578/133‑1 (MQ=255) ggggAACGTGGGCGGGATTTTCATGAAGGGGTCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTGGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGGGGGTGGGGCCGTGGt < 2:163799/133‑1 (MQ=255) atcGTGGTGCGGATGTTCATGAAGGTGTCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGACGGCACGATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGcc > 2:376213/3‑135 (MQ=255) aaCGTGGTGCGGATGTTCATGAAGGTGTCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGcc > 7:141375/1‑135 (MQ=255) aaCGTGGTGCGGATGTTCATGAAGGTGTCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCa > 4:186672/1‑136 (MQ=255) aCGTGGTGCGGATGTACATGAAGGGGTCGCCGCCGAGTGCCGAGCGGCGTCATGCCGGCCCGGGGCTGGGGGGGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACAATGGGCGGCTTTTTCGGGGGGGGGGGGGCCGGGGTAGCCa < 7:133118/135‑1 (MQ=255) aCGTGGTGCGGAGGTTCATGAAGGGGGCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGGGGGGGGGGCCGTGGTAGCCa < 6:225253/135‑1 (MQ=255) aCGGGGTGCGGATGTTCATGAAGGTGTCGCCGCCGCGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGGGGCGGGGGGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGGGGGGCCGTGGTAGCCa < 8:187068/135‑1 (MQ=255) cggggggCGGATGGGCATGAAGGGGCCGCCGCCGAGGGCCGAGCTGCGCCATGCGGGGCGGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGGGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCa < 8:87679/128‑1 (MQ=255) ggtgCGGATGTTCATGAAGGTGTCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGGGGGGCCGTGGTAGCCACGcc < 2:132922/135‑1 (MQ=255) gCGGATGTTCATGAAGGTGTCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCCCGCCGAt > 8:309123/1‑135 (MQ=255) gCGGATGTTCATGAAGGTGTCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATc > 4:165366/1‑136 (MQ=255) gCGGATGTTCATGAAGGTGTCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATc > 4:400771/1‑136 (MQ=255) ggATGTTCATGAAGGTGTCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATcc > 8:128060/1‑135 (MQ=255) ggATGTTCATGAAGGTGTCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATcc > 7:268812/1‑135 (MQ=255) ggtCATGATGGTGGCCCCGCCGAGTGCCGAGCTGCTTCATGGCTGGCGGTGGCGGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGGGGCTTGTTGGTGGTGGGGGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGAc < 8:349205/133‑1 (MQ=255) ttCATGAAGGTGTCGCGGCCGTGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCGGTGGCTGGGGGGGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTGGGGGGGGGGGGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGAc < 6:349506/134‑1 (MQ=255) tCATGAAGGTGTCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGAcc < 2:233682/134‑1 (MQ=255) gAAGGTGTCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAgtgt > 1:20502/1‑135 (MQ=255) gAAGGTGTCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGACACGCCCATCCTGAACAgtgt > 6:109410/1‑135 (MQ=255) gAAGGTGTCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTCTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTAGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGCTCCTGACCActgt > 2:326630/1‑135 (MQ=255) gAAGGTGGCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGGGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAgtgt < 1:51039/135‑1 (MQ=255) tgtCGCCGCGGAGTGCCGCGCTGCGTCATGCGTGGCGGTGGCTGGGTGTGGTGGGCAGCTTTGCGGGCACCATGGGCGGGTTGTTCGGGGTGGGGGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTg < 5:117427/135‑1 (MQ=255) tgtCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCGTGGCCGTGGCTGGGTGTGCGGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTGCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTgg < 4:268779/136‑1 (MQ=255) gtCGCCGCCTAGTGCCGAGGTGCGTCATGCGTGGCGGTTGCGGGGGGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCTTGGGCGGGTTGTTGGGGGTGGGGGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTgg < 8:156696/135‑1 (MQ=255) gccgAGTGCGGAGATGGGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGGAGCTTTGCCGGCACCATGGGGGGCTTGTTCGGGGTGGGGGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTAc < 6:33904/135‑1 (MQ=255) ccgAGTGCCGTGCGGCGTCATGCCTGGCGGGGGCTGGGTGGGCTGGGCAGCTTGGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACt < 7:136208/135‑1 (MQ=255) aGTGCCGAGCGGCGTCATGCCTGGCGGTGGCGGGGTGTGCTGGGCTGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTGGGGGGGGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAgg < 4:201936/136‑1 (MQ=255) gTGCCGAGCGGCGTCATGCCTGGCCGTGGCGGGGTGTGCGGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTGCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAgg < 7:17008/135‑1 (MQ=255) tCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGGGGGGGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAggg < 5:343620/135‑1 (MQ=255) cTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTc > 8:211625/1‑135 (MQ=255) cGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCActggc > 3:169474/1‑136 (MQ=255) cGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCActggc > 4:7805/1‑136 (MQ=255) cGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCActgg > 7:300730/1‑135 (MQ=255) gcggggTGTGCGGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTGGGGGGGGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCActggcgct < 5:369290/132‑1 (MQ=255) cgggggGTGCTGGGCAGCTGTGCCGGCACCAGGGGCGGCTTGTTCGGGGGGGGGGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGGTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCActggcgctg < 5:162827/133‑1 (MQ=255) gggTGTGCTGGGCTGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTGGGGGTGGGGGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCActggcgctggcg < 3:124491/136‑1 (MQ=255) tgggCTGGGCAGCGTTGCGGGCACCAGGGGCGGCTTGTGCGGGGGGGGGGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTggcggc < 8:194402/132‑1 (MQ=255) gtggggggCAGCTTTGCCGGCTCCAGGGGCGTCTTGTTCGGGGGGGGGGGGGCGGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTTGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCTCTGGCGCTGGCGgcgc < 3:372689/131‑1 (MQ=255) gtgCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGgcggcg > 5:109224/1‑135 (MQ=255) gCTGGGCATCTTTGCCGGCACCATGGGCGGGTGGTTCGGGGGGGGGGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGcc < 3:262384/135‑1 (MQ=255) ggCAGCTTTGCGGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGGGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAg < 4:316990/134‑1 (MQ=255) tGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTgg > 8:231678/1‑134 (MQ=255) tGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTgg > 7:357310/1‑134 (MQ=255) gCCGGCCCCATGGGCGGGTTGGTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGGCCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTgg < 8:131551/133‑1 (MQ=255) gCCGGCACAATGGGCGGCGTGGTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTgg < 7:302762/133‑1 (MQ=255) ccGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGGGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTc < 8:151698/134‑1 (MQ=255) cGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGGGGGGGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTCACg < 3:129345/136‑1 (MQ=255) cGGCACCATGGGCGGCTTGTGCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTCACg < 3:284313/136‑1 (MQ=255) ggCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTCACg < 2:20502/135‑1 (MQ=255) ggCACCATGGGCGGCTGGTGCGGGGGGGGGGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTCACg < 6:198173/135‑1 (MQ=255) ggCACCATGGGCGGATTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTCACg < 8:294798/135‑1 (MQ=255) ggCACCAGGGGCGGCGGGTGCGGGGGGGGGGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTCACg < 1:161768/135‑1 (MQ=255) tGGGCGGCTTGTTCGGGGGGGGGGGGGCGGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGGGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTCACGCTGGTGa < 7:225657/135‑1 (MQ=255) ggggggGTTGTTCGGGGGGGGGGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTCACGCTGGTGa < 4:381507/134‑1 (MQ=255) ggcgtcTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCAACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTCACGCTGGTGACCt > 4:333721/1‑136 (MQ=255) gcggcTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTCACGCTGGTGACCt > 7:107697/1‑135 (MQ=255) ttGTTCGGGGTGGGGGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTCACGCTGGTGACCTATGGc < 7:276833/135‑1 (MQ=255) ttGTGCGGGGGGGGGGGGGCCGGGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTCACGCTGGTGACCTATGGc < 5:188448/135‑1 (MQ=255) gTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTCACGCTGGTGACCTATGGCGt > 8:2772/1‑135 (MQ=255) cGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTCACGCTGGTGACCTATGGCGTGca < 3:176221/135‑1 (MQ=255) ggggggggTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTCACGCTGGTGACCTATGGCGTGca < 7:30389/134‑1 (MQ=255) ggggTGGGGGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGGGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTCACGCTGGTGACCTATGGCGTGca < 7:86164/134‑1 (MQ=255) ggggtgggGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGGTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTCACGCTGGTGACCTATGGCGTGCACcaca < 1:158259/134‑1 (MQ=255) | CGGTGTGGAACGTGGTGCGGATGTTCATGAAGGTGTCGCCGCCGAGTGCCGAGCTGCGTCATGCCTGGCCGTGGCTGGGTGTGCTGGGCAGCTTTGCCGGCACCATGGGCGGCTTGTTCGGGGTGGGTGGGGCCGTGGTAGCCACGCCGATCCTGACCAGTGTGTTTGGCGCTACTCAGGTGGTGGCGCAGGGGCTGTCACTGGCGCTGGCGGCGCCGAGTACCTTGGTCACGCTGGTGACCTATGGCGTGCACCACA > ACB143/2076738‑2076995 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |