| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | KT2440 | 634,781 | Δ1 bp | 7.8% | coding (121/1089 nt) | ydjJ ← | putative zinc‑type alcohol dehydrogenase‑likeprotein YdjJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | KT2440 | 634,781 | 0 | C | . | 7.8% | 177.2 / 8.2 | 51 | coding (121/1089 nt) | ydjJ | putative zinc‑type alcohol dehydrogenase‑likeprotein YdjJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (19/28); new base . (2/2); total (21/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.48e-01 | |||||||||||
GATGTGGCCGCAGAATTCGTGGCCGAGGATGCACTGGCCCTGAATGCCGGTCAGCGGGTGCGGGGCCTCTACCGGGATGAACACCGGGCCGGCAACATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGTTCGACACGAATATCGTGGCGGCCATGCCAGACGGCCGCGCGCATGTGGGTGTGGCTCAGGTCATTCATTGTTGTTCTCC > KT2440/634647‑634912 | gATGTGGCCGCAGAATTCGTGGCCGAGGATGCACTGGCCCTGAATGCCGGTCAGCGGGTGCGGGGCCTCTACCGGGATGAACACCGGGCCGGCAACATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTc > 7:245635/1‑135 (MQ=255) aTGTGGCCGCAGAATTCGTGGCCGAGGATGCACTGGCCCTGAATGCCGGTCAGCGGGTGCGGGGCCTCTACCGGGATGAACACCGGGCCGGCAACATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTcc < 5:325426/135‑1 (MQ=255) aTGTGGCCGCAGAATTCGTGGCCGAGGATGCACTGGCCCTGAATGCCGGTCAGCGGGTGCGGGGCCTCTACCGGGATGAACACCGGGCCGGCAACATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTcc > 7:125875/1‑135 (MQ=255) gCCGCAGAATTCGTGGCCGAGGATGCACTGGCCCTGAATGCCGGTCAGCGGGTGCGGGGCCTCTACCGGGATGAACACCGGGCCGGCAACATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTCCACCtt < 1:295849/135‑1 (MQ=255) 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cTGAATGCCGGTCAGCGGGTGCGGGGCCTCTACCGGGATGAACACCGGGCCGGCGACATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTcggccg > 1:125099/1‑134 (MQ=255) cTGAATGCCGGTCAGCGGGTGCGGGGCCTCTACCGGGATGAACACCGGGCCGGCAACATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTcggccg > 8:273647/1‑134 (MQ=255) cTGAATGCCGGTCAGCGGGTGCGGGGCCTCTACCGGGATGAACACCGGGCCGGCAACATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGT‑CACCTTGATCTGCACCCAGCCCg > 3:76785/1‑118 (MQ=255) cTGAATGCCGGTCAGCGGGTGCGGGGCCTCTACCGGGATGAACACCGGGCCGGCAACATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGT‑CACCTTGATCTGCACCCAGCCCg > 3:81854/1‑118 (MQ=255) cTGAATGCCGGTCAGCGGGTGCGGGGCCTCTACCGGGATGAACACCGGGCCGGCAACATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGT‑CACCTTGATCTGCACCCAGCCCg < 4:81854/118‑1 (MQ=255) cTGAATGCCGGTCAGCGGGTGCGGGGCCTCTACCGGGATGAACACCGGGCCGGCAACATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGT‑CACCTTGATCTGCACCCAGCCCg < 4:76785/118‑1 (MQ=255) 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gCGGGTGCGGGGCCTCTACCGGGATGAACACCGGGCCGGCAACATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGtt < 7:273647/135‑1 (MQ=255) gCGGGTGCGGGGCCTCTACCGGGATGAACACCGGGCCGGCAACATATTCATGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGtt < 5:67054/135‑1 (MQ=255) ggggCCTCTACCGGGATGAACACCGGGCCGGCAACATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGTTCGACACGa < 1:322256/135‑1 (MQ=255) ctctACCGGGATGAGCACCGGGCCGGCAACATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGTTCGACACGAATATc < 5:230056/135‑1 (MQ=255) ccGGGATGAACACCGGGCCGGCAACATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGTTCGACACGAATATCGTggc > 8:158417/1‑135 (MQ=255) cGGGATGAACACCGGGCCGGCAACATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGTTCGACACGAATATCGTggcg > 6:180264/1‑135 (MQ=255) gggATGAACACCGGGCCGGCAACATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGTTCGACACGAATATCGTggcgg < 2:125099/135‑1 (MQ=255) gCCGGCAACATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGACCGGCAAAGGTACCTGTTCGACACGAATATCGTGGCGGCCATGCCAGACGGc < 5:345833/135‑1 (MQ=255) cGGCAACATATTCGTGCAGGGCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGTTCGACACGAATATCGTGGCGGCCATGCCAGACGGCcg < 5:127560/135‑1 (MQ=255) ggCAACATATTCGTGCAGGGCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGTTCGACACGAATATCGTGGCGGCCATGCCAGACGGCcgc < 2:303378/135‑1 (MQ=255) cAACATATTCGTGCAGGGCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGTTCGACACGAATATCGTGGCGGCCATGCCAGACGGCcgcgcg < 4:292475/136‑1 (MQ=255) cATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTCCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGTTCGACACGAATATCGTGGCGGCCATGCCAGACGGCCGCGCGCa < 5:303991/135‑1 (MQ=255) 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aTGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGTTCGACACGAATATCGTGGCGGCCATGCCAGACGGCCGCGCGCATGTGGGTGTGGCTCAGGTcattcatt > 5:168198/1‑135 (MQ=255) aTGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGTTCGACACGAATATCGTGGCGGCCATGCCAGACGGCCGCGCGCATGTGGGTGTGGCTCAGGTCATTCAttg > 3:239804/1‑136 (MQ=255) aTGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGTTCGACACGAATATCGTGGCGGCCATGCCAGACGGCCGCGCGCATGTGGGTGTGGCTCAGGTCATTCAttg < 4:36111/136‑1 (MQ=255) aTGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGTTCGACACGAATATCGTGGCGGCCATGCCAGACGGCCGCGCGCATGTGGGTGTGGCTCAGGTCATTCAttg > 4:329367/1‑136 (MQ=255) aTGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGTTCGACACGAATATCGTGGCGGCCATGCCAGACGGCCGCGCGCATGTGGGTGTGGCTAATGTcattcatt > 5:161857/1‑135 (MQ=255) cAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGTTCGACACGAATATCGTGGCGGCCATGCCAGACGGCCGCGCGCATGTGGGTGTGGCTCAGGTCATTCATTGTTGTtct > 6:154340/1‑134 (MQ=255) aGTCTACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGTTCGACACGAATATCGTGGCGGCCATGCCAGACGGCCGCGCGCATGTGGGTGTGGCTCAGGTCATTCATTGTTGTTCTcc < 1:88656/135‑1 (MQ=255) | GATGTGGCCGCAGAATTCGTGGCCGAGGATGCACTGGCCCTGAATGCCGGTCAGCGGGTGCGGGGCCTCTACCGGGATGAACACCGGGCCGGCAACATATTCGTGCAGGTCGGAGCCGCAGATGCCGCACCAGTCCACCTTGATCTGCACCCAGCCCGGCGCAGGGTCGGCCGGCAAAGGTACCTGTTCGACACGAATATCGTGGCGGCCATGCCAGACGGCCGCGCGCATGTGGGTGTGGCTCAGGTCATTCATTGTTGTTCTCC > KT2440/634647‑634912 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |