| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | KT2440 | 4,079,259 | G→A | 5.9% | A105T (GCC→ACC) | dadA → | D‑amino acid dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | KT2440 | 4,079,259 | 0 | G | A | 5.9% | 210.7 / 2.1 | 73 | A105T (GCC→ACC) | dadA | D‑amino acid dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/38); new base A (2/2); total (33/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
GGCAACTGAGCGCACTGCTGCGCTACGGCCTGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAGCCAAAGGCTGGATCGAAGTGTTCCGCGACCCCGCGCTGTTC > KT2440/4079125‑4079390 | ggCAACTGAGCGCACTGCTGCGCTACGGCCTGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGgcg < 3:304403/135‑1 (MQ=255)ggCAACTGAGCGCACTGCTGCGCTACGGCCTGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGGGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGgcg < 2:286200/135‑1 (MQ=255) gCAACTGAGCGCACTGCTGCGCTACGGCCTGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGgcgc < 7:210141/135‑1 (MQ=255) cAACTGAGCGCACTGCTGCGCTACGGCCTGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCCCCCGGGCGCCTGGCCGGcgcc > 5:283802/1‑135 (MQ=255) cAACTGAGCGCACTGCTGCGCTACGGCCTGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGcgcc > 1:94750/1‑135 (MQ=255) gcgcACTGCTGCGCTACGGCCTGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGGCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCgccgccgcc < 8:298318/134‑1 (MQ=255) tgcGCTACGGCCTGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCACGGCCGCACCGTGGCGGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGc < 6:257204/135‑1 (MQ=255) tgcGCTACGGCCTGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGc < 4:117841/135‑1 (MQ=255) tgcGCTACGGCCTGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGc < 7:105800/135‑1 (MQ=255) ggcgcTACGGCCTGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGc < 7:1392/134‑1 (MQ=255) tACGGCCTGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGACCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGCTATGTTGCCGCTg > 5:55452/1‑135 (MQ=255) tACGGCCTGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCGGCCGAAGCCGGCACCGTGGCTGGGGCGTTACTGGCGCCAGTGGGCACCCGGGCGCCTGGCGGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTg < 3:78203/135‑1 (MQ=255) ccTGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGGTATGTTGCCGCGGGTGCa > 1:227562/1‑135 (MQ=255) ccTGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGCGATGTTGCCGCTGGTGCa > 7:299510/1‑135 (MQ=255) ccTGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCa > 8:20962/1‑135 (MQ=255) ccTGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCGGGCCGGCCCCCCCGCCGAGAAGTTTGCCCTGGTggc > 5:23584/1‑133 (MQ=255) ttacccgcccgcCCGAGGGGCGCTACCGCCGGGCGCACGGGCCCAAGGCCGCACCGTGGCGGGGGCGTTACTGGCGCCAGGCGGCACCCGGGCGCCGGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAgc < 6:185965/131‑1 (MQ=255) tGACCCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAgc < 3:267559/135‑1 (MQ=255) tGAACCGCCAGCCCGTGGGGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCACGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGGCGGCACCCGGGCGCGTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAgc < 4:192099/135‑1 (MQ=255) tGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACCGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCCCCCGGGCGCCTGGCCCGCGCCGCCCCCGCTATGTTGCCGCTGGTGCCgc > 7:182481/1‑135 (MQ=255) tGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGGCGCCGCCGCTTTGTTGCCGCTGGTGCAgc > 2:105530/1‑135 (MQ=255) tGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGCTATGTTGCCGCTGGTGCAgc > 2:100909/1‑135 (MQ=255) tGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAgc > 7:111990/1‑135 (MQ=255) ccAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTgtgt < 8:237186/135‑1 (MQ=255) gCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCCCCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCGGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTTGCGCTGGTGCAGCGCGGTGGcga > 8:9258/1‑135 (MQ=255) gCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGatat > 4:189194/1‑108 (MQ=255) gCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGatat < 3:189194/108‑1 (MQ=255) gCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTcga > 4:299168/1‑135 (MQ=255) gCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCGGTGTcga > 6:60174/1‑135 (MQ=255) cgcTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTCCTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGAc < 5:75730/135‑1 (MQ=255) aGCCTGGCGCACCTGACCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCt < 6:55452/134‑1 (MQ=255) ccTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCCCCCGGGCGCCTGGGCGGCGCCGCCGCCGATATGTTTCCGCTGGGGCAGCGCGGTGTCGGCGCGCAGGACgcgcggct > 1:41720/1‑131 (MQ=255) gcACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTgc < 7:334042/135‑1 (MQ=255) aCCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCGGGGCGGCGCCGCCGCCGCGATGTTTCCGCGGGGGGAGCGCGGGGTGGCCGCGGCTGACGCGCGGGTCGcgggcg > 1:100448/1‑130 (MQ=255) cTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTgccgcc < 3:8043/135‑1 (MQ=255) gCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCgg > 6:316867/1‑135 (MQ=255) cccAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGCTATGTTGCCGCTGGTGGAGCGCTGTGGGGGCGCGCCTGGCGCGCTGATCGCTGCCGCCGGc > 3:233865/1‑135 (MQ=255) ccAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGcc < 1:10568/135‑1 (MQ=255) ccAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGcc < 5:91012/135‑1 (MQ=255) ccGCCCCGGGGCGGGGGCGTTACGGGCGCCCGTCGGCACCGGGGCGCCGGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAg < 5:34591/135‑1 (MQ=255) ccGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAg < 8:196868/135‑1 (MQ=255) ccGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAg < 4:240370/135‑1 (MQ=255) ccGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCGGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAg < 3:30892/135‑1 (MQ=255) ccGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGGCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAg < 5:109419/135‑1 (MQ=255) ccGCACCGGGGCGGGGGCGGTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCGGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAg < 6:19392/135‑1 (MQ=255) cGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGCCGCGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCGGGAAgg > 7:333155/1‑135 (MQ=255) cggggCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCGGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTgg < 4:286450/132‑1 (MQ=255) cggggCGGTGGCGTTACTGGCGCCCGGCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTgg < 6:183961/132‑1 (MQ=255) cGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGCTATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTAGCCGAGCATGACGCGCGGATCGCTGCCGCCGGCCGGGAAGGCCTgg > 6:91012/1‑135 (MQ=255) cGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCGGGAAGGCCTgg > 7:184205/1‑135 (MQ=255) cGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCGGGCCGGCGCCGCCGCCCCTATGTTTCCGCTGGTGCAGCGCGGGGTCGCCGAGCCTGACGCGCTGCTCGCTGCCGCCCGCCGGGGAGGCCggg > 6:235604/1‑135 (MQ=255) cTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCCGCGCGGGGTCGCCGCGCCTGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCGGGATGGCCTGGGGCaa > 7:115536/1‑135 (MQ=255) cTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCaa < 3:52369/135‑1 (MQ=255) cTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCCCCGCCGCCGATATGTTGCCGCGGGTGCAGCGCTGGGTAGACGCGCAAGACCCCCAGATCGCTGCCGCCGGCCGGGAAGGCCTGGTGCaa > 7:326385/1‑135 (MQ=255) tgtgGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAg < 2:94750/135‑1 (MQ=255) gCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAGCCaa < 8:288173/135‑1 (MQ=255) cGTTACTGGCGCCAGTCGGCCCCCGGGCGCCGGGCCGGCGGCGCCGCCGCGATGTTGCCCCGGGGGCAGCGCGGTGTCGCCGCGCAGGCCGCGCTGCTAGCGGCCGCCCGCCGGGCCTGCCGGGTGCAAggccaa > 6:34794/1‑130 (MQ=255) cGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGCTATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCGGTGTCGACGCCCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCCGCCTGGCAGGCCGGGTGCAAGCCaaa > 4:15403/1‑135 (MQ=255) cGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAGCCaaa > 1:7874/1‑135 (MQ=255) cGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCCCCCCTATTTTTCCGCTTGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGCTAGCTGCCGCCCGCCGGGTAGGCCAGGGGCAAGCCaaa > 5:298334/1‑135 (MQ=255) gTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAGCCAAAg < 2:100448/135‑1 (MQ=255) ttACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCGGTGTCGCCGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCGGGAAGGCCTGGTGCAAGCCAAAgg > 3:130376/1‑135 (MQ=255) cTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAGCCAAAGGCt < 2:7874/134‑1 (MQ=255) ggCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGTCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAGCCAAAg > 7:112595/1‑129 (MQ=255) ggCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGTCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAGCCAAAg < 8:112595/129‑1 (MQ=255) ggCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAGCCAAAGGCTGGa < 8:29595/135‑1 (MQ=255) aGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCCGCCCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGCCCAGCCAGACGCGCGGATCGCTGCCGCCGGCCGGGCAGGCCTGGTGCAAGCCAAAGGCTGGATCgcac > 2:184854/1‑132 (MQ=255) ggCACCCGGGCGCGTGGCGGGCGCCGCCGCCGTTATGTGGCCGATGGTGCAGCGGTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAGCCAAAGGCTGGATCGAAGTGtt < 6:69518/135‑1 (MQ=255) ggCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAGCCAAAGGCTGGATCGAAGTGtt < 7:144045/135‑1 (MQ=255) ggCACCCGGGCGCCGGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGGGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCGGCCGCCGGCCTGGACGGCCTGGTGCAAGCCAAAGGCTGGATCGAAGTGtt < 4:103286/135‑1 (MQ=255) aCCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCCCTGTGTCGACGAGCAGGCCGCGCGGCTCGCTGCCGCCGGCCGGGGAGGCCGGGGGCCACGCAAATGCGGGAGCGGAGTCTTCcg > 3:302399/1‑135 (MQ=255) cgcCTGGCCGGCACCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAGCCAAAGGCTGGATCGAAGTGTTCCGCGAcccc > 8:255603/1‑135 (MQ=255) cgcCGGGCCGGCGCGGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCGGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAGCCAAAGGCTGGATCGAAGTGTTCCGCGAcccc < 1:74763/135‑1 (MQ=255) cgcCAGGCCGGCACCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAGCCAAAGGCTGGATCGAAGTGTTCCGCGAcccc > 8:251206/1‑135 (MQ=255) ggCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAGCCAAAGGCTGGATCGAAGTGTTCCGCGACCCCGCGCTGTTc < 7:20962/135‑1 (MQ=255) ggCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAGCCAAAGGCTGGATCGAAGTGTTCCGCGACCCCGCGCTGTTc < 3:15403/135‑1 (MQ=255) ggCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCGGGTGCAGCGCGGTGTCGACGAGCATGACGCGCGGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAGCCAACGGCTGGATCGAAGTGTTCCGCGACCCCGCGCTGTTc < 5:253750/135‑1 (MQ=255) ggCACCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAGCCAAAGGCTGGATCGAAGTGTTCCGCGACCCCGCGCTGTTc < 7:255603/135‑1 (MQ=255) ggCACCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAGCCAAAGGCTGGATCGAAGTGTTCCGCGACCCCGCGCTGTTc < 7:251206/135‑1 (MQ=255) | GGCAACTGAGCGCACTGCTGCGCTACGGCCTGAACCGCCAGCCCGATGTGCGCTACAGCCTGGCGCACCTGCCCAAGGCCGCACCGTGGCTGTGGCGTTACTGGCGCCAGTCGGCACCCGGGCGCCTGGCCGGCGCCGCCGCCGATATGTTGCCGCTGGTGCAGCGCTGTGTCGACGAGCATGACGCGCTGATCGCTGCCGCCGGCCTGGAAGGCCTGGTGCAAGCCAAAGGCTGGATCGAAGTGTTCCGCGACCCCGCGCTGTTC > KT2440/4079125‑4079390 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |