| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,677,913 | T→C | intergenic (‑10/‑514) | pntA ← / → ydgH | pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit/DUF1471 family periplasmic protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,677,913 | 0 | T | C | 98.6% | 215.0 / ‑4.5 | 72 | intergenic (‑10/‑514) | pntA/ydgH | pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit/DUF1471 family periplasmic protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (31/40); total (31/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.85e-01 | |||||||||||
CAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTATGCCTGTGA > NC_000913/1677778‑1678046 | cAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCg > 2:1180870/1‑143 (MQ=255) aGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCgg < 1:237382/143‑1 (MQ=255) tGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGGCGGTAAATCCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGttt < 1:1187211/143‑1 (MQ=255) cccGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTAt < 2:813848/143‑1 (MQ=255) ccGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTAtg > 2:122028/1‑142 (MQ=255) gtgccgccCTTTAGCTCGGCGGTAAATCCCCGTTTCAGGTGCTGTTCCACTGTTTTTGTCGTTGCTGCAACACTGGTTTCATTGGTTAATCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATtga < 1:1239692/141‑1 (MQ=255) gcgcCGCTCTCTCCCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTCTTGGCGTTGCGGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATtga < 1:600118/143‑1 (MQ=255) cgccgcGCTCTCCCGCGACGGTAAAACCCGGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGTTGCAACACGGGTTTCATTGGTTACCCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATtgat < 1:835976/143‑1 (MQ=255) ccgcTCCCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGCTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATtgatga < 2:262342/143‑1 (MQ=255) cgcTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTgatgat > 1:792746/1‑143 (MQ=255) gcTGTCTACCGCGACGGTAGAACCCAGTGTCAGCAGCGGTTCCACTGTTTTTCGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGGTTTATTGatgatg < 1:272267/143‑1 (MQ=255) gcTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGatgatg < 1:855261/143‑1 (MQ=255) ctctctACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATGCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATgg > 1:491879/1‑143 (MQ=255) tctACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTTATCTGCTGTTCCTCTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTGTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGttt < 2:421820/143‑1 (MQ=255) caaggcgACTGTACAACCCAGTCTCTGACGCTCTTCTATTGTCTATGGCGTTGTTGCAACTGGCGCCTCCTTGGTTAAGCTTTTTTTTGGTATGCTAATTCGCTTTAATTTCTCCTTCTTTGTTTTTATTGATGATGGTTTGc < 1:344756/139‑1 (MQ=255) ccGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCt > 2:471004/1‑143 (MQ=255) gACGGTAAAGCCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTgtgt < 1:1253163/143‑1 (MQ=255) gACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTgtgt < 2:405052/143‑1 (MQ=255) ggTAAACCCCAGTTCCAGCAGCTGTTCCACTGTTGCTGGCGTCGCTGCAACACTGGTTTCAGTGGTTCACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTTCATCGGTTTTAGTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAg < 1:990897/143‑1 (MQ=255) gTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCTgg > 1:793189/1‑143 (MQ=255) gTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCGCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGGTTGCCTGTGTCAgg > 1:1175188/1‑143 (MQ=255) gTAAAACCCAGTTGCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAgg < 1:146283/143‑1 (MQ=255) acaCCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCGCTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTGCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGc < 1:648898/141‑1 (MQ=255) aaCCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGcc > 2:77497/1‑143 (MQ=255) aCCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTGTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCGGGAGCca > 2:280576/1‑143 (MQ=255) ccAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCcaca > 2:216893/1‑143 (MQ=255) cAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCcacac < 1:336030/143‑1 (MQ=255) tttCAGCAGCTGTTCCCCTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAg < 1:163630/143‑1 (MQ=255) tttCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCACGATATTCCCCTCCATCGGTGTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAg > 1:668633/1‑143 (MQ=255) agcaggTGTTCCACTGTTTTTCGGGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCGAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATCTATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAgctgc < 1:607027/143‑1 (MQ=255) agcagcTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAgctgc > 1:759541/1‑143 (MQ=255) cTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTAGGCCAATTCGCATGAGATTCCCCTCCATCGGTTGTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATg < 2:896709/143‑1 (MQ=255) tGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATCGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGTCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGCTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGTCGGCCCACGAGCTGCTCATGt > 1:1063632/1‑143 (MQ=255) gTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGTTTTGCCTATGTCAGCAGCCACACAAGCTGCTCATGTa > 1:1049434/1‑143 (MQ=255) ccACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGa < 2:884869/143‑1 (MQ=255) ccACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGa < 1:1078497/143‑1 (MQ=255) ccACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTGTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGa < 2:1288803/143‑1 (MQ=255) aCTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGc > 2:6843/1‑143 (MQ=255) tttttGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTGTGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTaaa > 2:1349261/1‑143 (MQ=255) tttttGGCGTTGCTGCAACACGGGTGTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTaaa < 1:16641/143‑1 (MQ=255) ttttGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAAt < 1:673647/143‑1 (MQ=255) tttGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATg > 2:820233/1‑143 (MQ=255) tttGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATg < 2:1020305/143‑1 (MQ=255) ttGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGt < 2:1028434/143‑1 (MQ=255) tGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTACCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGtt > 1:451629/1‑143 (MQ=255) gCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGACATTCCCCTCTATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCACTTACGAGCTAACTCTTAc > 1:622598/1‑143 (MQ=255) cGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACt < 1:1223334/143‑1 (MQ=255) tgcAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTa < 1:132102/143‑1 (MQ=255) taaCACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTaaa < 2:1008053/142‑1 (MQ=255) cAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTaaa < 2:1034596/143‑1 (MQ=255) aaCACGGGTTTCATTGGTTACCCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTaaaa < 2:17009/143‑1 (MQ=255) acGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAaaataa > 1:813164/1‑143 (MQ=255) tttCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAg > 2:533523/1‑143 (MQ=255) aTTGGTTAACCGTTCTTTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAAc < 2:664559/143‑1 (MQ=255) aTTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAAc > 2:1017171/1‑143 (MQ=255) gtgagccgtgttgttGGTATGTCAATTCGCATGAGATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAAc < 1:755957/130‑1 (MQ=255) gTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGCTGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTGATGTACGAGCTAAATCTTACTCCGGCAACATAAATTACTAACAGAc > 1:1334895/1‑143 (MQ=255) gTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTCTTAGTGATGATGGTTTTCCTGTGGCAGGAGCAACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTACAAAAACATTAGTaaacaag > 1:717958/1‑138 (MQ=255) ttAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACg > 2:409959/1‑143 (MQ=255) tAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGc < 2:759541/143‑1 (MQ=255) cGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGTAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAATAACAAACGCCAta > 1:1194752/1‑143 (MQ=255) gTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCgat > 1:455629/1‑143 (MQ=255) ctctTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGc < 1:548517/97‑1 (MQ=255) ctctTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGc > 2:548517/1‑97 (MQ=255) ctTGGTATGCCAATTCGCATGATATTACCCTCCATCGGTTTTATTGCTGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGCGCTAAATGTTACTCCGTTACAATAAACTAGTAACCAAACCCCTATAACgg > 1:120109/1‑142 (MQ=255) ttagTATCCCAAGTCGCATGACATTCCCCTCCATCGGTTGTATTGATAATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTa < 2:1303133/140‑1 (MQ=255) aTGCCAATTCGCATGATATTCCCCTCCTTCGGTTTTATTGATGATGGGTTGCCTGTGTCAGGATCCACCCAAGCTGCACGTGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGaa < 1:657677/143‑1 (MQ=255) gCCAATTCGCGTGATATTCCCCTCCAGCGGTTTTATTGATGATGGTGTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGaaaa < 1:180934/143‑1 (MQ=255) ccgaTTCGCATGATTTTCCCCTCCATCGGTTTTATTGGTGATGGTTTGGCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAAt < 1:873479/140‑1 (MQ=255) gCATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTATGCCt < 1:820233/143‑1 (MQ=255) cATGATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTATGCCtg > 2:819608/1‑143 (MQ=255) gATATTCCCCTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTATGCCTGTGa > 2:609627/1‑143 (MQ=255) | CAGTTGACCCGCGCCGCTCTCTACCGCGACGGTAAAACCCAGTTTCAGCAGCTGTTCCACTGTTTTTGGCGTTGCTGCAACACGGGTTTCATTGGTTAACCGTTCTCTTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTATGCCTGTGA > NC_000913/1677778‑1678046 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |