| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2871298 = | 196 (1.740) | 8 (0.070) | 7/284 | 14.4 | 3.9% | intergenic (+321/+630) | iap/ygbF | aminopeptidase in alkaline phosphatase isozyme conversion/CRISPR adaptation ssRNA endonuclease |
| ? | CP009273 | 2871341 = | 206 (1.870) | intergenic (+364/+587) | iap/ygbF | aminopeptidase in alkaline phosphatase isozyme conversion/CRISPR adaptation ssRNA endonuclease | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
CGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGG > CP009273/2871193‑2871489 | cgcgttagcgGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCTCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGct > 1:258276/8‑149 (MQ=255)cGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCAGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGCCGGct > 1:1024746/1‑149 (MQ=255) cgcgGGGAACTCGTAGTCCATCAGTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGcttgcctt < 1:802763/149‑1 (MQ=255) gcgGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGcttgccttg > 1:404444/1‑149 (MQ=255) gcgGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGctt < 2:238068/143‑1 (MQ=255) ggggAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTAAGTCTGAGCTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGca < 1:645085/149‑1 (MQ=255) acgcGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGcttgccttgc < 2:142989/140‑1 (MQ=255) cTCGTAGTCCATCCTTCCACCTCTGTCTGCCCTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTTca < 2:1619675/143‑1 (MQ=255) cTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGca > 2:1398196/1‑143 (MQ=255) cTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCGGGGCGGCTTGCCTTCca > 2:477179/1‑143 (MQ=255) aGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGGCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCaag > 1:1730087/1‑149 (MQ=255) tCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGcagccagcc > 2:1723063/1‑142 (MQ=255) catcatTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTcc > 2:1211201/1‑143 (MQ=255) atcatTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCg < 1:598926/149‑1 (MQ=255) ccACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCGCGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTAt < 1:1487818/149‑1 (MQ=255) accgattccTGAGCTCCCGGTTTATCCCCGCTGGGGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGt < 2:179389/135‑1 (MQ=255) aCCTAAGTCTGACCTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGt < 2:392527/143‑1 (MQ=255) ccgctcacggagcTCCCGGTTTAGCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGAGGATGTTTACGGTCATGTGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGtt < 2:506592/131‑1 (MQ=255) aTGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGCCGGCTTCCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTAt > 2:1692056/1‑143 (MQ=255) cTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGgc > 1:1572530/1‑149 (MQ=255) gcccTCCCGGTTTATCCCCGGTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTCTACGGTCCTGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGc < 2:907035/140‑1 (MQ=255) gaccTCGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCCGCTCGAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGgcgc < 1:987762/146‑1 (MQ=255) acccccGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCgg < 1:1534093/146‑1 (MQ=255) aCTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCgg < 1:184153/149‑1 (MQ=255) cTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGACCCCCCGGGGGATAATGTTTACCGTCACGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCggg < 1:559319/149‑1 (MQ=255) tCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCgggg > 1:286490/1‑149 (MQ=255) ccGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCCGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGgggc > 2:356211/1‑143 (MQ=255) ccGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGGCAGGTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGaa > 1:1774113/1‑149 (MQ=255) ccGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCGGCGGTTTATCGCCGCTGGCGCggggga > 1:687956/1‑147 (MQ=255) gTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCggg < 2:701342/143‑1 (MQ=255) gTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTc > 1:43842/1‑149 (MQ=255) gTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAACGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCggg < 2:916053/143‑1 (MQ=255) ttATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCaa < 1:730980/149‑1 (MQ=255) ttccccgcgccagcgGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAgc > 1:333868/13‑149 (MQ=255) ttccccgcgccagcgGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAgc > 1:1329590/13‑149 (MQ=255) aTCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAgc > 1:361011/1‑149 (MQ=255) tCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACt > 2:159042/1‑143 (MQ=255) tCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAgct > 1:77579/1‑149 (MQ=255) cccGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAgctgg > 1:155850/1‑149 (MQ=255) gCTGGCGCGGGGGACTCCATGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAACGGTTTATCCACGCTGGCGCGGGGAACTCAAgc > 2:640578/1‑143 (MQ=255) gCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAgctggctg < 1:1853545/149‑1 (MQ=255) gcgGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGGACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTGTCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAgctgggtg > 2:265540/1‑143 (MQ=255) gcgGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAgctggctg > 2:157765/1‑143 (MQ=255) ggggAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCCGCGGTTTGTCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGACAAtctc > 1:46973/1‑149 (MQ=255) ggggAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCtggctggc > 2:746260/1‑143 (MQ=255) cggcaCTCCCGGCGGCTGATGTTTTCGGTCCTGGGGCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCa < 2:838306/139‑1 (MQ=255) gAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCttt < 1:666064/149‑1 (MQ=255) ccGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGt > 1:1322285/1‑149 (MQ=255) gggggATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCg < 2:1669150/143‑1 (MQ=255) gggggATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGa < 1:1860891/149‑1 (MQ=255) ggggATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAg > 1:1108065/1‑149 (MQ=255) gggATAATGTTTCCGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGACCTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCggg < 2:350463/143‑1 (MQ=255) gggATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCggg < 2:1004338/143‑1 (MQ=255) gATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCGTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCGGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGt < 2:853997/143‑1 (MQ=255) tgaTGTTTACGGTCGTGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGGGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGa < 2:1064358/141‑1 (MQ=255) tcatgtgcaCGGTCGTGCGCCGCCCGGTTTGTCCCCGCTGACGCGGGGAACTCGGGGCCGCTCGTCGTGCAGCCATCTCGAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGa < 2:418877/135‑1 (MQ=255) tAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCGATCTCTTTCGGGGTGa > 2:1076477/1‑143 (MQ=255) aaTGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGTACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGt < 1:1298223/149‑1 (MQ=255) 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tCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGtt > 1:768581/1‑149 (MQ=255) cccGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCGGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTc > 1:1065879/1‑149 (MQ=255) cccGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCAAGCAGCGCTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTc < 1:53868/149‑1 (MQ=255) gCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGt < 2:332585/143‑1 (MQ=255) cgcgGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCATGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCg < 2:1195056/143‑1 (MQ=255) cgcgGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCg < 2:890541/143‑1 (MQ=255) gcgGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTcc > 1:1082806/1‑149 (MQ=255) gcgGGGAACTCTGAGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCGGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCAGTGTATGCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAAACCTAGTTTCCGTATCTcc > 1:1306171/1‑149 (MQ=255) ggggAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCgg > 1:1612002/1‑149 (MQ=255) gggAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTAtc > 2:2671/1‑143 (MQ=255) gggAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGa < 1:1514854/149‑1 (MQ=255) tctGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCGGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTtata > 1:1638152/1‑149 (MQ=255) tctGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGa > 2:699594/1‑143 (MQ=255) ctGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATaa < 1:1721292/149‑1 (MQ=255) ggggCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCATTCGGGGTGAGACAGGTTTATCCCCGCTGACGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTAACGCCGGAtt > 2:1341628/2‑143 (MQ=255) gggCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAg < 1:1631611/149‑1 (MQ=255) ggcggcTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGc > 1:1666940/1‑149 (MQ=255) gcggcTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCt < 1:1366974/149‑1 (MQ=255) gcggcTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCACCTGATTtat < 2:1161268/143‑1 (MQ=255) ctgcTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCCGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTtata < 2:63325/141‑1 (MQ=255) gcTTGCCTGCCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTGTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTGTCGGGGCGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATaaa < 2:1404556/143‑1 (MQ=255) ttgccttgcAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGGACTCTGGTTTCCGTGTCTCCGGATTTATAGAGc > 2:941121/1‑143 (MQ=255) | CGCTAACGCGGGGAACTCGTAGTCCATCATTCCACCTATGTCTGAACTCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTAGTTTCCGTATCTCCGGATTTATAAAGCTGACGG > CP009273/2871193‑2871489 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |