| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | KT2440 | 3,956,826 | G→C | H275D (CAT→GAT) | dmlR_13 ← | HTH‑type transcriptional regulator DmlR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | KT2440 | 3,956,826 | 0 | G | C | 97.2% | 240.3 / NA | 72 | H275D (CAT→GAT) | dmlR_13 | HTH‑type transcriptional regulator DmlR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (31/39); minor base A (2/0); total (33/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.07e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACCGCGGCAAACTTCTCGCCTCAGCGCCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATGGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCGCTGGCGGTGTAGAACGGCAGCAGGCCAATGCCCAT > KT2440/3956696‑3956949 | aCCGCGGCAAACTTCTCGCCTCAGCGCCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGt > 7:180610/1‑135 (MQ=255) ccGCGGCAAACTTCTCGCCTCAGCGCCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTg > 7:243262/1‑135 (MQ=255) cgcgGCAAACTTCTCGCCTCAGCGCCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGa < 3:236719/135‑1 (MQ=255) ctgCAAACTTCTCGCCTCAGCGCCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGTCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACg < 7:345525/133‑1 (MQ=255) cgGCAAACTTCTCGCCTCAGCGCCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGATGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACg < 3:11206/135‑1 (MQ=255) cgGCAAACTTCTCGCCTCAGCGCCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACg < 2:6019/135‑1 (MQ=255) cgGCAAACTTCTCGCCTCAGCGCCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACg < 6:331513/135‑1 (MQ=255) cgGCAAACTTCTCGCCTCAGCGCCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCGCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACg < 6:110170/135‑1 (MQ=255) gCAAACTTCTCGCCTCAGCGCCAATACCGCGAATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACg < 5:38520/133‑1 (MQ=255) cAAACTTCTCGCCTCAGCGCCAATACCGCGCATGATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCTCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGAt < 4:336062/135‑1 (MQ=255) aaCTTCTCGCCTCAGCGCCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATAc < 2:299506/135‑1 (MQ=255) ttCTCGCCTCAGCGCCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATc < 2:228015/135‑1 (MQ=255) tcGCCTCAGCGCCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGCCGGATACATCGc > 1:250791/1‑134 (MQ=255) tcGCCTCAGCGCCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGc < 1:307244/134‑1 (MQ=255) tcGCCTCAGCGCCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGc < 3:142680/134‑1 (MQ=255) ccTCAGCGCCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCAt < 8:315338/133‑1 (MQ=255) ccTCAGCGCCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCAt < 2:118498/133‑1 (MQ=255) ccTCAGCGCCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCAt < 1:287128/133‑1 (MQ=255) tCAGCGCCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAg > 3:363354/1‑135 (MQ=255) tcaggcCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAgc < 4:17632/131‑1 (MQ=255) gcgcCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAgc < 4:200660/133‑1 (MQ=255) cAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGCCGGATACATCGCATACAGCGCActc > 1:337146/1‑135 (MQ=255) aTACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACtctc < 8:180610/135‑1 (MQ=255) tACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTcc < 1:81948/135‑1 (MQ=255) cgcgCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGc < 3:73106/135‑1 (MQ=255) catcatCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACCTCCCATACAGCGCACTCTCCCGCAGcc > 2:361793/1‑135 (MQ=255) catcatCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACCGCGCCCTCTCCCGCAGcc > 1:348676/1‑135 (MQ=255) catcatCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACCGCGCACTCTCCCGCAGc > 5:202996/1‑134 (MQ=255) catcatCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGc > 7:294195/1‑134 (MQ=255) catcatCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGGGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGcc > 7:140013/1‑135 (MQ=255) catcatCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGAGCCAGGTGCGCCCCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGGATACCGCGCACTCTCCCGCAGcc > 4:218398/1‑135 (MQ=255) catcatCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTCAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCCCCTTGGCGTCCACGTAATAGCCGGACGGCTACCACGCATACCCCCCACTCACCCGCacc > 6:237297/1‑132 (MQ=255) catcCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGAt < 7:101789/135‑1 (MQ=255) cTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAAt < 3:157847/135‑1 (MQ=255) cATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACg < 6:238749/84‑1 (MQ=255) cATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACg < 6:234083/84‑1 (MQ=255) cATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACg > 5:238749/1‑84 (MQ=255) cATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTg < 5:111982/126‑1 (MQ=255) cATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAAcc > 2:36054/1‑135 (MQ=255) cATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCACGCAGCCGATACGGTg > 6:111982/1‑126 (MQ=255) cATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATAACTCGCAAAAAGCGCACTCTCACGCAGCCGATACGGTGCCAATAAcc > 1:359123/1‑135 (MQ=255) cATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGAGTGACg > 5:234083/1‑84 (MQ=255) cATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTAGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATAGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGAAACGGTGCCAATAAcc > 4:275391/1‑135 (MQ=255) tGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGAGACGGTGCCAATAACCgg > 1:179310/1‑135 (MQ=255) tCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATa < 6:72426/89‑1 (MQ=255) tCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATa > 5:72426/1‑89 (MQ=255) aCAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTc > 4:232939/1‑135 (MQ=255) cGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGca > 2:282363/1‑120 (MQ=255) cGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGca < 1:282363/120‑1 (MQ=255) cGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGccc < 1:226052/135‑1 (MQ=255) tCCTTGAGGTAGGCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCg < 4:221590/135‑1 (MQ=255) aGGTAGTCGATCCAGGAGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCTCAGCCGCTACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCGCTGGCg < 4:341961/135‑1 (MQ=255) ggTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCGCTGGCgg > 6:170835/1‑135 (MQ=255) tAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGGCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCGCTGGCGgtg < 8:140013/135‑1 (MQ=255) gATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCGCTGGCGGTGTAGaa > 8:235309/1‑135 (MQ=255) aTCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTGCCTGCCCGATCGCCTCGCTGGCGGTGTAGAAc > 4:102057/1‑135 (MQ=255) aTCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCGc > 5:246430/1‑121 (MQ=255) aTCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCGc < 6:246430/121‑1 (MQ=255) aTCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCGCTGGCGGTGTAGAAc > 1:246055/1‑135 (MQ=255) aTCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCGCTGGCGGTGTAGAAc > 1:143462/1‑135 (MQ=255) acAGCTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACGCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTCCCCGATCGCCTCGCTGGCTGTGTAGAACgg < 7:94296/134‑1 (MQ=255) aGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCGCTGGCGGTGTAGAACGgca > 1:32452/1‑135 (MQ=255) aGGTGCGCACCTTGGCGTCCACGTAATAGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTAGCTGGCGGTGTAGAACGgca > 3:196357/1‑135 (MQ=255) cgcACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCGCTGGCGGTGTAGAACGGCAGCAgg < 3:232939/135‑1 (MQ=255) gcACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCGCTGGCGGTGTAGAACGGCAGCAGGc < 8:243262/135‑1 (MQ=255) gcACCTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCAGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCGCTGGCGGTGTAGAACGGCAGCAGGc < 6:299664/135‑1 (MQ=255) gcACCTTGGCGTCCAGGGAATCGCGTGACGGATACATGGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGCTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCAGCCCGATCGCCTCGCTGGCGGTGTAGAACGGCAGCAgg < 3:275391/134‑1 (MQ=255) cTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCGTACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCGCTGGCGGTGTAGAACGGCAGCAGGCCAat > 1:110523/1‑135 (MQ=255) cTTGGCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCGCTGGCGGTGTAGAACGGCAGCAGGCCAat > 1:207626/1‑135 (MQ=255) ggCGTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCGCTGGCGGTGTAGAACGGCAGCAGGCCAatgc > 1:318074/1‑134 (MQ=255) ggccAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCGCTGGCGGTGTAGAACGGCAGCAGGCCAatgcccat < 1:149701/133‑1 (MQ=255) gTCCAGGTAATCGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCGCTGGCTGTGTAGAACGGCAGCAGGCCAatgcccat < 4:58092/135‑1 (MQ=255) | ACCGCGGCAAACTTCTCGCCTCAGCGCCAATACCGCGCATCATCCACCACCCTGGCATGCCCCTCGAACAGCGCCGGCAGTTGCTCCTTGAGGTAGTCGATCCAGGTGCGCACCTTGGCGTCCAGGTAATGGCGTGACGGATACATCGCATACAGCGCACTCTCCCGCAGCCGATACGGTGCCAATAACCGGCACAAGCGTCCCTGCCCGATCGCCTCGCTGGCGGTGTAGAACGGCAGCAGGCCAATGCCCAT > KT2440/3956696‑3956949 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |