Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | KT2440 | 4,112,358 | T→G | 20.2% | V468G (GTC→GGC) | iorB_2 → | Isoquinoline 1‑oxidoreductase subunit beta |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | KT2440 | 4,112,358 | 0 | T | G | 20.2% | 133.8 / 2.6 | 91 | V468G (GTC→GGC) | iorB_2 | Isoquinoline 1‑oxidoreductase subunit beta |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/41); new base G (12/10); total (40/51) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.25e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CTTTGGCCGCCACTTCCTGTACGACTCTGCCAACCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGGAAAACAAGGGGAGAAGATCGACCCGACCGCGCTT > KT2440/4112224‑4112491 | cttTGGCCGCCACTTCCTGTACGACTCTGCCAACCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGGAGAGGCGTTGTTTCGCGCTGTAAAGCCCCCCGt > 4:212347/1‑135 (MQ=255) ggCCGCCACTTCCTGTACGACTCTGCCAACCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCg < 3:37708/133‑1 (MQ=255) cgccACTTCCTGTACGACTCTGCCAACCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAgtg < 3:195289/135‑1 (MQ=255) cgccACTTCCTGTACGACTCTGCCAACCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAgtg < 3:206933/135‑1 (MQ=255) cTTCCTGTACGACTCTGCCAACCCCTACCCGCCGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTGCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGGCGCAGTGGTGaa < 7:73643/135‑1 (MQ=255) ttCCTGTACGACTCTGCCAACCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTTCGCGATGTACTGCGCCCCGGCGCCGTGGTGAAg > 2:126268/1‑135 (MQ=255) tGTACGACTCTGCCAACCCCTACCCGCAGGCAATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑cc < 2:122955/135‑1 (MQ=255) aCGACTCTGCCAACCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑Ccg < 1:346630/133‑1 (MQ=255) gACTCTGCCAACCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCCTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGcc > 2:43393/1‑135 (MQ=255) ctGCCAACCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGGAGAGGCGTTATTTCGCGATGTACTGCGCCCCCGCGCAGTGGGGAAGGT‑GCGCGCCgggg > 1:366577/1‑134 (MQ=255) ctGCCAACCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGTGTTCTTGGGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGTAGTT‑CCGCGCCGGGc > 2:334591/1‑135 (MQ=255) ctGCCAACCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGTGTTATTGGGGGATGTACTGCGCCCCCGGGCAGTGGTTTAGGT‑ACGCGCCGGGc > 1:638/1‑135 (MQ=255) ctGCCAACCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGGTGTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGGCGCCGTGGTGGAGTT‑CCGCGCCGGGc > 1:45976/1‑135 (MQ=255) cAACCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGCTGAGGAGTTGTTTGGCGCTGTTCTGCGCCCCCGCGCAGGGGTGCAGTT‑GCGCGCCcggggggg > 5:41945/1‑130 (MQ=255) cAACCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTGTTTCGCGATGTACTGCGCCCCCGCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCGGGa > 5:137133/1‑135 (MQ=255) cAACCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTTCTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGcgg > 8:198988/1‑131 (MQ=255) cAACCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGCAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGa > 2:11522/1‑135 (MQ=255) cAACCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTATTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGa > 4:218083/1‑135 (MQ=255) aaCCCCTACCCGCAGGCCCTTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCGGTGGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGAc < 3:158095/135‑1 (MQ=255) aaCCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCGGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGGCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGAc < 4:209795/135‑1 (MQ=255) aaCCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGAc < 3:190170/135‑1 (MQ=255) aaCCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGAc < 3:121447/135‑1 (MQ=255) aaCCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGAc < 6:140645/135‑1 (MQ=255) aaCCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTAATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGAc < 4:175572/135‑1 (MQ=255) aCCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGCAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACg > 3:327432/1‑135 (MQ=255) ccccTCCCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTACTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGc < 1:280631/135‑1 (MQ=255) ccccTACCCGCCGGCCATTGCCCTGGCCAACGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGGCGCGACGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTG‑CCGCGCCGGGCTGGACGc < 6:53383/135‑1 (MQ=255) ccccTACCCGCCGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTGCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGc < 3:216643/135‑1 (MQ=255) ccccTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGc < 3:349954/135‑1 (MQ=255) ccccTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGc < 1:384473/135‑1 (MQ=255) ccccTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGGCGCAGTGGGGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGc < 2:389068/135‑1 (MQ=255) tACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGGAGAGGAGTTATTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGAc > 4:134538/1‑135 (MQ=255) tACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGAc > 7:373938/1‑135 (MQ=255) aCCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGTAGAGGTGGTCTTTGGCGCTGTACTGCGCCCCCGCGCAGTGGTGCAGTTGCCGC‑CCGGGGTGGACGCAGTCg > 6:335566/1‑135 (MQ=255) ccGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGTAGAGGAGTTCTTGGGCGCTGTAATGCGCCCCGGCGGCGTGGTGTAGTT‑ACGCCCCGCGCGGGTCGCAGACggg > 3:221879/1‑134 (MQ=255) ccGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGCAGATGAGTTCGTGCGGGATGTACAGCGCCCCGTCGCACTGGGGAAGTT‑CCGCGCCCGGCTGGACGCAGACggg > 8:101625/1‑134 (MQ=255) gCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCa < 8:148430/135‑1 (MQ=255) gCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCa < 8:373938/135‑1 (MQ=255) ccATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGGAGGGGGGGTGTTTCGCGGTGTACTGCGCCCCGGCGGCGTGGGGGGGGT‑TCGCGCCGGGGGGGGCGGAGACGGGGTGcccc > 5:262510/1‑133 (MQ=255) ccATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTATTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGGATGcccg > 6:128703/1‑133 (MQ=255) ccATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGGTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCCTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGGCGCAGCCGGTATGCCAg > 8:88183/1‑135 (MQ=255) gCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGCAGTT‑CCGCGCCGGGCGGGCCGCCGCCGGTATGCCAGTGgcg > 8:326548/1‑135 (MQ=255) cccTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGgcgc > 8:288366/1‑135 (MQ=255) cTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGCGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCGGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTc < 8:10412/135‑1 (MQ=255) tGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCg < 1:126268/135‑1 (MQ=255) gCCAAAGCGGGTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAg < 2:366577/135‑1 (MQ=255) ccAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGGAGAGGAGTTGTTGCGCGCTGTACTGCGCCCCGGCGCAGTGGTGCAGTT‑GCGCGCCGGGCGGGGCGCAGACGGTATGCCCGTGGCGCGCGAgg > 1:270221/1‑135 (MQ=255) cAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTG‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGc < 3:184131/135‑1 (MQ=255) aGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGt < 7:326548/135‑1 (MQ=255) ggTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGGGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAg > 6:98399/1‑135 (MQ=255) ggTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGGTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAg < 3:361328/135‑1 (MQ=255) ggccggccGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGcc < 6:58902/135‑1 (MQ=255) ggccggccGGTGAAGCTTAGCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGcc < 4:91620/135‑1 (MQ=255) tccggccggTGAAGCTTTTCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGGCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGcc < 2:274229/133‑1 (MQ=255) gccggccgGTGATGCTTATCTGGAGGCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCTCTCGAGGCGGTCAGTGcc < 6:322392/134‑1 (MQ=255) gccggccgGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGGAGCGGCGTTCTTTCGCGCTGTTATGCGCCCCCGCGCAGGGGTGGAGGT‑ACGCGCCCGGCGGGCCGCCCCCCGGATTCCAGTGGCGCTAGCGGCGGTCCGCGccc > 4:271837/1‑134 (MQ=255) gccggccgGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCa < 7:317281/135‑1 (MQ=255) gccggccgGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGGCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCGAGAGGCGGTCAGCGccc > 3:63545/1‑134 (MQ=255) cggTGAAGCTTATCTGGCGTCGCGAAGAGGAGTTCGTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGGGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAgg < 1:182938/135‑1 (MQ=255) cTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAAcc < 1:43393/135‑1 (MQ=255) aGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGGCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGccc < 7:122442/133‑1 (MQ=255) cgcgAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGCCGCAGACGGTATGCCCGTGGCGCTCGCGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCGTGCt > 3:375711/1‑135 (MQ=255) cgAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCGGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTg < 3:364220/134‑1 (MQ=255) aaGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCCTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCACTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGCCGCCCTTGCTGGa > 3:182378/1‑134 (MQ=255) gagtagTTCTTGGGTGATTTACTGCGCCCCGTCGCAGTTGTTAAGTA‑CAGCGCCGGGCTGGACGCAGACGTTATGGCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGGaaaa < 8:365248/135‑1 (MQ=255) gaggagTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCTGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGGaaaa < 1:44214/135‑1 (MQ=255) gaggagTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCTGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGATGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTGGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGGaaaa < 6:61396/135‑1 (MQ=255) gaggagTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGGaaaa < 1:3844/135‑1 (MQ=255) gaggagTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGGaaaa < 3:147353/135‑1 (MQ=255) aggagTTCTTGCGCGTTGTACTGCGCCCGGTCGCTGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGGAAAAc < 7:101625/135‑1 (MQ=255) gTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGGAAAACAAgg < 7:288366/135‑1 (MQ=255) cgATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGGAAAACAAGGGga > 6:143220/1‑129 (MQ=255) cgATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGGAAAACAAGGGga > 7:265699/1‑129 (MQ=255) gttGTACTGCGCCCCGGGGCTGTGGTGAAGGG‑CCGCGCGGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGCGGCCGTTGCTGTAAAACAAGGGGAGAAGATc < 7:392318/133‑1 (MQ=255) tACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGACGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGGAAAACAAGGGGAGAAGATcgacc > 6:341886/1‑135 (MQ=255) tACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTCAAGTT‑CCGCGCCTGGCAGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGAGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCATGCTGCAACACAAGGGGAGAACATagacc > 5:153285/1‑135 (MQ=255) cgggcgcCCCGGCGCAGTGGTGAAGTG‑CCGCGCCGGGCGGGACGCCGCCGGTAGGCCAGGGGCGCGCGCGGCGGGCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCTCGGCCCTTGCTGGAAACCAAGGGTAGAAGAGcgaccc < 3:316988/132‑1 (MQ=255) ccTGCGCCCGGGCGCTGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGGGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGGAAAACAAGGGGAGAAGATcgaccc < 3:360375/134‑1 (MQ=255) acggcgcCCCGTCGCTGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCAAACCGAGGCCCTTGCTGGAAAACATGGGGAGAAGATcgacc < 6:137133/131‑1 (MQ=255) acggcgcCCCGGCGCTGTGGGGACGTG‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTAGGCCAGGGGCGCGCGAGGCGGGCCGCGCCACCGCGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGGAAAACAAGGGGAGAAGATcgaccc < 2:45976/132‑1 (MQ=255) aCTGCGCCCCGGCGCTGTGGTGAAGTG‑CCGCGCCGGGCGGGACGCAGACGGTAGGCCAGGGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCATCGAGGGCCCAACCGCGGCCCTTGCTGCAAAACATGGGGAGAAGATcgaccc < 4:63545/135‑1 (MQ=255) cTGCGCCCCGTCGCTTTGGTGACGTT‑CCGCGCCGGGCGGGAGGCTGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCCGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGCCCCTTGCTGGAAAACAAGGGGAGAAGATcgcccc < 2:638/134‑1 (MQ=255) ggcgcCGGGTCGCTGTGGTGACGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACTCAGACGGTTTGCCTGTGGCGCGCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGTAAAACACGGGGATAAGATcgacccga < 7:391056/134‑1 (MQ=255) cgcCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGGAAAACAAGGGGAGAAGATcgacccgacc > 3:320007/1‑135 (MQ=255) gcCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGGaaaa < 3:37699/110‑1 (MQ=255) gcCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGGaaaa > 4:37699/1‑110 (MQ=255) cccGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGCGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCACCCGAGGCCCTTGCTGGAAAACAAGGGGAGAAGATCGCCCCGACcgcg > 2:207231/1‑135 (MQ=255) gTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCCCCGAGGGCCCACCCGAGGCCCTTGCTGGAAGTCAAGGGGAGAAGCTCGCCCCGACCGCGCt > 1:315819/1‑134 (MQ=255) gTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCACCCGAGGCCCTTGCTGGAAAACAAGGGGAGAAGATCGACCCGACCGCGCt > 2:45200/1‑134 (MQ=255) gTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGGAAAACAAGGGGAGAAGATCGACCCGCCCGCGCtt > 8:391056/1‑135 (MQ=255) gTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGGAAAACAAGGGGAGAAGATCGACCCGACCGCGCt > 6:190402/1‑134 (MQ=255) gTCGCAGTGGTGAACTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCACCCGAGGCCCTTGCTGGACAGCAAGGGGAGACGATCGACCCGACCGCGCtt > 6:152593/1‑135 (MQ=255) | CTTTGGCCGCCACTTCCTGTACGACTCTGCCAACCCCTACCCGCAGGCCATTGCCCTGGCCAAAGCGGTTGGCCGGCCGGTGAAGCTTATCTGGAGTCGCGAAGAGGAGTTCTTGCGCGATGTACTGCGCCCCGTCGCAGTGGTGAAGTT‑CCGCGCCGGGCTGGACGCAGACGGTATGCCAGTGGCGCTCGAGGCGGTCAGCGCCACCGAGGGCCCAACCGAGGCCCTTGCTGGAAAACAAGGGGAGAAGATCGACCCGACCGCGCTT > KT2440/4112224‑4112491 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |