| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | ACB143 | 4,840,424 | T→G | 8.6% | W620G (TGG→GGG) | copA_3 → | putative copper‑importing P‑type ATPase A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB143 | 4,840,424 | 0 | T | G | 8.6% | 580.5 / 3.6 | 298 | W620G (TGG→GGG) | copA_3 | putative copper‑importing P‑type ATPase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (130/122); new base G (23/13); total (163/135) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.12e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 307 total aligned reads displayed.
GGGGTGGTCGACGGCCAGCGCCTGCGCATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTGGGTA > ACB143/4840289‑4840559 | ggggTGGTCGACGGCCAGCGCCTGCGCATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCt > 1:342036/1‑136 (MQ=255) gggTGGTCGACGTCCAGCGCCTGCGCATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGTTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTg < 5:367899/136‑1 (MQ=255) gggTGGTCGACGGCCAGCGCCTGCGCATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTg < 8:2749/136‑1 (MQ=255) ggtCGACGGCCAGCGCCTGCGCATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGGCCGCCCGGGGCCCCTGGCCGTGTTc > 8:359794/1‑136 (MQ=255) ggtCGACGGCCAGCGCCTGCGCATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTc > 2:212796/1‑136 (MQ=255) ggtCGACGGCCAGCGCCTGCGCATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTc > 8:44950/1‑136 (MQ=255) ggtCGACGGCCAGCGCCTGCGCATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCGGCTGCTGGGCGCCCGCCAGGGGCCACTGGCCGGGTTc > 8:355507/1‑136 (MQ=255) gtCGACGGCCAGCGCCTGCGCATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGTCTGCGGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTc < 1:105362/135‑1 (MQ=255) gtCGACGGCCAGCGCCTGCGCATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTc < 5:381308/135‑1 (MQ=255) gcgcctgcgcctTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGCGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGTGGCCAATGGACTTGTTCGGCCTGGATGAc < 7:38231/136‑1 (MQ=255) ccTGCGCATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTAGGCCTGGATGACCGc > 7:177433/1‑136 (MQ=255) cgcagcggTCAGTCTAACTTCCGCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCGGCGGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCt < 8:183395/128‑1 (MQ=255) cgcATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCt < 1:257484/134‑1 (MQ=255) cgcATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCt < 1:24117/134‑1 (MQ=255) gcATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGGGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTgcg < 1:148972/136‑1 (MQ=255) cATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTgcgc < 3:244494/136‑1 (MQ=255) cATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTgcgc < 3:325495/136‑1 (MQ=255) aTTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCCGTGGCTGCTGCTGGGGGCCCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTAGGCCTGGATGACCGCCTGcgcg > 6:290438/1‑136 (MQ=255) aTTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCGGCTGGGCGCCCGCCAGGGGCCACTGGCCGGGTTAGGGCGGGATGGCCGCCGGcgcg > 3:258727/1‑136 (MQ=255) ttGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGcga < 1:62804/136‑1 (MQ=255) tGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGcga < 4:332584/135‑1 (MQ=255) cAGTCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCGGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATg < 2:260910/136‑1 (MQ=255) aGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATg < 7:330989/135‑1 (MQ=255) cTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGCCGATGcccc > 8:374864/1‑136 (MQ=255) aCCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGCCCGCCAGGGGCCACTGGCCGGGTTCGGCCTGGATGCCCGCCTGCGCGACGATGCCCCgg > 7:73919/1‑136 (MQ=255) aCCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCAGCTGGGCGAACCCCAGGGGCCACAGGCCTGGTTCCGCCTGGATGACAGCCGGCGCGCCGATGcccccg > 4:214904/1‑134 (MQ=255) cGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCCGTGGCTGCTGCTGGGGGCCCGCCCGGGGCCACAGGCCGGGGTCGGCCGGGCTGACCCCCGGCGCGCCCATGCCCCGGcccgg > 2:13928/1‑134 (MQ=255) cGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGGGGCGGGGGGGCGCCCCCCCCGGGGCACAGGCCGGGGTGGGGCGGGGGTACCCCCAGCGCGCCCATGCCCCCGccccg > 5:253437/1‑134 (MQ=255) cGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGGTGCTGGGCGCCCGCCAGGGGCCACAGGCCGGGTTAGGCCTGGATGACCCCCGGCGCGCCCATTCCCCCGccccg > 3:20610/1‑134 (MQ=255) cGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACAGGCCTGGTTCGGCCGGGATGACCCCCAGCGCGACGATGCCCCCGCCCTg > 4:196451/1‑136 (MQ=255) cGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCGGCTGGGCGCCCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTg > 5:298674/1‑136 (MQ=255) gcgcCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGCGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCGGGGTCGGCCTGGATGACCCCCTGCGCGCCGATGCCCCGGCCCTGCTCGc > 2:49631/1‑136 (MQ=255) gcgcCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCCCAGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGCCGATTCCCCGGCCCAGCTCg > 4:90248/1‑135 (MQ=255) gcCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCCGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGCCCGCCAGGGGCCCCAGGCCGGGTTAGGCCTGGATGACCCCCAGCGCGCCGATGCCCCCGCCCGGCACGctg > 6:84722/1‑136 (MQ=255) cTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGCCCGCCAGGGGCCACTTGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGctgcc > 6:166110/1‑136 (MQ=255) cTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGctgcc > 1:293583/1‑136 (MQ=255) cTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGctgcc > 7:195498/1‑136 (MQ=255) cTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGctgcc > 7:290299/1‑136 (MQ=255) cTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCACTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCCGCCAGGATGAACGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTTCTCGctgcc > 6:132910/1‑136 (MQ=255) gtggtgCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCCGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTTGGCTGGGTAGGCCTGGAAGCCCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCGGCTCGctgcctgg > 2:362251/1‑133 (MQ=255) gtggtgCGGAAATCCCCGCTGTACCAGAGCCGCGCGGCCAGTGGCAGCTGCTTGGCCACCCACACGGGCCAATGGCCAGGTTCGGCCAGGATGACCCCCTGCGCTACGATGCCCCGGCCCTGCTCGctgcctgc > 5:189854/1‑134 (MQ=255) ggtgCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGGCGGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAgg > 8:16635/1‑136 (MQ=255) ggggCGGAATTCCCCGCTGTCCCCGAGCCGCGCGGCCTGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCGGGTTGGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAgg < 4:364788/133‑1 (MQ=255) gggCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAgg < 4:273276/133‑1 (MQ=255) tgCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGGGGCTGCGGCGGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGgcg < 2:200882/136‑1 (MQ=255) ggAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCCGTGGCTGCGGCTGGGCCACCCCCACGGGCCACTGGCCAGGTTCGGCCCGGCTTACCGCCAGCGCGACGAAGCCCCGGCCCTGCTCCCAGCCGGCAAGgcgccg > 4:301441/1‑134 (MQ=255) ggAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCgg > 8:305956/1‑136 (MQ=255) ggAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCgg > 4:293034/1‑136 (MQ=255) ggAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCgg > 6:386260/1‑136 (MQ=255) ggAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACAGGCCTGGTTCGGCCTGGATTACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCgg > 4:102218/1‑136 (MQ=255) gAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCggg > 8:171612/1‑136 (MQ=255) tgcccGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCTGGGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCGGGGTCGGCCTGGATGACCTCCGGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGGGGGGCTg < 7:222059/134‑1 (MQ=255) tCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCCGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCCGGGGCCCCAGGCCTGGTTCGGCCTGGTTGACCCCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCGCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTg > 6:327727/1‑136 (MQ=255) tCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTc < 2:93819/71‑1 (MQ=255) tCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTc > 1:93819/1‑71 (MQ=255) tCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTg < 1:364480/136‑1 (MQ=255) tCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTg < 3:113644/136‑1 (MQ=255) cccGCTGTCCCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGc < 8:12718/136‑1 (MQ=255) gCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGCCCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCCGCCCAGCTCCCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGcacc > 2:286915/1‑135 (MQ=255) gCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCCCGCCGCTGCCCCGGCCCTGCACGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGcaca > 2:114158/1‑136 (MQ=255) ccGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCTACTGGCCTg > 7:114419/1‑55 (MQ=255) ccGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCTACTGGCCTg < 8:114419/55‑1 (MQ=255) gAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACCCCctgctgc > 5:93577/1‑136 (MQ=255) gAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCctgctgc > 5:164873/1‑136 (MQ=255) ccGCGCGGCCCGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGGCTGGTTAGGCCGGGATGACCGCCTGGGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCGGGGACCCCCGGCTGCTGt > 8:65472/1‑136 (MQ=255) cgcgGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGCCGCTGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGGCgg > 7:342967/1‑136 (MQ=255) gcgGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCggg < 5:356566/136‑1 (MQ=255) cgGCCCGTGGCTGCGGCTGGGCGCCCCCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCGGGATGACCGCCTGCGCGCCGATTCCCCGGCCCAGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCCCACCCGGCTGCTGTCGGGc > 4:154625/1‑136 (MQ=255) cgGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGCCCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGc > 6:68585/1‑136 (MQ=255) cgGCCAGTGGCTGCGGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGc < 3:136425/136‑1 (MQ=255) gCCCGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGGCTGGATGACCGCCTGCGCGACGCTGCCCCGGCCCTGCTCGCGGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCCCCCCCTGCTGCTGTCGGGCgc > 5:116771/1‑135 (MQ=255) gCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGa < 5:310972/136‑1 (MQ=255) gctgctgcgGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCGGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCGGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCg < 5:40704/136‑1 (MQ=255) gctgctgcaGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCAGGTTCGGCCTGGATGACCCCCAGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCATCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCACg > 2:328247/1‑136 (MQ=255) tgctgctgGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGcc < 2:66263/136‑1 (MQ=255) ctgGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACCCCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATgg > 2:82724/1‑136 (MQ=255) ctgGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATgg > 6:277962/1‑136 (MQ=255) ctgGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATgg > 1:17154/1‑136 (MQ=255) gCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGc > 8:189017/1‑136 (MQ=255) gACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGcc > 2:232520/1‑135 (MQ=255) gACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGcc > 8:247251/1‑135 (MQ=255) cAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTgg < 4:356280/136‑1 (MQ=255) aGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGc > 8:344369/1‑136 (MQ=255) ggggCGACTGGCCTGGTTCGGCGTGGATGACCGCCTGCGCGACGATACCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCTAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGcc < 1:190210/136‑1 (MQ=255) ggggCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGcc < 7:25974/136‑1 (MQ=255) ggggCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGcc < 6:367610/136‑1 (MQ=255) ggggCCACTGGCCTGGTGCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCGCGCGGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGcc < 6:245244/136‑1 (MQ=255) ggggCCACTGGCCGGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGcc < 3:293034/136‑1 (MQ=255) ggggCCACTGGCCGGGTGCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGcc < 7:233788/136‑1 (MQ=255) gggCCACTGGCCTGGTGCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGcc < 4:34473/135‑1 (MQ=255) ggCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACCCCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCcgc > 4:52036/1‑136 (MQ=255) ccACTGGCCTGGTGCGGCCGGGATGCCCCCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCCCGCTCCCGGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCgcgc < 6:45125/136‑1 (MQ=255) cACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCa < 6:309658/136‑1 (MQ=255) cACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCa < 6:262982/136‑1 (MQ=255) cTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGc > 1:287227/1‑136 (MQ=255) tGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGACGAAGTGGCCGCGCAGCt > 4:77775/1‑136 (MQ=255) gcatGGTTAGGCCTGGATGACCGCCTTCGCGACGATGCACCTTCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGTCGCCGGGCTGGCACACACTGCTGCTGTCTGGCTACAGCTCGCCTCAGGTTGCAGAAGTGGCCGCGCATCTgc > 8:236029/4‑135 (MQ=255) gCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTgg > 1:322650/1‑136 (MQ=255) gCCGGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTgg < 5:221976/136‑1 (MQ=255) tGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTGGGTa > 8:105385/1‑136 (MQ=255) | GGGGTGGTCGACGGCCAGCGCCTGCGCATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTGGGTA > ACB143/4840289‑4840559 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |