New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3411600 | 83 (1.070) | 4 (0.060) | 4/258 | 11.0 | 5.0% | intergenic (+35/‑51) | fis/yhdJ | global DNA‑binding transcriptional dual regulator/DNA adenine methyltransferase, SAM‑dependent |
? | NC_000913 | = 3411614 | 74 (1.040) | intergenic (+49/‑37) | fis/yhdJ | global DNA‑binding transcriptional dual regulator/DNA adenine methyltransferase, SAM‑dependent | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCC > NC_000913/3411462‑3411739 | ttgTGATGCAATACACCCGTGGTACCCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTc < 1:1209352/141‑1 (MQ=255) tGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTACATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTc > 2:855598/1‑143 (MQ=255) ggTGATGCAATACACCAGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCg > 2:114498/1‑143 (MQ=255) ggTGATGCAATACACCAGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCg > 2:1331966/1‑143 (MQ=255) ggTGATGCAATACACCAGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATGGAAAAACTACGCAGTGCCTTGTTGCAGGATAGTTAGATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCg > 2:1336940/1‑143 (MQ=255) gTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCgg < 2:1118768/143‑1 (MQ=255) tGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGGGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAAGTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGc > 1:320265/1‑143 (MQ=255) gCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGCTGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGCCAAAAATGGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCGCAATGCCTGATTAAAAACGCGCTACGCGGCactg > 1:193190/1‑140 (MQ=255) gCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATgg > 1:305512/1‑143 (MQ=255) gCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCGAAATGCTTGCTTAAAAAGGCGCTACTCGGCGTgg > 2:440503/1‑143 (MQ=255) tccacCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATGGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGaa < 2:10695/141‑1 (MQ=255) acacCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTACGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAg > 2:142699/1‑143 (MQ=255) acCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCCGGCTAGCTAAAGGCGTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAgcg > 1:598143/1‑143 (MQ=255) acCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCCTGGTACGCTGCCTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAgcg > 2:606688/1‑143 (MQ=255) ccGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGATACTCCGCATGGGGAAGCGcc > 1:532568/1‑143 (MQ=255) ggTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAACTGCTTGATTAGACAGGCGCTACTCGGCATGGTGGAGCGCC‑tttt > 2:668780/1‑143 (MQ=255) gTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑ttttt > 2:297783/1‑143 (MQ=255) tAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑tttttt < 2:268825/143‑1 (MQ=255) actaGATCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCTTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTtat < 1:462440/140‑1 (MQ=255) aCCAGATCCGTGCTGCGCTGATGCTGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCCTAACCACTTATCGTTATGTGGGTTGACCTAATTCAGGTTAGCTAAATGCCTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTtat < 2:987303/143‑1 (MQ=255) cAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAg > 1:569976/1‑143 (MQ=255) cAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAg < 2:1206532/143‑1 (MQ=255) cAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCGTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑GTTTTTATAg > 1:829076/1‑143 (MQ=255) aGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCGACTCAGCATGGGGAAGCGCC‑TTCTTTATCgg > 1:754471/1‑143 (MQ=255) ccGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAACATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTAAGCTTAATGCTTGATTAAACAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTc > 1:333920/1‑143 (MQ=255) ccGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTc < 1:386352/143‑1 (MQ=255) ccGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTc < 1:1036177/143‑1 (MQ=255) gcggtgagcTGATGATCGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTcac < 2:37974/136‑1 (MQ=255) gTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TGTCTTATAGGTGTcac > 1:763584/1‑143 (MQ=255) gcgcTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAgg < 2:300415/143‑1 (MQ=255) gcgcTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAgg < 2:609723/143‑1 (MQ=255) gcgcTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAgg > 1:921225/1‑143 (MQ=255) gcTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGa < 2:775590/143‑1 (MQ=255) gcTGAAGGTGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGa < 2:814547/143‑1 (MQ=255) cTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCGTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTCTTATAGCGGTCACAAAGGGAg > 1:1202120/1‑143 (MQ=255) cTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGATAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCGTGCGGACGCGCC‑TTCAGCATCGGTGGCACAAAGGGAg > 1:9901/1‑143 (MQ=255) cTGATGATGGGCATAAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAg > 2:1117466/1‑143 (MQ=255) tgatgaTGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGt < 2:123947/143‑1 (MQ=255) atgGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCa < 2:643577/143‑1 (MQ=255) gggCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTAGCGGTGCTCCCAAGGGAGGGAcccgc > 1:140584/1‑140 (MQ=255) gggCATCAACCGTGGCACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATg < 2:598143/143‑1 (MQ=255) gCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATgag > 2:144996/1‑143 (MQ=255) aTCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTTATTAAGGGGGCGCTGCTGGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGaa < 2:692798/143‑1 (MQ=255) cAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGGGTGACCATGAGAACa > 2:1253924/1‑143 (MQ=255) acgggggtgggCTGCGTAAAAAATTGAAAAAAGACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCGACTCGGCATGGGGCA‑CGCCGCATTTGAAAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAgg < 1:606688/133‑1 (MQ=255) aCCGTGGTACGCTGCATACAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAgg > 1:826506/1‑143 (MQ=255) tGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGAtgt > 2:588474/1‑143 (MQ=255) gtcagatGCGTAAAAAATGCAACAAATACGGCACGAACCAATTCAGGGTAGCAAAATTCTTGATTAAAAAGGCCCGACCCGGCATGGGGAAGCGTC‑TTTCTTATAAATATCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGa < 1:1321819/137‑1 (MQ=255) aCGCTGCGTAAAAAGTTCAAAGAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTGTCACACCCCAAAATTTGGTGGGCTCTACTCGGCAGGGGGAAGCGCA‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAAc < 1:1316388/143‑1 (MQ=255) aCGCTGCGTAAAAACTTCAAAAAATACGGCATGAACGAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTGTGATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAAc < 2:4184/143‑1 (MQ=255) aCGCTGCGTAAAAAATTGAAACACTACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTGTTATAGGGGTCACAAAGGGAGTGAGCCTGAGAACAGGATGTGaaa > 1:1033313/1‑142 (MQ=255) aCGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAAc < 2:1020183/143‑1 (MQ=255) aCGCTGCGGAACAAATTGACAAAATACGGCATGACCTCATTCAGGTTAGCTAAGTGCTTGATTAAAAGGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAAc < 1:1190299/143‑1 (MQ=255) tAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATGCAGGTTAGCCAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACGCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCgg < 1:855598/143‑1 (MQ=255) aaaaaTTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAACTGCTTGATTAAAACGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAACGGAAGTGACCCTGAAGACAGGATCTGAACCGACACGGtt > 2:81436/1‑143 (MQ=255) aaaaaTTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACGCGGtt > 2:268053/1‑143 (MQ=255) aaaaaTTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTAAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGtt < 1:923717/143‑1 (MQ=255) aaaaTTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGttt > 2:6791/1‑143 (MQ=255) aaTTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGCGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTgg > 1:78836/1‑143 (MQ=255) aaaaaaTACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATg > 2:1034389/1‑143 (MQ=255) atgcactgCATGAACTGATTCAGGCTAGTGAAATGGTTGGTTTAAAAGGTCGTTGTTGGCCTGGGGAAACGTC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGAAAGTCATAATATCATGTGAACCTACCCGGTTTGGTAATGAAg < 1:100174/136‑1 (MQ=255) aaTAAGGTATGAACCAATTTAGGTTAGCGAAATGCGTGATTAAAAAGGCGCTACGCGGCAGGGGGAAGCGCC‑TTTGTTAGAGGTGGCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGc < 2:584103/143‑1 (MQ=255) aCGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTaa < 2:305512/143‑1 (MQ=255) aCTAATTCAGGTTAGCTAAATACTACTGTAGAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCAAGAGAAAAAGATGTGAACCGAACAGGTTTGGTAAAGAAACAAAAACcatcat > 1:823810/1‑143 (MQ=255) tAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTc > 2:953209/1‑143 (MQ=255) aTTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGTTGGCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCAc > 2:1212528/1‑143 (MQ=255) ttCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCAGTATTCACg > 1:1049026/1‑143 (MQ=255) ttCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAACGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGCGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACg > 1:1292988/1‑143 (MQ=255) aGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACGCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTg < 1:302089/143‑1 (MQ=255) tgaGCTCAACGCTTGATTAATAAGGCGCTGCTCGGCATGGGGAGGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATg < 1:972042/141‑1 (MQ=255) cttaaTGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCt < 1:297783/140‑1 (MQ=255) tAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCtt > 1:316575/1‑143 (MQ=255) tAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACACTGAGAACAGGATGTGACCCGACGCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCAATATTCACggcgcgccgccc > 1:1045225/1‑133 (MQ=255) cTTGATTAAGAGGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGTC‑TTTGTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGAGCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGaa < 1:628599/143‑1 (MQ=255) cTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGaa < 1:588474/143‑1 (MQ=255) ttGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAAc > 1:894370/1‑143 (MQ=255) ttGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCAGAAc > 2:614921/1‑143 (MQ=255) tGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACt < 1:1034389/143‑1 (MQ=255) gttATAACGGCGGTACTCGGCATGGGGTGGTGCC‑TTTTGTATATGGTTCACAAGGGGAGTGACAATGAGAACATGATGTGAAGTGAGCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTAGTCACGGTGATGCGCTTGCCGCACTTa < 1:1262358/142‑1 (MQ=255) aaaaaGGCGCTACGCGGCACGGGGCAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTaaaa < 2:401358/143‑1 (MQ=255) taaaGGGGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTCTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTaaaaa < 2:333920/142‑1 (MQ=255) aGGCGGTACTCGGGATGGGGAAGCGTC‑TTTTTGATAGGTGTGGGAAGGGGAGTGACGATGCGACCCGGTTGTGAACCGTCCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGAt < 1:284047/143‑1 (MQ=255) cgcTGCTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TGTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATccc < 2:1192317/143‑1 (MQ=255) | TGGTGATGCAATACACCCGTGGTAACCAGACCCGTGCTGCGCTGATGATGGGCATCAACCGTGGTACGCTGCGTAAAAAATTGAAAAAATACGGCATGAACTAATTCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCC‑TTTTTTATAGGTGTCACAAAGGGAGTGACCATGAGAACAGGATGTGAACCGACCCGGTTTGGTAATGAAGCTAAGACCATTATTCACGGTGATGCGCTTGCCGAACTTAAAAAGATCCC > NC_000913/3411462‑3411739 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |