| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | KT2440 | 3,912,321 | T→G | 20.4% | S820A (TCG→GCG) | mexB_2 → | Multidrug resistance protein MexB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | KT2440 | 3,912,321 | 0 | T | G | 20.4% | 127.8 / 4.6 | 88 | S820A (TCG→GCG) | mexB_2 | Multidrug resistance protein MexB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/30); new base G (11/9); total (47/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGTCGAAGACTTGCTGAACATTCACGTGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGTCTGGAATGGACCGGCCTGTCACTGCAGGAGCGGCTGT > KT2440/3912191‑3912450 | ggTCGAAGACTTGCTGAACATTCACGTGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGCCCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGGGTCGag > 3:65003/1‑134 (MQ=255)ggTCGAAGACTTGCTGAACATTCACGTGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGAt > 1:211343/1‑135 (MQ=255) gAAGACTTGCTGAACATTCACGTGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCa > 7:241130/1‑135 (MQ=255) aaGACTTGCTGAACATTCACGTGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAg > 3:98463/1‑135 (MQ=255) aaGACTTGCTGAACATTCACGTGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAg > 6:316770/1‑135 (MQ=255) aaGACTTGCTGAACATTCACGTGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGGGGCTCTCAg > 8:263454/1‑135 (MQ=255) cTTGCTGAACATTCACGGGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGGGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGa < 7:263454/135‑1 (MQ=255) tGAACATTCACGTGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACACCGGTTACCCGGCGGTGGGGCTCGCAGGCGCGccgg > 7:305410/1‑133 (MQ=255) tGAACATTCACGTGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTg < 4:44812/135‑1 (MQ=255) gAACATTCACGTGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTgc > 2:188918/1‑135 (MQ=255) gAACATTCACGTGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTgc > 2:194381/1‑135 (MQ=255) gAACATTCACGTGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTgc > 5:112828/1‑135 (MQ=255) aCATTCACGTGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTTGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTgc < 3:247164/133‑1 (MQ=255) aCATTCACGTGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTgc < 3:166055/133‑1 (MQ=255) tCACGTGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCgg < 4:300318/135‑1 (MQ=255) tCACGTGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGGCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCgg < 8:38476/135‑1 (MQ=255) aCGTGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGCTCTCAGGCGAGCCTGCCGCCCGCt > 3:188969/1‑135 (MQ=255) aCGTGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGTCGAGCCTGCCGCCGGCt > 4:99744/1‑135 (MQ=255) tGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACa < 8:91122/135‑1 (MQ=255) gcAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGGCGCTCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCGACACCt > 6:207063/1‑135 (MQ=255) aaCGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCACCTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCGGCCGCCGGCGACaccgcg > 7:130514/1‑130 (MQ=255) aaCGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGCTCTCAGGCGCGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCg > 3:291334/1‑135 (MQ=255) aaCGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGCTATCCGGCGCGCCAGCCCCCGGCGACCGcgcc > 6:193171/1‑132 (MQ=255) cAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGa > 8:150901/1‑135 (MQ=255) aGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAg < 8:61110/135‑1 (MQ=255) aGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTGCGTGCAGGCCAGGTGGGGCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAg < 1:127219/135‑1 (MQ=255) gCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGGCGCTCTCAGGCGCGCCTGCCGCCGGCGTCAGCTCGGGCGCgg > 5:286226/1‑135 (MQ=255) cAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCAGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCAt > 3:127578/1‑135 (MQ=255) cAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGGGGGACACAGGCGCGCCTGCCCCCGGCGACCGGACCGGCCAGGccct > 8:287494/1‑133 (MQ=255) aGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATgg < 2:211343/135‑1 (MQ=255) ccccTGGGCGGGTGCGGGCCGGCCTGGTGGGCCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTc < 5:259172/132‑1 (MQ=255) tGGGCGCGGTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCGGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGc < 4:252915/135‑1 (MQ=255) ggCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGCTCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGCgg > 6:120634/1‑135 (MQ=255) cgTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGCGGCtgg < 1:188918/135‑1 (MQ=255) cgTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGCGGCtgg < 1:194381/135‑1 (MQ=255) gTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGCGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCCTGGCCGCAGTCGCGCGGCtggt > 6:133985/1‑135 (MQ=255) gTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGCGGCtggt > 7:65417/1‑135 (MQ=255) gTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCGACAGCTCGGGCGCGGCCCTGGCCGAAGTCGAGCGGCtggt > 6:61468/1‑135 (MQ=255) ttCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGTTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGGCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGCGGCtggtg < 4:260845/135‑1 (MQ=255) cGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGCGGCTGGTGgc > 8:172003/1‑135 (MQ=255) gTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGGGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTAGCTCTCAGGCGAGCCAGCCGCCGGCTACAGCTCCGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGCGGCTGGTGgcg > 3:169027/1‑135 (MQ=255) ccggCCCGGTGGGGCCGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACACCGGTTCCCCGGCGGTGTCGATCTCCGGCGAGCCGGCCGCCGGCTACCGCGCGGGCGAGGCCAGGGCCGAAGGCGAGCGGCTGGTGGCGCAg < 4:291334/133‑1 (MQ=255) cAGGCCCGGGGGGGCCGCGGCCCGGTGCAACGGACCCGCTCCACCGGTTACCCGGCGGGGGCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCGCGGGCGCGGCCATGGCCGAAGGCGAGCGGCTGGTGGCGCAg < 8:305410/135‑1 (MQ=255) cAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAAGTGACCCGGTACTACGGTTCCCGGGCGGGGTCGATCTCAGGCGAGCCGGCCGCCGGCTACAGCGCGGGCGAGGCCATGGCGGAAGTCGAGCGGCTGGTGGCGCAg < 4:77274/135‑1 (MQ=255) cAGGCCAGGTGGGGCCGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACACCGCTTACCCGGCGGGGCCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGCCGAGCGGCTGGTGGCGCAg < 7:242494/135‑1 (MQ=255) cAGGCCAGGTGGGGCCGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGGCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGCGGCTGGTGGCGCAg < 6:160308/135‑1 (MQ=255) aGGCCAGGGGGGGCCGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGATCCCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCGTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGCGGCTGGTGGCGCAg < 8:16291/134‑1 (MQ=255) cAGGGGGGTCACCGGCCCGGGGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGGGGCGATCTCCGGCGAGCCTGCCTCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGGCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTAcc < 8:264401/135‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGc > 1:264684/1‑70 (MQ=255) aGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGc < 2:264684/70‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTAccg > 4:208886/1‑135 (MQ=255) aGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGGCGATCTCACGCGAGCCGGCCGCCGGCTACCGCTCGGGCGCGGCCCTGGCCGCAGTCGAGCGGGTGGTGGCGCCGCTAccc > 6:208644/1‑134 (MQ=255) gTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGCGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCCGGGCCGCAGTCGAGCGGCTGGGGGGGCAGCTTccggc > 1:23939/1‑135 (MQ=255) gTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGCGCGGCTGGTGGCGCCGCTAccggc > 1:220901/1‑135 (MQ=255) ggtacAGCGGCCCGTTGCAACTCCCCCGCTACACCGGTTACCCGGCGGTGTCTATCGCTGGCGAGCCGCCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCAAGCCCGCAGTGTCGCGGCTGGGGGCGCAGCTAccggccg < 6:309046/131‑1 (MQ=255) gggcggCGGCCCGGGGCAACTGACCCGCTACAACGGTTCCCCGGGGGTGGCGAGCTCAGGCGCGCGGGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGTGGCCATGCCGGAAGTCGAGGGGCTGGTGGCGCAGCTAccggccgg < 7:63346/130‑1 (MQ=255) ggTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTGGAGCGCAGGCGCGCCTGCCGCCGGCGACAGCGCGGGCGAGGGCCTGGGCGGAGTCGCGGGGCTGGGGGCGCAGCGAcccggcgg > 6:208017/1‑135 (MQ=255) ggTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGGGCGGCCATGGCCGCAGTCGCGCGGCTGGTGGCGCCGCTAccggccg > 4:172959/1‑134 (MQ=255) ggTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGGCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTAccggccgg < 4:188969/135‑1 (MQ=255) ggTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGGGGAGCTCCGGCGGGCCTGCCGCCGGCTACCGCGCGGGGCAGGGCCTGGCCGGACGCGCGCGGCGGGTGGCGCCGCTAccggcccg > 6:212099/1‑133 (MQ=255) ggTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGGCGCTCTCAGGCGCGCCGGCCGCCGGCGACCGCTCGGGCGCGGCCAGGGCCGCAGGAGAGCGGCGGGGGGCGCCGCGTccggcccg > 7:300386/1‑133 (MQ=255) tCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCCGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCTAAGTCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTa < 7:115472/135‑1 (MQ=255) aGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACGCGGCGGTGGCGATCTCCGGCGCGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCAGGGCCGAAGTCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTAcc < 7:323274/135‑1 (MQ=255) gCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGGTCTCAGGCGCGCCTGCCGCCGGCGACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGCGGCTGGGGGCGCAGCTACCGGCCGGTTCCg > 7:170403/1‑135 (MQ=255) gCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCg > 4:278549/1‑135 (MQ=255) gCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCg > 4:278554/1‑135 (MQ=255) gCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGGGGCTCTCAGGCGCGCCTGCCGCCGGCGACAGCTCGGGCGCGGCCATGGCCGCAGTCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGGACCg > 6:6141/1‑135 (MQ=255) gCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGGGGCTCGCAGGCGAGCCGGCCCCCGGCGACACCGCGGGCGCGGCCCGGGCCGACGTCGAGCGGGGGGTGGCGCCGCTAccgcccggggccg > 7:149275/1‑130 (MQ=255) ggCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGAGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGt > 7:57809/1‑135 (MQ=255) ggCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTCACCCGGCGGGGTCGATCGCAGGCGAGCCGGCCGCCGGCTACAGCGCGGGCGCGGCCATGGCCGAAGGCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGt < 2:308495/135‑1 (MQ=255) cGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGCTCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGCGCGGCGGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGTCTg > 6:136532/1‑134 (MQ=255) tGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTAAGGCGAGCCTGCCGCCGGCGACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTGCAGCGGGTGGGGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGTCTGGCAt > 2:98975/1‑135 (MQ=255) gCAAGTGACCCGATACAAGGGTTCCCCGGCGGTGTCGTAGAGAGGCGAGCCTGCGGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGCCCTTGGCCGAAGTCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGTCTGGAATg < 5:67449/135‑1 (MQ=255) gCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGTGTGGAATg > 8:50971/1‑135 (MQ=255) gCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGTCTGGAATg < 8:270383/135‑1 (MQ=255) ccAACGGCCCCGCAACAACGGTCACCCGGCGGTGGCGAGCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCAACCGCTCGGGCGAGGCCAGGGCCGAAGGCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGTCTGGAATg < 7:38883/134‑1 (MQ=255) aaCTGACCCGCAACAAGGTTTACCCGGGTGTGTCTATGTCAGGAGTGCCTGCCGCCGTTTACAGCTGGGGCGTTGCCATGGCGGATTTCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGTCTGGAATTGa < 4:127578/135‑1 (MQ=255) cggACCCGCTACACCGGTCCCCGGGCGGGGGCGATCTCCGGCGCGCGTGCGGCCGGCTACCGCGCGGGCGCGGCCAGGGCCGAGGGCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGTCTGGAATGGAcc < 5:183849/133‑1 (MQ=255) cTGACCCGCTACAACGGTAACCCGGCGGGGTCGAGCTCAGGCGCGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCTTGGCCGAAGGCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGTCTGGAATGGAcc < 2:293992/135‑1 (MQ=255) ttaCCCGCGACAACGGTCACCCGGGGGTGTCTCTCGCTGCCGCGCCGGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCTAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGTCTGGAATGGACCg < 6:22096/133‑1 (MQ=255) gACCCGCTACAACGGTTACCCGGGGGTGTCGATCTCCGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGCGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGTCTGGAATGGACCgg < 1:26216/135‑1 (MQ=255) gACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGGCGATCTAACGCGCGCCTGCCGCCCGCGACCGCTGCGGCGCGGCCATGGCCGAAGTCGCGCGGCGGGTGGCGCAGCTACCCGCCGGGACCCGGCGGGCATGGCCCgg > 7:252752/1‑135 (MQ=255) cGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTAGATCTAAGGCCAGCCTGCAGCCGGCTACAGCTCGGGCGACGCCATGGCCGAAGTCCAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGTCTGGAATGGAGCGGCCTg > 6:316869/1‑135 (MQ=255) aCAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGTCTGGAATGGACCGGCCTGTCAc < 1:34449/135‑1 (MQ=255) tccccGGCGGTGCCGAGCCCCGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCAGGGCCGAAGTCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGTCTGGAATGGACCGGCCTGTCACTGCAGGAg < 2:136166/133‑1 (MQ=255) ccgcgggggTGGCGAGCTCGGGCGCGCCGGCCGCCGGCTACCGGGCGGGCGAGGCCCGGCCCGATGGCGCGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGTCTGGAATGGACCGGCCTGTCACTGCAGGAg < 5:193171/131‑1 (MQ=255) cggcggTGTCGCTATCACGCGAGCCTGCCGCCGGCTACCGCGCGGGCGAGGCCCTGGCCGAAGTCGCGCGGCTGGTGGCGCAGCTAACGGCCCGTACCGGTCTGGAATGGCCCGGCCTGTCACTGCAGGAGCGGc > 4:112429/1‑135 (MQ=255) cggGGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCGCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGTCTGGAATGGACCGGCCTGTCACTGCAGGAGCGGCTGt < 4:15890/135‑1 (MQ=255) | GGTCGAAGACTTGCTGAACATTCACGTGCGCAACGACAGCGGCAAGATGGTGCCACTGGGCGCGTTCGTGCAGGCCAGGTGGGTCAGCGGCCCGGTGCAACTGACCCGCTACAACGGTTACCCGGCGGTGTCGATCTCAGGCGAGCCTGCCGCCGGCTACAGCTCGGGCGAGGCCATGGCCGAAGTCGAGCGGCTGGTGGCGCAGCTACCGGCCGGTACCGGTCTGGAATGGACCGGCCTGTCACTGCAGGAGCGGCTGT > KT2440/3912191‑3912450 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |