New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 609415 | 81 (1.090) | 3 (0.040) | 3/266 | 10.8 | 3.8% | intergenic (+238/+44) | insL1/entD | IS186 transposase/phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex |
? | NC_000913 | = 609431 | 75 (1.070) | intergenic (+254/+28) | insL1/entD | IS186 transposase/phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATCTGA > NC_000913/609289‑609573 | aaaCGCGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTg < 2:679704/142‑1 (MQ=255) aaCGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGc < 1:628309/143‑1 (MQ=255) gtggcagcggtgCGTCGTATTCTTCAGATGGTTCATCCCTTGAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCggg < 1:336839/132‑1 (MQ=255) caGGCACCCAGACGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCGTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGTACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCggg < 1:371768/142‑1 (MQ=255) agtcACCGAGGCGTTGCAGTCTTCAGATCGTTCAACCCTTTAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATTCCCGCATAGCCGGTTGTCAGGTCGGGATGGTTGTGCTCCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGc < 1:680852/140‑1 (MQ=255) gCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACCCTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGa > 2:734390/1‑143 (MQ=255) cACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGaa > 2:1178683/1‑143 (MQ=255) aCCGTGGGGTAGCAGTCTGCAGATGGTTCAAGCCTTTGGTGAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGGCAGGGTGGTAGGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAAt < 1:964812/143‑1 (MQ=255) aCCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCCTATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGAAAGGCACCTACTTTACACCTTCGCCCGTGGCAAGCGATGGCTCAGGGCGact > 1:1118241/1‑141 (MQ=25) ggCGTCGCATTCTTCTGATGGTTCAACCCTTAATTGAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGCTGTCAGGGTAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTAc < 1:80167/143‑1 (MQ=255) cGTCGCATTCTTCAGATGGTTCCACCCTGTGGTGAGCGCGTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCa < 2:534094/143‑1 (MQ=255) tCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGa < 2:910768/143‑1 (MQ=255) tCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCACCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGa > 2:792862/1‑143 (MQ=255) tCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGGCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATCGCTGCGGGCGAATCGGACGAgc > 1:536753/1‑142 (MQ=255) gCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCGCCTGCGTTACACTTTCGCCCGTGGTCTGGGCTGGCTTCCGGCGATTTGTAGCAgttt > 2:370708/1‑140 (MQ=37) aTTCTTCAGATGGTTCAGCCCCTCAGTTGGCGCGTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGAtgtt < 1:1001692/143‑1 (MQ=255) ttcttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGAtgttg > 1:595253/1‑143 (MQ=255) tcttcAGATGGTTCAACCCTTTAGTTAGCGCGTATGGGTGTTATCCCCGCATATCGGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTGTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGAtgttgt < 2:40579/143‑1 (MQ=255) tcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCaa > 2:564731/1‑143 (MQ=255) tcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCaa < 2:520457/143‑1 (MQ=255) cAGATGGTTCAACCCTTAATTTATCGCTTATGGTAGTTATCCCCGTATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAAt < 2:310875/143‑1 (MQ=255) ggTTCAACTCGTAGGTTAGCGCTTATGGCAGTGATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGACCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATc < 1:43383/143‑1 (MQ=255) cccTTATGTGAGCTCTTAGCGGAGTACTCGCCGTGTATCCGGTGGTCAGGTCAGGATTGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGTGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTgg < 1:167283/143‑1 (MQ=255) ccTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAGTCGTACCAGATGTTGTCATTTAATCGGGTTggg > 2:431913/1‑142 (MQ=255) cTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGGCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTAACAGAAGTTGTCAATTAATCGTGTTGTca > 2:685798/1‑143 (MQ=255) cTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGCGTTGGca > 2:395352/1‑143 (MQ=255) ttAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAAGCGTACCAGCTGTTGTGCATTAATCGTGTTGGcac > 1:943845/1‑143 (MQ=255) gTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATGGTGTTGGCACAGCg > 1:1204375/1‑143 (MQ=255) ttAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACTAGATGTTGTAAATTAATCGTGTTGACACAGcat > 2:751889/1‑141 (MQ=255) gcgcTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTAt > 2:1035978/1‑143 (MQ=255) gcgcGTATGTGAGTAAGCCCCCGAGAGCCGGCTGTGAGGGCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCCCCCGTGTTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTAt < 1:1132869/143‑1 (MQ=255) gcacgaaTGGGAGTAAAGCCCGCGTATCCGGGTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTAt < 2:440220/137‑1 (MQ=255) cgcTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTtgtg > 2:804110/1‑143 (MQ=255) agtgaTGTGAGTGCTCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGa < 2:584320/139‑1 (MQ=255) aTGGGAGTAATCCCCGCATGTCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAt < 1:760864/143‑1 (MQ=255) gTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGTATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAtcttttc < 1:127233/143‑1 (MQ=255) gTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAtcttttc < 1:440364/143‑1 (MQ=255) gaaTCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAtcttttct < 2:52760/142‑1 (MQ=255) aTCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGCTGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTAtcttttcttt > 1:331648/1‑143 (MQ=255) cccGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCACCTGGTCAGTCAGGGCCGCGGGCGCATCGTACCAGCAGTTGTCAATTAACCATCTTGCGCCAGCGTTATGACTCTCTCTTCTTTTag > 1:320505/1‑142 (MQ=255) tcGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGCCTATCTTTTCTTTTATc < 1:578561/142‑1 (MQ=255) tatCCGGGTGTCAGGTGAGGGTGGTAAGGCACCTGCTGTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTTAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCa < 1:907620/143‑1 (MQ=255) tCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACCATCTTTTCTTTTATCTGcccgc > 1:528004/1‑140 (MQ=255) tCCAGTTATCAGGGTAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCCGt > 1:925163/1‑143 (MQ=255) ccGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACTTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTTATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCtgtg < 1:221847/143‑1 (MQ=255) ccGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTg < 2:274980/143‑1 (MQ=255) tcaggtcaggATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCGGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCCGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTCTCTTTTCTTTTATCTGCCGGTGAACCGCa > 1:347116/1‑143 (MQ=255) aggtcaggATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCaaa > 2:450777/1‑143 (MQ=255) aggccaggATGGTTAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGTCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCaaa < 2:1214578/143‑1 (MQ=255) gtcaggATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACa > 2:346910/1‑143 (MQ=255) gtcaggATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGACACAGCATTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGACAATGGACACCATACa > 2:819268/1‑143 (MQ=255) gtcaggATGGTAAGGCACCTGCTTTACACATTAGCCCGTGGCCAGTGATGGCTGCGGGCGAGTAGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCGTTTCTTTTATCTTCCAGTGAACagcaagca > 1:803929/1‑143 (MQ=255) tcaggATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATTGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACAt < 2:51752/143‑1 (MQ=255) ggATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACCtctc > 2:980630/1‑143 (MQ=255) gATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCAGCGGGACAAGCGTACCAGACGTAGTCAACTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACGATCTTTTCTTTTATCTGCGAGTGCAAAGCAAACAgctcc > 1:1126290/1‑142 (MQ=255) aTGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCAt < 1:804110/143‑1 (MQ=255) tAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATtctc > 2:713814/1‑143 (MQ=255) tAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATtctc > 2:949480/1‑143 (MQ=255) agacACCTGCATTACACTTTCGCCCGTGGTGAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGTACAGCGTTATGATTATCTTTTCTTTTATGTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCAc < 2:272448/140‑1 (MQ=255) gcgcccgCTGTACCCGTTCGCCCCGGTTCAGTGATGGCTGCGGGCCAATCGTACCCGATGTTGTCAATTACTCGTGTTGCCACCGCGTTATGACTATCTTTTCTTCTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGa < 1:1150880/137‑1 (MQ=255) gCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGa > 1:1159988/1‑143 (MQ=255) gCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTATCGATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCCCAGCAAACATCTCATCCTCACgc > 1:151638/1‑142 (MQ=255) aCCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCCCATTCTCACGatg > 2:928194/1‑143 (MQ=255) tGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGatgaat < 2:595253/143‑1 (MQ=255) cTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCATTTCTTTTATCTGCCAGTGCATAGCAAACATCTAATTCTCACGatgaatga > 1:317022/1‑143 (MQ=255) tttACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAGCATCTCATTCTCACGATGAatgat > 2:1073242/1‑143 (MQ=255) acacTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGAc > 2:1112670/1‑143 (MQ=255) cacTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCATATGTTGTTAATTAATCGTGTTGGCAAAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGAcc < 1:1084277/143‑1 (MQ=255) acgttCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACct < 2:127540/140‑1 (MQ=255) acTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACct > 1:627178/1‑143 (MQ=255) 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2:972760/143‑1 (MQ=255) gactGAGGGCGGCTGGCGAATCGTACCAGATGCTGTCAATTAATCGTGTTTGCAGAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACTATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGc < 2:987276/140‑1 (MQ=255) aGTGATGGCTGCGGGCAAATCGTACCAGATGTTGTCAATTACTCGTGCTGGCCCAGCGTTATGACTCACTTATCATTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCACACGATGAATGAGGAGCTGCAGTTTATGCCAGCt > 2:541593/1‑143 (MQ=255) gTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCGGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTa < 1:1178683/143‑1 (MQ=255) gTGATGGCTGCGGGCGAATCGAACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTCATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGATCATCCCAGCTa > 1:35108/1‑143 (MQ=255) tGATGGCTGCGGGCGAATCGTACAAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTATTTATTCCAGCTaa > 1:632204/1‑143 (MQ=255) gCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATc > 1:898684/1‑143 (MQ=255) gcgggcggATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATCTGa < 1:618897/143‑1 (MQ=255) | TAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATCTGA > NC_000913/609289‑609573 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |