New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4432233 | 73 (1.450) | 4 (0.080) | 3/472 | NT | 5.9% | coding (825/966 nt) | ytfF | DMT transporter family inner membrane protein |
? | NC_000913 | = 4433242 | 56 (1.150) | coding (784/861 nt) | qorB | NAD(P)H:quinone oxidoreductase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
ATCAACGGCCCGACAAAAATAAGCCCCCACATCAACCCTGCTAACAGGGCGTACAGCACGCCGCTAATCATTACTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGA > NC_000913/4432987‑4433529 | aTCAACGGCCCGACAAAAATAAGCCCCCACATCAACCCTGCTAACAGGGCGTACAGCACGCCGCTAATCATTACTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATgc > 2:305358/1‑289 (MQ=255) gACAAAAATAAGCCCCCACATCAACCCTGCTAACAGGGCGTACAGCACGCCGCTAATCATTACTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCTTCAAACAGACCGTCTGTCGATTCGCCAACGTccg > 1:222434/1‑287 (MQ=255) cccccACATCAACCCTGCTAACAGGGCGTACAGCACGCCGCTAATCATTACTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCa > 1:73954/1‑289 (MQ=255) ccccACATCAACCCTGCTAACAGGGCGTACAGCACGCCGCTAATCATTACTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCat < 2:73954/289‑1 (MQ=255) cAACCCTGCTAACAGGGCGTACAGCACGCCGCTAATCATTACTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCGGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCa < 1:356874/289‑1 (MQ=255) tGCTAACAGGGCGTACAGCACGCCGCTAATCATTACTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCg > 2:489299/1‑288 (MQ=255) cTAACAGGGCGTACAGCACGCCGCTAATCATTACTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGt > 2:260986/1‑257 (MQ=255) cTAACAGGGCGTACAGCACGCCGCTAATCATTACTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGt < 1:260986/257‑1 (MQ=255) cTAACAGGGCGTACAGCACGCCGCTAATCATTACTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCa > 1:126494/1‑281 (MQ=255) cTAACAGGGCGTACAGCACGCCGCTAATCATTACTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCa < 2:126494/281‑1 (MQ=255) 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tGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCt < 2:222434/289‑1 (MQ=255) tGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCt < 2:317890/289‑1 (MQ=255) tGATCGGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCt < 2:216433/289‑1 (MQ=255) cTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGa < 2:141862/289‑1 (MQ=255) tCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCCGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGAttt > 1:390128/1‑289 (MQ=255) tCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGAttt > 2:357974/1‑289 (MQ=255) 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tAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTg > 2:477314/1‑289 (MQ=255) tGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGc < 1:354681/287‑1 (MQ=255) aCGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTAGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTaa < 2:314298/289‑1 (MQ=255) tCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTACCCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCCGGTCCTATCGCCCGCCAGTTCGGAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCAccc > 2:298555/1‑287 (MQ=255) aCGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCg > 1:282745/1‑288 (MQ=255) tGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGc < 2:37606/288‑1 (MQ=255) tGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATaa > 2:12337/1‑288 (MQ=255) gCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATaa > 2:492427/1‑286 (MQ=255) gCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATaa > 1:52480/1‑286 (MQ=255) gCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCCTGCCGCCGCTGCCGCATActct > 1:226420/1‑289 (MQ=255) aGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCACCGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAgg < 2:358867/289‑1 (MQ=255) aGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCg > 1:320222/1‑150 (MQ=255) aGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCg < 2:320222/150‑1 (MQ=255) aGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAgg > 2:445018/1‑289 (MQ=255) aGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAg > 2:287790/1‑288 (MQ=255) gtTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAACTCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCGCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACTCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGTCGa > 2:257298/1‑289 (MQ=255) | ATCAACGGCCCGACAAAAATAAGCCCCCACATCAACCCTGCTAACAGGGCGTACAGCACGCCGCTAATCATTACTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACCGGCTTCGCTAATCACGCGTGCCGCAGCTGCCGCATAATCTGCCCGCGTTGCTGAGGCGA > NC_000913/4432987‑4433529 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |