Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | KT2440 | 6,022,319 | A→G | 6.4% | L326P (CTG→CCG) | puuC_2 ← | NADP/NAD‑dependent aldehyde dehydrogenase PuuC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | KT2440 | 6,022,319 | 0 | A | G | 6.4% | 193.1 / 2.4 | 62 | L326P (CTG→CCG) | puuC_2 | NADP/NAD‑dependent aldehyde dehydrogenase PuuC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/26); new base G (2/2); total (32/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CCGGCCAGCAGCTTGGCGCCGTCCTTGTGGCCAGCCTCGATGTACGACAGCACGGTGTTCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTGGTTGAAGGCGATGGCGCTGGCTGCGGCCTCGGCGGCTGCTT > KT2440/6022187‑6022445 | ccgGCCAGCAGCTTGGCGCCGTCCTTGTGGCCAGCCTCGATGTACGACAGCACGGTGTTCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAgg > 7:79507/1‑135 (MQ=255) cTTGGCGCCGGCCTTGTGGCCAGCCTCGATGTACGACAGCACGGTGTTCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCTGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTaccac < 7:227996/135‑1 (MQ=255) gcgcCGTCCTTGTGGCCAGCCTCGATGTACGACAGCACGGTGTTCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATc < 5:199582/135‑1 (MQ=255) cgcCGTCCTTGTGGCCAGCCTCGATGTACGACAGCACGGTGTTCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCg < 3:142088/135‑1 (MQ=255) tCCTTGTGGCCAGCCTCGATGTACGACAGCACGGTGTTCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAgg < 2:110868/135‑1 (MQ=255) ttGTGGCCAGCCTCGATGTACGACAGCACGGTGTTCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAAc > 2:1084/1‑135 (MQ=255) cGATGTACGACAGCACGGTGTTCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCCGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCg > 8:119619/1‑135 (MQ=255) cGATGTACGACAGCACGGTGTTCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATc > 6:100943/1‑134 (MQ=255) gACAGCACGGTGTTCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTc < 2:171317/134‑1 (MQ=255) aCGGTGTTCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACca > 7:5845/1‑133 (MQ=255) ggTGTTCATCTGCTGGGTTTCCCCCAAGGCCCCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACcagcag < 8:238256/135‑1 (MQ=255) ggTGTTCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACcagcag > 8:49154/1‑135 (MQ=255) ggTGTTCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACcagcag < 1:170746/135‑1 (MQ=255) ggTGTTCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCGCTCCCACCATCGGCAGGACCTTGTCCTTGCTCGAACGCTCGACcagccg > 5:18376/1‑133 (MQ=255) ggTGTTCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGGCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACcagcag < 1:109921/135‑1 (MQ=255) gtTCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCg < 3:278975/135‑1 (MQ=255) tCATCTGCTGGGTATCGCCCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCGACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGACCGCACGCCCAGCAGGCg > 7:74063/1‑133 (MQ=255) tCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCggg < 8:201389/135‑1 (MQ=255) tCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCggg < 8:10365/135‑1 (MQ=255) tCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCg > 2:305528/1‑133 (MQ=255) tCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGGGGTCTGCGGGTCCAGCGGGGTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCggg < 7:267797/135‑1 (MQ=255) ctCTGCTGGGTAGCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAg < 8:166959/134‑1 (MQ=255) tCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGc < 1:1084/135‑1 (MQ=255) tCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGc < 4:160144/135‑1 (MQ=255) ctggtgGGTATCGTACATTGCTCCGTGAGTTGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGGCTGGCTTCCAGCCGTTCAGGGCCTCTTCCACCATCGGCTGGAACTTGTCCTTGTTCGATGGCTGGTCCAGCAGGCTGGatc < 6:327924/134‑3 (MQ=255) tgctgGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCt > 8:98152/1‑135 (MQ=255) ggTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCGGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACcagc < 7:180388/118‑1 (MQ=255) ggTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCGGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACcagc > 8:180390/1‑118 (MQ=255) ggTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCGGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACcagc > 8:180388/1‑118 (MQ=255) ggTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCGGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACcagc < 7:180390/118‑1 (MQ=255) ggTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGt > 3:303266/1‑135 (MQ=255) ggTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGt > 7:204188/1‑135 (MQ=255) tATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTACTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGc > 7:17686/1‑135 (MQ=255) cGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGcaca < 7:98152/135‑1 (MQ=255) cGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGcaca < 4:331008/135‑1 (MQ=255) cGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTACTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGcac > 5:233428/1‑134 (MQ=255) ccAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGCCAGGAACTTGTACTTGATCGAGCGCTCGACCACCCGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACtt > 8:88450/1‑135 (MQ=255) caagtaaCCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCCGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTc < 2:301090/129‑1 (MQ=255) cAAGGCACCGACCGTGGGCTGCGGGTCCAGGGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCCGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCCGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTc < 8:128366/135‑1 (MQ=255) cAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTc < 4:294784/135‑1 (MQ=255) aaGGCACCGACAGTGTTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTGCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTTTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGTAGCCTGCAGTGCACACTTCg < 3:97732/135‑1 (MQ=255) aaGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGCGCCTGCAGTGCACACTTCg > 1:96170/1‑135 (MQ=255) cACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACATCGCCCt > 5:200834/1‑135 (MQ=255) aCCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTg > 7:94871/1‑135 (MQ=255) aCCGACAGTGGTCTGCGGGTCAAGCTAGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTg > 8:308339/1‑135 (MQ=255) ccGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTgg < 4:165884/135‑1 (MQ=255) cAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTGGtt > 4:122617/1‑133 (MQ=255) cAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTGGtt > 1:92894/1‑133 (MQ=255) tCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTGGTTGAAGGCGa > 2:88270/1‑135 (MQ=255) tGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTGGTTGAAGGCGCTg > 5:262090/1‑135 (MQ=255) gggTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGGTCGCCCAGCAGGCCGGAGCCTCCAGTGCACACTTCGCCCTCGGAGAAGGCGATGgcg > 1:161180/1‑135 (MQ=255) gggTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTGGTTGAAGGCGATGgcg > 1:204014/1‑135 (MQ=255) tCCAGCGGGTGGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCGCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTGGTTGAAGGCGATGGCgctg < 1:97623/135‑1 (MQ=255) gCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCCGTGCACACTTCGCCCTGGTTGAAGGCGATGGCgctggctg > 4:308118/1‑135 (MQ=255) ggCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGca > 6:136709/1‑89 (MQ=255) ggCTTCCAGCCCTTCAGGGCATCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGca < 5:136709/89‑1 (MQ=255) cTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTGGTTGAAGGCGATGGCGCTGGCTGCGGCCTcggcg < 6:200834/133‑1 (MQ=255) cTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTGGTTGAAGGCGATGGCGCTGGCTGCGGCCTcggcg < 8:79507/133‑1 (MQ=255) ttCCAGCCATTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGCCCGATCGCCCAGCAGTAGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTGGTTGAAGTCGATGGAGATGGCTGCGGCCTCGGCGgct > 6:145664/1‑135 (MQ=255) ccAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTGGTTGAAGGCGATGGCGCTGGCTGCGGCCTCGGCGgctgc > 7:196201/1‑135 (MQ=255) aGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTGGTTGAAGGCGATGGCGCTGGCTGCGGCCTCGGCGgctgct < 4:303266/134‑1 (MQ=255) gCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTGGTTGAAGGCGATGGCGCTGGCTGCGGCCTCGGCGGCTGCtt > 6:20241/1‑134 (MQ=255) | CCGGCCAGCAGCTTGGCGCCGTCCTTGTGGCCAGCCTCGATGTACGACAGCACGGTGTTCATCTGCTGGGTATCGACCAAGGCACCGACAGTGGTCTGCGGGTCCAGCGGGTTGCCTGGCTTCCAGCCCTTCAGGGCCTCTACCACCATCGGCAGGAACTTGTCCTTGATCGAACGCTCGACCAGCAGGCGGGAGCCTGCAGTGCACACTTCGCCCTGGTTGAAGGCGATGGCGCTGGCTGCGGCCTCGGCGGCTGCTT > KT2440/6022187‑6022445 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |