| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | KT2440 | 4,029,463 | A→C | 26.5% | D290A (GAC→GCC) | mcpU_3 → | Methyl‑accepting chemotaxis protein McpU |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | KT2440 | 4,029,463 | 0 | A | C | 26.5% | 95.5 / 5.2 | 75 | D290A (GAC→GCC) | mcpU_3 | Methyl‑accepting chemotaxis protein McpU |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (26/26); new base C (11/10); total (39/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCAGGCACTGAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGACGCCCAGCCCTGGGGCG > KT2440/4029329‑4029588 | gCAGGCACTGAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATTCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGCCCCGGTAGa > 8:183264/1‑135 (MQ=255) aGGCACTGAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCGCCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGCTGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGCCCAGGTAGAcc > 7:338931/1‑135 (MQ=255) aGGCACTGAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGAcc > 4:221923/1‑135 (MQ=255) aGGCACTGAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCGTCGACCAGGGAGAcc > 3:25832/1‑135 (MQ=255) cACTGAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCCGCGCTTCGCCCAGGTAGCCCCGa > 4:327880/1‑135 (MQ=255) agggAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGAc < 8:120154/132‑1 (MQ=255) aCTGAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCCCGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGAc < 8:278838/135‑1 (MQ=255) gAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGccc > 3:99717/1‑133 (MQ=255) ccAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGTCTGGCTACCGCGCCGATGCCCGCAATCTGGGCCACCCCGTCGCCCCCGGAGGCACCACCAAAgg > 4:174715/1‑135 (MQ=255) cAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGCTGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGCCCCGACCAAAGgc > 4:120964/1‑135 (MQ=255) cggaggCCAGCCGCCGCCTCTACCACGGCCGCACCCCGGGCGGCATTCTCCCCCCGGGCGGTGTGTGGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCCGGTAGACCCGACCAAAcgcg < 5:10349/134‑1 (MQ=255) aggaggCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGgcg < 8:32245/135‑1 (MQ=255) ggCCAGCCGCAGCCTCTACGACGGCCGCACCACGGGCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGa < 7:173275/135‑1 (MQ=255) gCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAg > 1:95335/1‑135 (MQ=255) gCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGGCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGCTTGCAGCCAGCTGGCCCCGCGCAGCGCCCACGTTGCCCCGCCCAACCGCGccccg > 5:109262/1‑132 (MQ=255) ccGCAGCCTCTACGACGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGt < 6:177093/135‑1 (MQ=255) ccGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCCAGCTGGCCCCGCGCTTCGCCCCGGTTGCCCCGCCCCAAGGCGCCGGGCGGGt > 7:50733/1‑135 (MQ=255) cGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGGATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGCTGCCCGGCAGCTGGCCCAGGGCTTCGGCCCGGTTGCCCCGACCCAAGGCGCCGAGCGGGTg > 5:194430/1‑135 (MQ=255) cGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGCTGCCAGCCAGCTGGCCCAGCGGTTCGGCCAGGGAGACCCCACCCAAGGCGCCGAGCTGGTg > 1:263647/1‑135 (MQ=255) aCGAAGGCCGCACCACGGCCGGCATTCTCACCCCGGGCGGTCTGTTGGCCGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCt < 5:112711/133‑1 (MQ=255) gAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCGGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCCGCCAGCTGGCCCCGCGCGTGGACCAGGGTGCCCCGCCCCAAGGCGCCGCGCGGGTGGGCACGCGGGcc > 1:129768/1‑135 (MQ=255) gAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGGCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGCTGCCAGCCAGCTGGCCCCGCGCGTCGACCCGGTGGACCCGCCCCAAGGCGCCGCGCGGGTGCGCCAGCTGGcc > 1:125562/1‑135 (MQ=255) cGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCCGCAAGCTGGCCCAGCGCGTCGCCCAGGGAGCCCCGACCCAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGCTgg > 7:282726/1‑134 (MQ=255) gCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGACAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCCACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCCATTGCa > 7:37677/1‑135 (MQ=255) caccacGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCCGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCCGGTAGCCCCGCCCAAAGGCGCCGCGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGCTGGCaa > 8:14708/1‑135 (MQ=255) ccacGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGCTGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCGTCGACCCGGTAGACCCGCCCAAACGCGCCCAGCGGGTGCGCAAGCAGGCCGAAGGCAAGc > 2:198969/1‑135 (MQ=255) ccacGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATTCCAGCAAGCTGGCCCCCCGCTTCGCCCAGGTTGACCCGCCCCAACGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATgggcagc > 6:183230/1‑130 (MQ=255) ccacGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATTCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCGTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGCGCAGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCaa > 4:199773/1‑133 (MQ=255) cacGGTCGGCATTCTCACCCCGGGCGGGCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCt < 6:107017/135‑1 (MQ=255) gggTCGGAATTCTCACCCGGGTCGGGCTGTTGGCGGGCTACAGCGCCGATGCCAGCATGCTGGCCCTGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGa < 2:185609/134‑1 (MQ=255) cGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGaccac > 8:275250/1‑135 (MQ=255) aTTCTCCCCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATTCCAACCAGCAGGCCCAGCCCGTCGACCACGTAGACCCCACCCAAGGCCCCGACCTGGTGCGCAAGCTGGCCGCTTGCAAGCAGACCAcccac > 3:187021/1‑133 (MQ=255) ttCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCCGCGCTTCGCCCAGGGAGACCCGAACAAAGGCGCCGCGCTGGTGCGCAAGCGGGCCGGAGGCCAGCTGCCCCCCCAcc > 8:171523/1‑135 (MQ=255) aCCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCATCGCCCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCAGGTGCGCAAGCTGGCCGCAGGCAAGCTGACCACCCTCCACGAc > 4:19124/1‑135 (MQ=255) cccGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCg < 7:208173/135‑1 (MQ=255) cccGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCg > 7:160519/1‑135 (MQ=255) cccGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCg < 8:338931/135‑1 (MQ=255) cccGGTCGGTAGTTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCg < 8:248267/135‑1 (MQ=255) cccGGGCGGGCTGGTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCg < 4:188857/135‑1 (MQ=255) ccGGTCGGGCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCgg < 6:49375/135‑1 (MQ=255) tcggtcTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCCGCGCGTGGCCCAGGGAGCCCCGCCCAAAGGCGCCGCGCTGGTGCGCCAGCAGGCCGAGGGCCAGCGGCCCCCCCTCCCCGcccccgcgc > 5:51414/1‑129 (MQ=255) ggtcTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCCAGCTGGCCCAGCGCGTCGCCCAGGTAGCCCCGCCCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCCAGCGGACCACCCGCCACGACCGGCCgcgc > 1:294072/1‑135 (MQ=255) ggtcTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGCCCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGCCCGGCAgcgc > 7:132846/1‑135 (MQ=255) ggtcTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGCCCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGCCCCCCCTCCACGACCGGCAgcgc > 1:205569/1‑135 (MQ=255) gtcTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCt > 6:61095/1‑135 (MQ=255) gggtgggcgggccACCGCGCCGATGCCCGCAAGCGGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTACACCCCACCAACGGCGCCGAGCGGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTg < 5:18315/130‑1 (MQ=255) tggctggcTACAGCGCCGATGCCATCACGCTGCCCCAGCGGTTCGACCTGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGGTGTTGGGCAAGCTGGCGGATGGCAAGCTGACCTCCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAgg < 6:142657/135‑1 (MQ=255) ggctACCGCGCCGTGGCCAGCACGGTGCCCCAGCGCTTCGCCCAGGAAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTTCGAAAGCGGGCCGATGGCAAGCTGACAACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTg < 6:43847/135‑1 (MQ=255) ggctACCGCGCCGATGCCACCAAGCGGCCCCAGCGCTTCCACATGGTACACCCCACACACGGCGCCGAGCGGGTGCGCAAGCGGGCCGTTGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTg < 8:306032/135‑1 (MQ=255) tACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGCCCAGGTAGACCCGCCCAAAGGCGCCGCGCTGGTGCGCAAGCAGGCCGATGGCAAGCTGCCCACCCACCCCGCCCGGCAGCGGGTGAAGGTGCTggcg > 6:278546/1‑135 (MQ=255) tACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGCGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTggcg > 2:216169/1‑135 (MQ=255) ccgcgcCGAGCCCCGCACGGGGGCCCCGCGCTGCCACCAGGACCCCCCCCCCAACGGCGCCGCGCGGGGGCGCAAGCTGGCCGAGGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTggcggc < 5:67222/133‑1 (MQ=255) cGATGCCCGCAAGCTGGGCCCGCGGGTCGACCAGGGAGGCCCGACCAAAGGCGCCGCGCTGGTGCGCAAGCGGGCCGATGGCCAGCTGACCCCCCTCCCCCACCCGCCGCGGGTGAAGGTTCTGGCGGCATTCCg > 6:27890/1‑135 (MQ=255) cGATGCCAGCAAGCTGGCCCCGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCCAGCTGACCACCCTCCACGCCCGGCCGCGCTTGCAGGTGCTGGCGGCATTCCg > 3:51866/1‑135 (MQ=255) ccAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCaa > 8:108505/1‑135 (MQ=255) gaaaGCTGGCCCAGGGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGTGCTGGGGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATcc < 8:37677/133‑1 (MQ=255) gCATGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTACACCCAACAAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCACCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATcc < 4:311227/135‑1 (MQ=255) acgcgggCCCAGCGCTTCGCCCAGTTAGCCCCGACCAAAGGCGCCGCGCTGGGGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATcc < 2:46180/128‑1 (MQ=255) gCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCCAGCTGCCCACCCTCCACGCCCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCggc > 3:106071/1‑134 (MQ=255) cgggCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 5:117923/133‑1 (MQ=255) cgggCCCAGCGCTACCACCCGGTACCCCCGACAAACGGCGCCGCGCTGGGGCGCAAGCTGGCCGATGGAAAGCTGACCCCCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 5:183230/133‑1 (MQ=255) cggcccccGCGCTTCGACCAGGTACCCCCGACAAACGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCCCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 3:174956/131‑1 (MQ=255) cggccccAGCGCTTCGCCCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 7:201995/131‑1 (MQ=255) cTGGCCCCGCGCTTCCACCCGGTAGCCCCGACCAACGGCGCCGAGCGGGGGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 1:129462/135‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGCGCTTCGACCCGGTCCCCCCGACCAACGGCGCCGAGCTGGGGCGCAAGCTGGCCGATGGAAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 4:323254/135‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAACGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 4:275326/135‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 3:221923/135‑1 (MQ=255) tgccccGGCGCTCCGCCCAGGTCTCCCCGCCCAACGGCGCGGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 3:19124/131‑1 (MQ=255) tGGCCCTGCGCTTCGACCAGGAATCCCCGACCAACGGCGCCGTGGTGGTGCGCATGCTGGCCTATGCCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGAc < 1:198969/134‑1 (MQ=255) ggCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGACGc < 2:95335/135‑1 (MQ=255) gcTTCGACCTGGTCGCCCCTCCCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCATGCTGGCCGATGGCAAGCTTACCCCCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGACGCCCAGCCCt < 2:272897/135‑1 (MQ=255) ttCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGACGCCCAGCCCTgg > 4:92280/1‑135 (MQ=255) tCGACCAGGTCGACCCGACCAACGGCGCCGAGCGGGTGCGCAAGCGGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGACGCCCAGCCCTggg < 3:115179/135‑1 (MQ=255) gccccggTAGCCCCGACCAACGGCGCCGCGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGACGCCCAGCCCTggg < 7:91574/128‑1 (MQ=255) aCCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGACGCCCAGCCCTGGGGCg > 7:334175/1‑135 (MQ=255) aCCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGACGCCCAGCCCAGGGGCg > 7:276659/1‑135 (MQ=255) | GCAGGCACTGAGCCAGGAGGCCAGCCGCAGCCTCTACGAAGGCCGCACCACGGTCGGCATTCTCACCCCGGTCGGTCTGTTGGCTGGCTACAGCGCCGATGCCAGCAAGCTGGCCCAGCGCTTCGACCAGGTAGACCCGACCAAAGGCGCCGAGCTGGTGCGCAAGCTGGCCGATGGCAAGCTGACCACCCTCCACGACCGGCAGCGCTTGAAGGTGCTGGCGGCATTCCGGCCAATCCCGGACGCCCAGCCCTGGGGCG > KT2440/4029329‑4029588 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |