| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,815,858 | Δ82 bp | [rph]–[rph] | [rph], [rph] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3815858 | 3815939 | 82 | 66 [0] | [0] 67 | [rph]–[rph] | [rph], [rph] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3815857 | 0 (0.000) | 60 (0.870) | 46/262 | 0.4 | 100% | pseudogene (24/48 nt) | rph | ribonuclease PH (defective),enzyme, Degradation of RNA, RNase PH |
| ? | NC_000913 | 3815940 = | 0 (0.000) | pseudogene (609/669 nt) | rph | ribonuclease PH (defective),enzyme, Degradation of RNA, RNase PH | |||||
ACCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATGGGTGAACGGCTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGT > NC_000913/3815718‑3815996 | acCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATAGGGCTCCTTAAACATCAGTCGGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgt > 2:474788‑M1/1‑140 (MQ=255)acCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCCCCTCATCCTACCTTCCTACAGACAAAACAAACCCGACCCACCAGACGCCTTAAAAATCAGTTTACCAGAGCCGCCTTCTGCcgt > 2:275290‑M1/1‑140 (MQ=255) gcttgctAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccc > 2:817926‑M1/1‑136 (MQ=255) cttgctAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccct < 2:1255191‑M1/143‑9 (MQ=255) cttaaGCGCAAATTCAATATGCTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgca < 2:379504‑M1/141‑12 (MQ=255) cgcgcaAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGTTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGTCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttc < 1:396691‑M1/142‑16 (MQ=255) cgcAAATTCTATAAACTGGCGCAGAGATGGAGTCATGCCTACGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaa < 2:120074‑M1/143‑18 (MQ=255) gcacatgcagttacctggcgctgatatggTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAGAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaat < 1:550455‑M1/129‑19 (MQ=255) gcAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCCGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcccttcaat > 2:126101‑M1/1‑125 (MQ=255) aaactcacaaaactgccgctgATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTGCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatga < 1:352002‑M1/134‑21 (MQ=255) ttCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTACATGCCTTCGCTCCTCATCTTACCTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgc < 2:396453‑M1/143‑24 (MQ=255) cAATAACCGGGCGCTGATATGCTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgc < 1:362337‑M1/143‑26 (MQ=255) cAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgc < 2:837886‑M1/143‑26 (MQ=255) aaTAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcccttcactgatgcgcc > 2:1121170‑M1/1‑117 (MQ=255) gtggctgaGAGGTTTTCATGCCTTCGCTCGTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcg < 1:43283‑M1/140‑35 (MQ=255) ggCGCTGATATGGTTTCAGGCCGTCGCGCGTCATCTTACTTGTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcg < 1:1205100‑M1/143‑35 (MQ=255) gcTGATATGGTTTCATGCCTTCACTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtc > 2:189611‑M1/1‑106 (MQ=255) tGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTTCAGACGAAAAAAAGCCCACTCATCTGCCGCTTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacctcaatgatgcgcccgtcttcggtcat < 2:48218‑M1/143‑40 (MQ=255) tGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcat > 2:1004857‑M1/1‑104 (MQ=255) acatggTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCGACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatca < 2:747320‑M1/141‑42 (MQ=255) atGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTCCAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAATTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcact > 2:1017631‑M1/1‑100 (MQ=255) gTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCCTCCTATCCTCTACACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacg < 2:651262‑M1/143‑47 (MQ=255) ttCATGCCTTCGCTCCTCATCTTATTTTTCTACAGTCAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGGTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgtt < 2:341456‑M1/143‑49 (MQ=255) ctgCCTTCGCTCCTCATCTGGCGTTTCTACAGAC‑AAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatg < 2:929160‑M1/142‑53 (MQ=255) aTGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcat > 1:403455‑M1/1‑92 (MQ=255) aTGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttact > 1:651856‑M1/1‑92 (MQ=255) gCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcccttcaatgatgcgcccgccttcggtcatcactacgttcatgt > 2:626988‑M1/1‑90 (MQ=255) cTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcgtcggtcatcactccgttcatgccg > 2:416319‑M1/1‑88 (MQ=255) cTTCGCTCCTCAGCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcg < 2:432512‑M1/143‑56 (MQ=255) ttCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcgg > 2:915060‑M1/1‑87 (MQ=255) gCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtct > 1:886857‑M1/1‑84 (MQ=255) gCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAATTTACCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcccttcaatgatgcgcccgtcttccgtcctcactaccttcacttcgtccg > 1:157359‑M1/1‑84 (MQ=255) ctcATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtccccagcaatgaaatgattcgcgcgtatgagcgcagcactacgttaatgtcggtctctgc > 1:967887‑M1/1‑80 (MQ=255) tCTTACTTTTCTCCAGACAAAAAAAAGGCGACTCGTCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggca < 1:160831‑M1/143‑68 (MQ=255) tCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggca > 2:1193400‑M1/1‑76 (MQ=255) ttACTCCTCTACAGACAAAAAAAAGGCGCCTCATCCGTAGCCTTAAAAATCAGTCTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcaga < 2:652844‑M1/143‑70 (MQ=255) ttttCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccttcttcggtcatcaatacgttcatgtaaataactgcagcagagtgt > 2:563269‑M1/1‑70 (MQ=255) ttttCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtct > 2:267617‑M1/1‑70 (MQ=255) ttttCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTACTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactaagtccatatcggtctctgctgccgagtcc > 2:1167337‑M1/1‑70 (MQ=255) tctccacagacAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtctt < 2:254733‑M1/138‑75 (MQ=255) tacagcaaagaaaaaaggcggctcatCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcaa < 2:776312‑M1/133‑78 (MQ=255) aCAGACAAAAAAAGGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaaggatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcaacg < 1:650641‑M1/143‑80 (MQ=255) gACAAAAAAAAGGCGACTACTCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgccttcggtcatctcctcgttcttgtctgtctctgcggcagagtcttcaacgtat < 2:54674‑M1/143‑83 (MQ=255) aCAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtctccggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcaacctagt > 1:980333‑M1/1‑60 (MQ=255) aCAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtccccagaacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgacgccgcgtcttcgacgtact > 1:246336‑M1/1‑60 (MQ=255) aaaGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcaacgtattccagatc < 1:189611‑M1/143‑91 (MQ=255) aaaGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAAGCAGGTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcaacgtattccagatc < 2:403422‑M1/143‑91 (MQ=255) ggCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcaacgtattccagatcgca < 1:1274562‑M1/143‑94 (MQ=255) gACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactccgttcctatccatctctgcggcagagtcttccaccaattccagatcgcacac > 1:293196‑M1/1‑47 (MQ=255) gACTCATCAGTCGCCTGAAACTTCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcaacgtattccagatcgcaaac < 1:979185‑M1/143‑97 (MQ=255) cTCATCGGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcaacgtattccagatcgcaaaccg < 1:758092‑M1/143‑99 (MQ=255) atcaGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcaacgtattccagatcgcaaaccgctt > 1:61368‑M1/1‑42 (MQ=255) tCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcactgatgcgcccgtcttcgatcatccctccgtccatgtccgtctctgcggccgagtcttccacgccttccagatcgcaacctccttcgccg > 2:316743‑M1/1‑37 (MQ=255) tCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcatcgtcttccagctcgcaacccgcttcgccg > 2:272438‑M1/1‑37 (MQ=255) ccTTAAAAAGCGGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcactgccatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcaacgtattccagatcgcaaaccgcttcgccgttc < 2:530474‑M1/143‑110 (MQ=255) aaaTCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcacgtcttcggccatccctccgctcatctcggtctctgcggcagactcttcaacgtataccagatcgcaacccccctcgccgttcacaatt > 1:162188‑M1/1‑28 (MQ=255) tcgacagctCCACCTTCTGCcttcctctgcacttcaatgatgcgcctgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcaacgtattccagatcgcaaaccgcttcgccgttcacaattccgacaga < 1:1003407‑M1/139‑124 (MQ=255) gcgcCGCCTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcaacgtattccagatcgcaaaccgcttcgccgttcaccattccgccagcaactgc > 2:896905‑M1/1‑14 (MQ=255) gccgccTTCTGCcgtcccctgcacttcactgttgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcaacgtattccagagcgcaaaccgcttcgccgttcacaattccgacagaaactgcgg < 1:633314‑M1/143‑132 (MQ=255) gccgccTTCTGCcgtcccctgcactgcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtctgtctctgcggcagagtcttcaacgtattccagatcgcaaaccgcttcgccgttcacaattccgacagaaactgcgg < 1:180265‑M1/143‑132 (MQ=255) cgccTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcaacgtattccagatcgcaaaccactgcgccggtcacaattccgccagagactgcggcc > 2:1237489‑M1/1‑10 (MQ=255) ctttctGCtgttccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcaacgtatgccagatcgcaaaccgcttcgccgttcacaattccgacagaaactgcggctac < 2:157359‑M1/141‑136 (MQ=255) ccTTCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcagcggattggacatcccaaaccgcttcggcgtgcacaattccgacagaaactgcggccac > 1:1120319‑M1/1‑8 (MQ=255) ttCTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcaacgtattccagatcgcaaaccgcttcgccgttcacaattccaacagtaaatgcggctaaaa > 2:156614‑M1/1‑6 (MQ=255) cTGCcgtcccctgcacttcaattatgtctccgtcttctgtcatcacaacgttcatgtcggtctcggcggcagaggcgtcaacgtattccagatcgcaaaccgcttcgccgttcacaattccgacagaaactgcggctaccatc < 2:651856‑M1/143‑140 (MQ=255) cTGCcgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcaacgtattccagatcgcaaaccgcttcgccgttcacaattccgacagaaactgcggctaccatc < 2:403455‑M1/143‑140 (MQ=255) | ACCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATGGGTGAACGGCTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGT > NC_000913/3815718‑3815996 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |