| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2269346 | 1 (0.010) | 115 (0.960) | 92/294 | 0.1 | 99.1% | coding (595/1026 nt) | yejE | microcin C transporter YejABEF, permease subunit; ABC family |
| ? | CP009273 | 3576788 = | NA (NA) | intergenic (+10/‑55) | yrhA/insA | pseudogene, interrupted by IS1E/IS1 repressor TnpA | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
CTGACTCTCTGTTCCAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2269199‑2269346‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATC > CP009273/3576788‑3576933 CTGACTCTCTGTTACAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACTCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGG > 1:1342794/1‑149 GACTCTCTGTTCCAGCGTGGTGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCGACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGGCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGT < 2:600628/149‑1 ACTCTCTGTTCCAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTCTTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTACCAGCGTCGGGTG > 1:1406709/1‑149 ACTCTCTGTTCCAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTG < 2:391359/149‑1 TCTCTGTCCCAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGAT < 1:538805/149‑1 CTCTGTTCCAGCGTGATGGGCGTGCCGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATG < 1:238891/149‑1 TCTGTTCCAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGGGATGC > 1:374784/1‑149 TCTGTTCCAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCCGTCAAGTGGTTCTTTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGAAGCCGACGCTGTTTGTGATTATTTTACTTTCCCGGGGCGGGTGGTGC > 2:223492/1‑149 cgtgTCCAGCGTGCTGCGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTATATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCT < 2:1322679/145‑1 cgtcCCACCGTGATGGGCGTCCCGGCGGGGCCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGAATATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTG < 1:569946/145‑1 CCAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAA > 1:1378796/1‑149 CAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAgc > 1:72228/1‑147 CAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAAC > 1:851410/1‑149 AGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGCTTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACT < 2:123156/149‑1 AGCGTGATGGGCGGGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGGCAACGCTGTATTGAAGTATGGGAGGGGATGGCGACGCTGTTTTTGAGTATTTTACTTTCCAGCGGCGGGGGATGGTGCCcagt > 1:769470/1‑145 CGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTACAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTA < 1:926012/149‑1 CGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTTTTTTTTTTTCTTTCCAGCGTCCGGTGATGCTGCCCACTTc > 2:397689/1‑148 CGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTA > 1:1404634/1‑149 GTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTAC < 1:779791/149‑1 GTGATGGGCGTGCTGGCCGGGCCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGGATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTAC < 1:779461/149‑1 TGATGGGCGGGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACT < 1:1398179/149‑1 GGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCCGCGTCGGGGGATGCTGCCAACTTACTGATT > 1:1915230/1‑149 GCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGGTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGGGATGCTGCCACCTTACTGATTTg > 2:1849651/1‑148 GCGTGCTGGCGGCGGCGGTACAAGGCTACTACGGCGGTAAAGTCGATCCCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGCCGCGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 2:1002711/149‑1 GCGCGCTGCCGGGGGCCCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGAGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTCACTTTCCAGCGCCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTca < 2:813895/149‑3 GCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGAAAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 2:512606/149‑1 CTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGca < 1:779737/149‑3 CTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA < 2:1297021/149‑1 GGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTTGATTAGTGTATG > 2:1088201/1‑149 GCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAACGTCGCTCTCTGGGGCCAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 2:938439/1‑149 GCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAACTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 1:1312944/1‑149 GGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACCACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 1:758031/149‑1 GGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG > 2:128221/1‑149 CGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGGAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT > 2:1025497/1‑149 GCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTCGTGTATGTTGGTGTTT > 1:589336/1‑149 GCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT > 2:644858/1‑149 CTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGGGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGCATGATGGTGTTTT > 1:133992/1‑149 cACAAGGCTGTTACGGCGGTAAGGGCCATCTCGTGGGACAATGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 2:1860694/148‑1 TACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGGTTTT > 2:1380543/1‑149 ACACGGCTATTACGGCGGTAAAGGCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCGGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 2:1204083/149‑1 ACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCCCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 1:479836/149‑1 ACAAGGCCATTCCGGCGGTAAAGTCGATCTCTTGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 2:161394/149‑1 AAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG > 1:1126410/1‑149 AAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 2:1404634/149‑1 GGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATCTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 1:986970/149‑1 GGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCAGATTTTGATTATTTTTCTTTCCAGCGGCGGGTGAGGCTGCCAACTTACTGCATTTGTGCGTGACGGTGGTTGTGAGGT > 2:1019898/1‑149 GCTATTACGGCGGTAAAGGCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTCCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 1:1155873/149‑1 TATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCT > 2:892751/1‑149 ATTACGCCGGGAAAGGCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC < 1:1814666/149‑1 GGCGGTAAAGCCTCTCTTCGGCGTCAATGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG > 2:924714/1‑149 AAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCT < 1:1569121/149‑1 AAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTGCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG < 2:1728090/149‑1 GTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT > 1:1677866/1‑149 tctgTCTCTGGGGACAACGCTCTATTGAAGTATGGTCGGGTATGCCGACGCCGTTTTTGATTATTTTACTTTACAGCGTCGGTTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGCGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT < 1:307759/145‑1 TCGATCTGTGGTGTCAATGCTTTATTGAAGGATGGTCGGGGTTGCCGCCGCTGTTTTTGATTATTTTCCTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTTATTTCGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGTCTTCTGTTT < 2:1529131/149‑1 GATCCCTGGGGACAACGCCTTGATGGAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGCTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGGGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGATGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT < 1:1778334/149‑1 ATCTCGGCGGACAACGTTTTATTGATGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCTTCGGGTGATGCCGCCAACTTACTGATTTAGTGTATTATGTTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTTGCTTCTTTTTCTA < 2:166357/149‑1 TCTCTGGGGACGACCCCTTACTGATGGAGGGTCGGGGATGCCGGCGCTGTTTTTGTTTATTTTACTTTCCAGCCTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTGGTGTATGACGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT < 2:494236/149‑1 CTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG < 2:1254222/149‑1 TGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC < 1:1670196/149‑1 TGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGCGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC < 1:907174/149‑1 GACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACGTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTCAGGTGCTCCGGTGGCTTCTGTTTCTATCATGTGTC > 1:497300/1‑149 AACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCGGTTTCGATCGGCTGTCCCT > 2:1051789/1‑149 ACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTC < 2:2852/149‑1 ACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGATTCGTTTTCTATCAGCTGTCCCTC < 2:1407030/149‑1 CGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTGCAGCGTCGGGGGAAGCTGCCAACTTAATGATATAGAGTATGATGGAGTCTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCCGCTGTCCCTCC > 2:135238/1‑149 CGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGGTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC > 2:162194/1‑149 GCTTTATGGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGAGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTGCTGTTTCTATCAGCTGTAGCTCCT > 1:585618/1‑149 TTTACTGAAGTTTGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGT < 2:558567/149‑1 ATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCA > 2:371528/1‑149 ATTGAAGGATGGTCGGGGATGCCGACGCCGTTTTTGATTATTGTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCA < 1:37328/149‑1 AAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA < 2:851410/149‑1 AAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG < 1:1815369/87‑1 AAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 2:1815369/1‑87 AAGGATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA < 1:644858/149‑1 GGTCGGGGATGCCGACGCTGGCTTTGATTAGTTTCCTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG < 2:1771761/149‑1 aGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGACGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGG < 2:601641/148‑1 GGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGGTG > 1:1203504/1‑149 GATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGGTGGT < 2:1736229/149‑1 tcCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGGTGGTGC < 1:891655/147‑1 ACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTTCTAACTTACTGATTTAGGGCATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTTAGCTACTGACG‑GGGGGGTGCGTAAC > 1:1524725/1‑149 ACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGATGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGGTGGTGGGTAAC > 1:1238991/1‑149 CGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGGTGGTGCGTAACG < 1:934244/149‑1 ccgtgTTTGATTAGTTTACTTTCCAGCGTCGGGGGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGGTGGTGCGTAACGGC < 2:512124/144‑1 TTTTTGATTATTTTAGTTTCCTGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGGTGGTGCGTAACGGCAAA < 2:326240/149‑1 TTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGC < 1:1025497/149‑1 TTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGC < 2:1665209/149‑1 TGATTCTTTTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGGGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCA < 2:928936/149‑1 GATTATTTTACTTTCCGGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GCGTGGTGCGTAACGGCGAAAGCAC < 2:1342794/149‑1 TTACTTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGA > 2:1933718/1‑149 TTTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGATGTCCCTCCTGTTCAGCTCCTGACG‑GGGGGGCGCGTACCGGCAAAGGCAaccaggggacga > 2:1077600/1‑137 TTTCCAGCGGCGGGTGATGCTGCCACCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATC < 1:1820425/149‑1 TTCCAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGGCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCA < 2:1550974/149‑1 CAGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCG < 1:128221/149‑1 AGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACGGACG‑GGGTGGTGCGGAACGGCAAAAGCACCGACGGACATCAGCGC > 2:1443421/1‑149 AGCGTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGATTCTGTTTCTATCAGCGGTCCCTCCTGTT‑ACGACCTGAAGTTGGTGGTGCGTAACGTCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGC > 1:939587/1‑149 GCGTCTGGTGATCCGTGCAACTTACTGATCTAGTTTATGATGTTTTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTGCTTTTCAGCTACTGACG‑GGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACCTCAGCACT < 2:1449496/149‑1 GTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTAT < 1:892751/149‑1 GTCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTAT > 2:1657402/1‑149 TCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATC > 1:1232665/1‑149 CTGACTCTCTGTTCCAGCGTGATGGGCGTGCTGGCGGGGGCGCTACAAGGCTATTACGGCGGTAAAGTCGATCTCTGGGGACAACGCTTTATTGAAGTATGGTCGGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2269199‑2269346‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG‑GGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATC > CP009273/3576788‑3576933 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |