| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | KT2440 | 1,900,316 | A→C | 26.6% | V160G (GTC→GGC) | CJ019_01816 ← | 2‑ketogluconate reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | KT2440 | 1,900,316 | 0 | A | C | 26.6% | 94.8 / 4.7 | 72 | V160G (GTC→GGC) | CJ019_01816 | 2‑ketogluconate reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (29/21); new base C (19/2); total (49/23) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.11e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AGCGCATCGCTGTCCTTGGCCAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGTCACCGGTGCAGATCCCCC > KT2440/1900187‑1900445 | aGCGCATCGCTGTCCTTGGCCAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGCAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCgg > 6:256706/1‑135 (MQ=255) gcATCGCTGTCCTTGGCCAACTGAAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGccc < 5:276020/135‑1 (MQ=255) aTCGCTGTCCTTGGCCAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGCCCCGGCCCAt > 1:17368/1‑135 (MQ=255) cGCTGTCCTTGGCCAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTCCCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGc > 7:264988/1‑135 (MQ=255) cGCTGTCCTTGGCCAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGc < 7:13980/135‑1 (MQ=255) cTGTCCTTGGCCAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCcg < 2:114203/135‑1 (MQ=255) cAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGCCCCGGCCCATGCCGACCAAGCCCAc > 2:258238/1‑135 (MQ=255) cAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCAc > 7:233733/1‑135 (MQ=255) aaCTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCAcg < 8:84976/135‑1 (MQ=255) aaCTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGCTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCAcg < 4:327311/135‑1 (MQ=255) aCTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGAAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCAcgc < 7:225170/135‑1 (MQ=255) tGCAGCAGATCTGCGTCGAACCCGTAGTGCACATCCAGTGCCTGTAGATCTGTTTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCGGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCAGACCCGGCCAATGCCGACGATGCCCAcgc < 4:220527/133‑1 (MQ=255) gcagcaGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCCCCCGCCCCGGCCCCAGCCGCCGAAGCCCAcccg > 3:207681/1‑133 (MQ=255) gcagcaGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGACCGCCCGACCCCGCCCATGCCGACCATGCCCACCCGCa > 2:239734/1‑135 (MQ=255) agcagATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCCCCCCCGCCCAAGCCGCCGCTGCCCCcgcccctg > 2:297159/1‑130 (MQ=255) agATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGccc < 7:281147/135‑1 (MQ=255) gATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCg < 8:34735/135‑1 (MQ=255) tGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGCCCCGGCCCATGCCGCCGATGCCCACGCGCATGCCCGaccc > 4:203516/1‑133 (MQ=255) ccTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGCCGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCt > 6:115777/1‑135 (MQ=255) tCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGCCGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGc > 3:34564/1‑135 (MQ=255) cGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGCCCCGGCCCATGCCGACGAAGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGcc > 1:190097/1‑135 (MQ=255) cGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCAGGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGcc > 1:103887/1‑135 (MQ=255) ccGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCCCCCGCCCCGGCCCAAGCCCAAGAAGCCCACCCGCAAGCCCCACACCTCCCCGGcc > 6:37915/1‑135 (MQ=255) aTCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCgg > 5:144353/1‑135 (MQ=255) ccAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGCCCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTg > 6:181565/1‑135 (MQ=255) ccAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGCCCCCGCCCATGCCGCCGATGCCCACGCGCCTGCCCGACCCCTGCCGGGGCAGTGGCAGCGGTg > 1:295040/1‑135 (MQ=255) cAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGCCCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGCCACCTGCCGGGCCCGTGGCAGCGGTGc > 8:236356/1‑135 (MQ=255) aGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGCCCCGGCCCATGCCGACGCTGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTg > 1:263859/1‑133 (MQ=255) ccTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCg < 6:275333/70‑1 (MQ=255) ccTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCg > 5:275333/1‑70 (MQ=255) cTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGCCGATGCCCCCGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGGGGCTGCGGTGCCAgcgg > 6:279953/1‑135 (MQ=255) cTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCATCTGTGCTACCGCCCCCCCGACCCGGCCAATGCCCACGAAGCCCACGCGCCTGCCCGACCCCTGCCGTGCCAGTCGCAAGGGTGCCAgcgg > 7:70515/1‑135 (MQ=255) aGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCCTGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCgtg > 6:184237/1‑135 (MQ=255) aGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCCCCCGACCCGGCCCCTGCCGACGATGCCCCCGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCgtg > 3:256458/1‑135 (MQ=255) gATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGCCCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCgtgg > 7:185859/1‑135 (MQ=255) aTCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGCCCCGGCCCCTGCCGACGATGCCCCCGCGCATGCCCGCCACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCCGCGGCggggt > 1:291779/1‑135 (MQ=255) aTCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGCCCCCGCCCATGCCGACGCTGCCCCCGCGCCTGCCCGACACCAGCCCGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCCGCgtggt > 7:245998/1‑135 (MQ=255) aTCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCCACCCCTCCCCTGCCCACGATGCCCCCGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCCGCGGCgtggt > 4:76059/1‑135 (MQ=255) cGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGTCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGc < 1:239734/135‑1 (MQ=255) gtgtAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCtg > 4:308745/1‑135 (MQ=255) aGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGCCCCGGCCCCTGCCGACGATGCCCCCGCGCCTGCCCGACACCTGCCGGGCCCGTGGCAGCGGTGCCAGCCGCGTGGGGCtggtgg > 7:273337/1‑135 (MQ=255) aGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGCCCCGGCCCATGGCGACCAATCCCACCCGCATTCCCGCCACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCCGCGGCGTGGTGCtggtgg > 8:19324/1‑135 (MQ=255) aGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGCCCCGGCCCATGCCGCCGATGCCCACCCGCCTGCCCGCCCCCGGCCCGGCCAGGGGCCGCGGGGCCAGCGGcggggggcgggggg > 5:46057/1‑135 (MQ=255) aGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGCCGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCCGTGCCAGCGGCGTGGTGCtggtgg > 6:59236/1‑135 (MQ=255) aGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCtggtgg > 7:328855/1‑135 (MQ=255) aGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCtggtgg < 2:96762/135‑1 (MQ=255) cGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCCTGCCGCCGATGCCCCCGCGCATGCCCGCCACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCCGCGGCGTGGTGCtggtgggc > 7:316238/1‑133 (MQ=255) gCAACCGAAGGTTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGCCGATGCCCACGCGCAAGCCCGCCCCCGGCCCGGCCACTGGCCGCGGTGCCAGCGGCGGGGGGCTGGTGGCCCCAcggcc > 4:56345/1‑135 (MQ=255) gCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCCTGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAAcggcc > 6:174688/1‑135 (MQ=255) gCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGGCGATGCCCACGCGCATGCCCGACCCCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCCGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCACcggcc > 6:252647/1‑135 (MQ=255) gCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAAcggcc > 1:37243/1‑135 (MQ=255) gCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGAAGCCCACGCGCATTACCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCATCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCCAcggcc > 7:205707/1‑135 (MQ=255) gCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCCGCCCATGGCGGCGATGCCCCCGCGCCTTCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGGGGTGGTGGTGGCCCCAcggcc > 5:210015/1‑135 (MQ=255) gCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCCCCCCACCCGGCCCCAGCCGACGATGCCCACGCGCAACCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGAAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCACcggcc > 1:258528/1‑135 (MQ=255) gCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCCCCCCACCCCGCCCCTGCCGCCCATGCCCACCCGCAAGCCCGCCCCCTGCCGGGCCACTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGGGGTGCTGGTGGCCCCAccgcc > 6:277688/1‑135 (MQ=255) gCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACAGCCCGCCCGCCCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGCCACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCCGCGGCGGGGTGCTGGTGGCCCCGcggcc > 3:9374/1‑135 (MQ=255) aGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGcgaa > 8:111069/1‑135 (MQ=255) gCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGGCCCCGCCCCTGCCGGCGCTGCCCCCGCGCCTGCCCGCCCCCTGCCGGGGCCGGGGGAGCGGTGCCCCCGGCGGGGGGGGGGTGGGCCCCCCGCCcgcgcggccg > 6:209614/1‑131 (MQ=255) tGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGCCCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGcgaacgaa < 5:181565/135‑1 (MQ=255) gcccgcTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCgg < 3:203516/135‑1 (MQ=255) cccgcTGTGCTACCGCCCGCCCGCCCCGGCCCCTGCCGCCGATGCCCCCGCGCATGCCCGCCACCAGCCGGGCCAGGGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGGGGGGGTGGCCCCCCGGCCGGCGCGCACGAAGCGGt > 4:183319/1‑135 (MQ=255) cccgcTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGCACGAAGCgg > 6:136950/1‑134 (MQ=255) cccgcTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGt < 5:74241/135‑1 (MQ=255) cccgcTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGt < 8:233733/135‑1 (MQ=255) cccgcTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGt < 8:328855/135‑1 (MQ=255) cccgcTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATCCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGt < 3:205091/135‑1 (MQ=255) cccgcGGGGCTCCCGCCCGCCCGCCCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGt < 3:219525/135‑1 (MQ=255) gtgCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGTCACCgg < 2:291779/135‑1 (MQ=255) tgCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGTCACCGGt < 4:82676/135‑1 (MQ=255) cgcccgccCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACCCCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGTCACCGGTGCAGAt < 3:56345/135‑1 (MQ=255) cgcccgccCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGTCACCGGTGCAGAt < 5:174688/135‑1 (MQ=255) gcccgcccgcccCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGTCACCGGTGCAGATc < 1:309376/135‑1 (MQ=255) gcccgACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCCCGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGTCACCGGTGCAGATccccc > 8:88055/1‑135 (MQ=255) | AGCGCATCGCTGTCCTTGGCCAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACCGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGTCACCGGTGCAGATCCCCC > KT2440/1900187‑1900445 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |