| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | ACB143 | 4,729,452 | C→T | 5.5% | V173M (GTG→ATG) | sdhA_2 ← | Succinate dehydrogenase flavoprotein subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB143 | 4,729,452 | 0 | C | T | 5.5% | 244.0 / 3.5 | 73 | V173M (GTG→ATG) | sdhA_2 | Succinate dehydrogenase flavoprotein subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (20/49); new base T (2/2); total (22/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.08e-01 | |||||||||||
GTTGGTGGTGGACGCGTAGATACGGCCCGCACCGCCAGTGGCCAGCACGGTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCGGCACAGGTACGGGCGGCCTGGCCACCTTTAC > ACB143/4729318‑4729583 | gTTGGTGGTGGACGCGTAGATACGGCCCGCACCGCCAGTGGCCAGCACGGTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCAc > 5:347311/1‑135 (MQ=255)gTTGGTGGTGGACGCGTAGATACGGCCCGCACCGCCAGTGGCCAGCACGGTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCAc > 4:25307/1‑135 (MQ=255)gTTGGTGGTGGACGCGTAGATACGGCCCGCACCGCCAGTGGCCAGCACGGTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCAc > 1:6923/1‑135 (MQ=255)gTTGGTGGTGGACGCGTAGATACGGCCCGCACCGCCAGTGGCCAGCACGGTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGACCTGGTTTTTCAc > 4:258435/1‑135 (MQ=255)gTTGGTGGTGGACGCGTAGATACGGCCCGCACCGCCAGTGGCCAGCACGGTGGCCTAGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCAc > 7:347333/1‑135 (MQ=255) ttggttggGGACGCGTAGATACGGCCCGCACAGCCAGTGGCCAGCACGGTGTCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCa < 5:359351/136‑1 (MQ=255) ttGGTGGTGGACGCGTAGATACGGCCCGCACCGCCAGTGGCCAGCACGGTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCa < 6:649/136‑1 (MQ=255) tggtggACGCGTAGATACGGCCCGCACCGCCAGTGGCCAGCACGGTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGt > 4:214427/1‑135 (MQ=255) gcgTAGATACGGCCCGCACCGCCAGTGGCCAGCACGGTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCgt < 5:76605/136‑1 (MQ=255) gTAGATACGGCCCGCACCGCCAGTGGCCAGCACGGTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCgtag < 2:397817/136‑1 (MQ=255) ggCCCGCACCGCCAGTGGCCAGCACGGTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGtt < 6:211416/136‑1 (MQ=255) cccGCACCGCCAGTGGCCAGCACGGTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGa < 3:306159/136‑1 (MQ=255) ccGCACCGCCAGTGGCCAGCACGGTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGACCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAg < 3:258435/136‑1 (MQ=255) gCACCGCCAGTGGCCAGCACGGTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAgg > 1:329047/1‑135 (MQ=255) gCACCGCCAGTGGCCAGCACGGTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAgg > 4:210133/1‑135 (MQ=255) cGCCAGTGGCCAGCACGGTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGGAGTACTCGTTGAGGAACgt > 6:56513/1‑136 (MQ=255) cAGTGGCCAGCACGGTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACgtggt < 6:183816/136‑1 (MQ=255) aCGGTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCa < 7:51401/136‑1 (MQ=255) ggTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAgg > 7:156440/1‑136 (MQ=255) ggTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAgg > 3:154109/1‑136 (MQ=255) ttgCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGtt < 2:59441/134‑1 (MQ=255) tGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGtt < 4:219451/136‑1 (MQ=255) tGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGtt < 3:376384/136‑1 (MQ=255) tGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGtt < 2:320451/136‑1 (MQ=255) tGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGtt < 1:275217/136‑1 (MQ=255) tGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGtt < 8:159103/136‑1 (MQ=255) tGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTACTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGtt < 8:272075/136‑1 (MQ=255) tGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGGTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGtt < 1:268810/136‑1 (MQ=255) gggCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGtt < 3:259256/135‑1 (MQ=255) gCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGc < 4:380604/136‑1 (MQ=255) gCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGc < 6:374358/136‑1 (MQ=255) ccTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCATCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGcc > 5:3168/1‑136 (MQ=255) ccTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGcc > 8:303064/1‑136 (MQ=255) ccTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGcc > 1:110342/1‑136 (MQ=255) ccTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGGTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCATCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGcc > 5:8126/1‑136 (MQ=255) ggACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTg < 7:297750/135‑1 (MQ=255) gACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTgg < 8:41148/135‑1 (MQ=255) gACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTgg > 2:3848/1‑135 (MQ=255) gACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTgg < 4:259744/135‑1 (MQ=255) gACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGt < 4:363703/136‑1 (MQ=255) cTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTAc < 2:70803/136‑1 (MQ=255) cTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTAc < 2:60813/136‑1 (MQ=255) tGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGgt > 5:366370/1‑136 (MQ=255) gTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGgtg > 3:35121/1‑136 (MQ=255) gTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGgtg > 1:323812/1‑136 (MQ=255) cAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCATCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGtgtg < 6:3168/135‑1 (MQ=255) cAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCATCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTGGCCCTGGTACAGGGtgtg < 6:8126/135‑1 (MQ=255) ggTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTgcag > 5:291477/1‑135 (MQ=255) gTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTgcagca < 6:111424/136‑1 (MQ=255) cGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCa > 7:207334/1‑105 (MQ=255) cGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCa < 8:207334/105‑1 (MQ=255) cGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAgcgc > 3:382969/1‑136 (MQ=255) cGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAgcgc > 5:156514/1‑136 (MQ=255) ccGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAACGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGt < 3:155799/136‑1 (MQ=255) tCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCgg > 7:359675/1‑136 (MQ=255) tCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCgg > 6:94267/1‑136 (MQ=255) tGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACg < 4:205020/136‑1 (MQ=255) aGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTc < 1:70930/136‑1 (MQ=255) gATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCg < 3:25307/136‑1 (MQ=255) gATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCg < 2:19974/136‑1 (MQ=255) cGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCGGCACAGGTACg < 4:35121/136‑1 (MQ=255) aTGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCGGCACAGGTACGggc < 7:61944/136‑1 (MQ=255) aTGCGCCGTCCTGGGTTTTCACCATGGCAACTGCGTAGTCCTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCGGCACAGGTACGggc < 2:19073/136‑1 (MQ=255) ccGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCGGCACAGGTACGGGCGGCCt < 2:323812/136‑1 (MQ=255) tCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGGACGGTCGGAAGCGGCACAGGTACGGGCGGCCTGGc < 1:3848/136‑1 (MQ=255) ccTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCGCGCCTTCAGGtt < 7:52251/64‑1 (MQ=255) ccTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGtt > 8:52251/1‑64 (MQ=255) ccTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCGGCACAGGTACGGGCGGCCTGGc > 2:300728/1‑135 (MQ=255) tccccAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCGGCACAGGTACGGGCGGCCTGGCCACCTTTAc < 1:304551/132‑1 (MQ=255) tCACCAGGTCCACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGGGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCGGCACAGGTACGGGCGGCCTGGCCACCTTTAc < 1:105980/135‑1 (MQ=255) tCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCGGCACAGGTACGGGCGGCCTGGCCACCTTTAc < 2:48598/135‑1 (MQ=255) tCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCGGCACAGGTACGGGCGGCCTGGCCACCTTTAc < 2:324453/135‑1 (MQ=255) tCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCGGCACAGGTACGGGCGGCCTGGCCACCTTTAc < 1:52172/135‑1 (MQ=255) tCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCGGCACAGGTACGGGCGGCCTGGCCACCTTTAc < 4:279836/135‑1 (MQ=255) tCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCGGCACAGGTACGGGCGGCCTGGCCACCTTTAc < 2:233123/135‑1 (MQ=255) tCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCGGCACAGGTACGGGCGGCCTGGCCACCTTTAc < 1:213881/135‑1 (MQ=255) tCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCGGCACAGGTACGGGCGGCCTGGCCACCTTTAc < 6:291477/135‑1 (MQ=255) tCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGCGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCGGCACAGGTACGGGCGGCCTGGCCACCTTTAc < 4:281176/135‑1 (MQ=255) tCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGGGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCGGCACAGGTACGGGCGGCCTGGCCACCTTTAc < 5:396028/135‑1 (MQ=255) ccAGGTCAACTGCTTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCt < 2:200731/57‑1 (MQ=255) ccAGGTCAACTGCTTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCt > 1:200731/1‑57 (MQ=255) | GTTGGTGGTGGACGCGTAGATACGGCCCGCACCGCCAGTGGCCAGCACGGTGGCCTTGGACTTGATGTACAGGGTTTCGCCGGTTTCGATGCAGATGGCGATCACACCCACGAATGCGCCGTCCTGGTTTTTCACCAGGTCAACTGCGTAGTACTCGTTGAGGAACGTGGTGCCCGCCTTCAGGTTGCCCTGGTACAGGGTGTGCAGCAGCGCGTGACCGGTACGGTCGGAAGCGGCACAGGTACGGGCGGCCTGGCCACCTTTAC > ACB143/4729318‑4729583 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |