| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,595,919 | C→T | 6.0% | D273N (GAC→AAC) | ypfJ ← | putative neutral zinc metallopeptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,595,919 | 0 | C | T | 6.0% | 217.8 / 2.0 | 66 | D273N (GAC→AAC) | ypfJ | putative neutral zinc metallopeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/27); new base T (2/2); total (37/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 | |||||||||||
CCGGAACTCGCGCCCAAGTAAAGTTTGTAGTGCCGAGGGAGAACAGTGGTTTTCAGCATCTGGCCGCGGCGAAATCCACAGCCAGTCGCCAGGTAAGGCATCACGCAACTTAAGAGTATGCTCAAAACACCAACCCTCTTCCCCGCTCAACACCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCATCCCTGCCCCGGAAGTTAAATGCTTTTACCAAAAGTATTGCATTGTGCCGGATCGCCGCTGTCGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCGTTGCTGAGAAGTGCCATGAGTGAAACTGTCTGGTACTACTCGCCCCTGACTTTGCTGTTGTAAACGGTCATCGCCGATGGCCTGCGCCGCGTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGCCCCCAGACACCGGCAAAACAGTCGGCCTGGAGTTCCATACGCACAGATAAGCGGTTTACTTCCGCCTGCGTCGCGTTTTGTTGCAGTTGACGAACTTTCGGCTCGATGC > NC_000913/2595636‑2596203 | acGGAACTCGGGCCCAAGTAAAGTTTGTAGTGCCGAGGGGGAACAGTGGTTTTCAGCATCTGGCCGCGGCGAAATCCACAGCCAGTCGCCAGGTAAGGCATCACGCAACTTAAGAGTATGCTCAAAACACCAACCCTCTTCCCCGCTCAACACCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCGTTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCATCCCTGCCCCGGAAGTTAAATGCTTTTACCAAAAGTATTGCATTGTGCCGGATCGCCGCTGTCGAAAc < 1:292561/288‑1 (MQ=255) tttGTAGTGCCGAGGGAGAACAGTGGTTTTCAGCATCTGGCCGCGGCGAAATCCACAGCCAGTCGCCAGGTAAGGCATCACGCAACTTAAGAGTATGCTCAAAACACCAACCCTCTTCCCCGCTCAACACCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCATCCCTGCCCCGGAAGTTAAATGCTTTTACCAAAAGTATTGCATTGTGCCGGATCGCCGCTGTCGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCGt > 1:481146/1‑289 (MQ=255) ttGTAGTGCCGAGGGAGAACAGTGGTTTTCAGCATCTGGCCGCGGCGAAATCCACAGCCAGTCGCCAGGTAAGGCATCACGCAACTTAAGAGTATGCTCAAAACACCAACCCTCTTCCCCGCTCAACACCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCATCCCTGCCCCGGAAGTTAAATGCTTTTACCAAAAGTATTGCATTGTGCCGGATCGCCGCTGTCGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCg < 2:200333/287‑1 (MQ=255) tGTAGTGCCGAGGGAGAACAGTGGTTTTCAGCATCTGGCCGCGGCGAAATCCACAGCCAGTCGCCAGGTAAGGCATCACGCAACTTAAGAGTATGCTCAAAACACCAACCCTCTTCCCCGCTCAACACCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCATCCCTGCCCCGGAAGTTAAATGCTTTTACCAAAAGTATTGCATTGTGCCGGATCGCCGCTGTTGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCGtt > 2:308385/1‑288 (MQ=255) 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tGCTCAAAACACCAACCCTCTTCCCCGCTCAACACCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCATCCCTGCCCCGGAAGTTAAATGCTTTTACCAAAAGTATTGCATTGTGCCGGATCGCCGCTGTCGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCGTTGCTGAGAAGTGCCATGAGTGAAACTGTCTGGTACTACTCGCCCCTGACTTTGCTGTTGTAAACGGTCATCGCCGATGGCCTGCGCCGCGTTCa > 1:285263/1‑288 (MQ=255) tGCTCAAAACACCAACCCTCTTCCCCGCTCAACACCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCATCCCTGCCCCGGAAGTTAAATGCTTTTACCAAAAGTATTGCATTGTGCCGGATCGCCGCTGTCGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCGTTGCTGAGAAGTGCCATGAGTGAAACTGTCTGGTACTACTCGCCCCTGACTTTGCTGTTGTAAACGGTCATCGCCGATGGCCTGCGCCGCGTTCa > 1:355207/1‑288 (MQ=255) gCTCAAAACACCAACCCTCTACCCCGCTCAACACCAGCAAGCGGCGGAGCCCGTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTGCAGCCATCCCTGCCCCGGAAGTTAAATGCTTTTACCAAAAGTATTGCATTGTGCCGGATCGCCGCTGTCGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCGTTGCTGAGAAGTGCCATGAGTGAAACTGTCTGGTACTACTCGCCCCTGACTTTGCTGTTGTAAACAGTCATCGCCGATGGCCTGCGCCGCGTTCAgc < 2:255190/289‑1 (MQ=255) 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aTCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCATCCCTGCCCCGGAAGTTAAATGCTTTTACCAAAAGTATTGCATTGTGCCGGATCGCCGCTGTCGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCGTTGCTGAGAAGTGCCATGAGTGAAACTGTCTGGTACTACTCGCCCCTGACTTTGCTGTTGTAAACGGTCATCGCCGATGGCCTGCGCCGCGTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCAt < 2:296397/286‑1 (MQ=255) cTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCATCCCTGCCCCGGAAGTTAAATGCTTTTACCAAAAGTATTGCATTGTGCCGGATCGCCGCTGTCGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCGTTGCTGAGAAGTGCCATGAGTGAAACTGTCTGGTACTACTCGCCCCTGACTTTGCTGTTGTAAACGGTCATCGCCGATGGCCTGCGCCGCGTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGc < 1:91911/289‑1 (MQ=255) gTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCATCCCTGCCCCGGAAGTTAAATGCTTTTACCAAAAGTATTGCATTGTGCCGGATCGCCGCTGTCGAAACCACGTTTAAACAAGCTGTAGCGTTGCTGAGAAGTGCCATGAGTGAAACTGTCTGGTACTACTCGCCCCTGACTTTGCTGTTGTAAACGGTCATCGCCGATGGCCTGCGCCGCGTTCAGGGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCGCGCACCCCTTGCTGCCGCATACTACGcacccc > 1:296397/1‑287 (MQ=255) 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gAAGTTAAATGCTTTTACCAAAAGTATTGCATTGTGCCGGATCGCCGCTGTCGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCGTTGCTGAGAAGTGCCATGAGTGAAACTGTCTGGTACTACTCGCCCCTGACTTTGCTGTTGTAAACGGTCATCGCCGATGGCCTGCGCCGCGTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGCCCCCAGACACCGGCAAAACAGTCGGCCTGGAGTTCCATACg < 1:277678/268‑1 (MQ=255) ttACCAAAAGTATTGCATTGTGCCGGATCGCCGCTGTCGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCGTTGCTGAGAAGTGCCATGAGTGAAACTGTCTGGTACTACTCGCCCCTGACTTTGCTGTTGTAAACGGTCATCGCCGATGGCCTGCGCCGCGTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGCCCCCAGACACCGGCAAAACAGTCGGCCTGGAGTTCCATACGCACAGATAAGCGGTTTACTTCCGCCTGCGTCGCGt > 1:11260/1‑289 (MQ=255) gtgCCGGATCGCCGCTGTCGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCGTTGCTGAGAAGTGCCATGAGTGAAACTGTCTGGTACTACTCGCCCCTGACTTTGCTGTTGTAAACGGTCATCGCCGATGGCCTGCGCCGCGTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGCCCCCAGACACCGGCAAAACAGTCGGCCTGGAGTTCCATACGCACAGATAAGCGGTTTACTTCCGCCTGCGTCGCGTTTTGTTGCAGTTGACGa > 2:311784/1‑287 (MQ=255) 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ccgcTGTCGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCGTTGCTGAGAAGTGCCATGAGTGAAACTGTCTGGTACTACTCGCCCCTGACTTTGCTGTTGTAAACGGTCATCGCCGATGGCCTGCGCCGCGTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGCCCCCAGACACCGGCAAAACAGTCGGctttgccggtgtctgggg > 1:100680/1‑209 (MQ=255) ccgcTGTCGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCGTTGCTGAGAAGTGCCATGAGTGAAACTGTCTGGTACTACTCGCCCCTGACTTTGCTGTTGTAAACGGTCATCGCCGATGGCCTGCGCCGCGTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGCCCCCAGACACCGGCAAAACAGTCGGctttgccggtgtctgggg < 2:100680/226‑18 (MQ=255) ccgcTGTCGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCGTTGCTGAGAAGTGCCATGAGTGAAACTGTCTGGTACTACTCGCCCCTGACTTTGCTGTTGTAAACGGTCATCGCCGATGGCCTGCGCCGCGTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGCCCCCAGACACCGGCAAAACAGTCGGCCTg < 2:290651/212‑1 (MQ=255) ccgcTGTCGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCGTTGCTGAGAAGTGCCATGAGTGAAACTGTCTGGTACTACTCGCCCCTGACTTTGCTGTTGTAAACGGTCATCGCCGATGGCCTGCGCCGCGTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGCCCCCAGACACCGGCAAAACAGTCGGCCTg > 1:290651/1‑212 (MQ=255) 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ccgcTGTCGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCGTTGCTGAGAAGTGCCATGAGTGAAACTGTCTGGTACTACTCGCCCCTGACTTTGCTGTTGTAAACGGTCATCGCCGATGGCCTGCGCCGCGTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGCCCCCAGACACCGGCAAAACAGTCGGCCTGGAGTTCCATACGCACAGATAAGCGGTTTACTTCCGCCTGCGTCGCGTTTTGTTGCAGTTGACGAACTTTCGGCTCGa > 2:96590/1‑289 (MQ=255) tGTCGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCGTTGCTGAGAAGTGCCATGAGTGAAACTGTCTGGTACTACTCGCCCCTGACTTTGCTGTTGTAAACGGTCATCGCCGATGGCCTGCGCCGCGTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGCCCCCAGACACCGGCAAAACAGTCGGCCTGGAGTTCCATACGCACAGATAAGCGGTTTACTTCCGCCTGCGTCGCGTTTTGTTGCAGTTGACGAACTTTCGGCTCGATGc < 2:355207/288‑1 (MQ=255) | CCGGAACTCGCGCCCAAGTAAAGTTTGTAGTGCCGAGGGAGAACAGTGGTTTTCAGCATCTGGCCGCGGCGAAATCCACAGCCAGTCGCCAGGTAAGGCATCACGCAACTTAAGAGTATGCTCAAAACACCAACCCTCTTCCCCGCTCAACACCAGCAAGCGGCGGATCCCTTCACGTTTCATTTGCGCTGTTAATGTGTGAAGCGCAGTCAGTTCAGCCATCCCTGCCCCGGAAGTTAAATGCTTTTACCAAAAGTATTGCATTGTGCCGGATCGCCGCTGTCGAAACCACGTTTAAACCAGCTGTAGCGTTGCTGAGAAGTGCCATGAGTGAAACTGTCTGGTACTACTCGCCCCTGACTTTGCTGTTGTAAACGGTCATCGCCGATGGCCTGCGCCGCGTTCAGCGCCTCTTCCAGATCGCCGGTTTCCAGAACGCCTTGCTGCTGCATACTATGCCCCCAGACACCGGCAAAACAGTCGGCCTGGAGTTCCATACGCACAGATAAGCGGTTTACTTCCGCCTGCGTCGCGTTTTGTTGCAGTTGACGAACTTTCGGCTCGATGC > NC_000913/2595636‑2596203 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |