New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1293032 = | 4 (0.060) | 71 (1.060) | 55/284 | 0.1 | 94.7% | intergenic (‑110/‑495) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | intergenic (‑55/‑483) | insA/uspC | IS1 repressor TnpA/universal stress protein |
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
GATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCT > NC_000913/1292890‑1293173 | gcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatcgacacagaagccactggagcacctcaaacacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacct < 1:12981‑M1/1‑1 (MQ=255) gATGTTGTTCAGAATTTTGAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAttt < 1:608067/143‑1 (MQ=255) gctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagacgccactggagcacctcaaaaacaccatcatacaatcaatcagtaagttggcagcatcaccTtg < 1:947443‑M1/3‑1 (MQ=255) gttgttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTtgt > 2:680952/1‑143 (MQ=255) gttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATAGTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTCAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTCTGTgcc > 2:11383/1‑143 (MQ=255) tCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGg > 1:528526‑M2/1‑142 (MQ=255) gcggaatTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTGTATTGGGGTGGTTTGTTGAGTTAAGAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGg > 1:602548‑M2/4‑142 (MQ=255) tccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTgccgcc < 1:228567‑M1/10‑1 (MQ=255) cAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGgg > 1:1059091‑M2/1‑141 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCACTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTCTTTTCTGCCGggc < 1:142779‑M2/143‑4 (MQ=255) aTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaat > 2:93763‑M2/1‑137 (MQ=255) ttttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatg < 1:1131307‑M2/143‑8 (MQ=255) cggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCaataa < 2:1022462‑M1/15‑1 (MQ=255) ggtgcgttggccggtccgcaccgccccgtcagtagctgaacagtagggacagctgatagaaacagaagccactggaggacctcaaaaacaccatcatacactaaagcggtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCaataaa > 2:511406‑M1/128‑143 (MQ=255) tgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcagctcaaaaacaccatcatacaataaatcagtaagttggcagcaacaccTTGTCCCGCCaataaata < 1:943126‑M1/18‑1 (MQ=255) cgggtcttcgcTCATTGTAGTAATCTCAAACTTAGAGTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATGCAGTTGTGCAATAGCCAGCAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactc > 1:409981‑M2/6‑132 (MQ=255) aaGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTACATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTAAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGcgtaatgactc < 1:1028935‑M2/143‑12 (MQ=255) aGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactcc > 2:1152148‑M2/1‑131 (MQ=255) tGCTTCGCTCAGTGGAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGGTGTTTATTTTGTGCGGgctaatgactccaa < 1:300960‑M2/143‑15 (MQ=255) ttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCttt < 2:445539‑M1/23‑1 (MQ=255) gCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTTTTTTGTGCAGggtaatgactacaac < 2:358534‑M2/143‑16 (MQ=255) cTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaact < 2:420168‑M2/143‑17 (MQ=255) taggcgccagcgcgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaaa > 1:582540‑M1/114‑143 (MQ=255) cATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgat > 1:879188‑M2/1‑120 (MQ=255) aTTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAGTTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgata < 2:568328‑M2/143‑25 (MQ=255) gcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAAtt < 1:585450‑M1/33‑1 (MQ=255) caccaccccctcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTa > 1:627395‑M1/110‑143 (MQ=255) accaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAg < 2:707088‑M1/35‑1 (MQ=255) ccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGc > 2:189874‑M1/108‑143 (MQ=255) taATCTCAAACGTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtttt > 1:1087855‑M2/1‑112 (MQ=255) cccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGa < 2:114904‑M1/40‑1 (MQ=255) gtcagtagctgaacaggagggacagctgatagacacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacgctaaatcagtcagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGaaaa > 1:703731‑M1/101‑143 (MQ=255) gtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGaaaa > 1:426269‑M1/101‑143 (MQ=255) tcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt < 2:133346‑M2/143‑37 (MQ=255) tcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtg < 1:886569‑M2/143‑37 (MQ=255) tagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCAAGAAATGAcgc < 1:96579‑M1/48‑1 (MQ=255) aCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcaga > 2:131075‑M2/1‑103 (MQ=255) aCTTATAGTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcaga > 1:332649‑M2/1‑103 (MQ=255) gctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactcaatcagtaagttggcagcataaccATGTGCCGCCAAAAAATATCTTTTCATAAAATTAACCAGAAAAgacgcag < 2:766959‑M1/50‑3 (MQ=255) tgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCa < 2:1123961‑M1/52‑1 (MQ=255) tatTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTGTATTTTGTGCCGggtaatgactcaaactaattgatagaggctaatggtcagataatg < 1:456534‑M2/143‑46 (MQ=255) aacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCttt < 2:389161‑M1/23‑1 (MQ=255) aacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCttt > 1:389161‑M1/90‑112 (MQ=255) gggTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga > 2:150542‑M2/1‑93 (MQ=255) agctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCAAGAAAAGCCGCGGCATATAGCCCTATTTa < 1:330552‑M1/66‑1 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAACTGTCGTTATATAAAATTAGCCAGAACAGACGCGGCATATAGCCCTATTTaca < 1:692432‑M1/68‑1 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTaca < 2:745068‑M1/68‑1 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTAaca < 1:1152468‑M1/68‑1 (MQ=255) tgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcattaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac > 1:426705‑M1/75‑143 (MQ=255) gAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcat < 2:178514‑M2/143‑63 (MQ=255) atagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactcaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTACCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCg < 2:617363‑M1/71‑1 (MQ=255) agaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCgat > 2:519737‑M1/71‑143 (MQ=255) agaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCgat > 2:1119504‑M1/71‑143 (MQ=255) taataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctc > 2:757063‑M2/1‑74 (MQ=255) taataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATCTTGTGCCGggtaatgtctccaccgaattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactctgtcatgcagctc < 2:538853‑M2/143‑70 (MQ=255) acagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagtcggcagcatcaccTTTTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGCAAAGACGCGGCCTATATCCCTATTTACACCGCTGAtt < 1:846037‑M1/77‑1 (MQ=255) gaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCg > 1:390107‑M1/64‑143 (MQ=255) cactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCgcagca < 2:303595‑M1/85‑1 (MQ=255) actggcgcaccgcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCAc > 2:548937‑M1/58‑143 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTTTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgacgccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttt > 1:1101203‑M2/1‑64 (MQ=255) aaaTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGTCGggtaatgactccatcttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttga > 2:143885‑M2/1‑62 (MQ=255) ttcgtttgtgcaATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTTTTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaa > 1:199748‑M2/6‑59 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaa > 1:890745‑M2/1‑59 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGATCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgactttgagaa < 1:551366‑M2/143‑85 (MQ=255) gcacctcaaaaacaccatcatacactgtttttgtaatttggcagcatcaccTTGTGCTGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGaga < 1:708570‑M1/92‑2 (MQ=255) tCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGgggaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaac > 2:772102‑M2/1‑58 (MQ=255) gTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgac > 2:1005540‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgaca > 2:45005‑M2/1‑54 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATGGAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTGaaa < 2:97919‑M1/97‑1 (MQ=255) tgCAATAGCCAGGCATGTAATGAATTCAAAATTGTTCTTTCTTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcg > 2:675510‑M2/1‑51 (MQ=255) tgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactacaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatccagctctaccgattttgagaacgccagcg < 1:1068901‑M2/143‑93 (MQ=255) aacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGGGCCGCCAATAAATATCTTTTCATCAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTc > 2:631580‑M1/42‑143 (MQ=255) caccagcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTCTCATTAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCt > 2:851075‑M1/40‑143 (MQ=255) tAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttc < 1:897578‑M2/143‑98 (MQ=255) catcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCGATTTACACCGATGATTTCGCAGCAAGTGAGGTTAAAACTTCCTGAt < 1:1155545‑M1/107‑1 (MQ=255) atcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGGTAAAACTTcctgctt < 1:1153890‑M1/108‑4 (MQ=255) cAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaa < 2:983381‑M2/126‑85 (MQ=255) cAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaa > 1:983381‑M2/1‑42 (MQ=255) aGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcc < 1:15354‑M2/143‑103 (MQ=255) tGTAAGGAATTCAAAACTGATTGGTATTTTGTGCCGggaaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctgcacggattttgcgaacgcacgcgacttccgtccgcgcc < 1:471209‑M2/143‑108 (MQ=255) taaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTcaca < 2:1165789‑M1/117‑1 (MQ=255) tAAGGATTTCAAAATTGTTCTTTGTTTTGTGCCGggtaatgactccacgttgttttttgtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgttatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgt > 1:1132085‑M2/1‑34 (MQ=255) tAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTGGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgt > 2:123189‑M2/1‑34 (MQ=255) aGGAATTTACAGTTCTTCTTTATTTTGTTGCGggtaatgcctccacctttttgttagttttttatgttcatttaatgcccgatgactttgtcatgcagctcccccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgc > 1:108475‑M2/1‑32 (MQ=255) atcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGAACGTGAGGTTGAAACTTCCTGATACATGTCACAttt < 1:167075‑M1/120‑1 (MQ=255) gtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGGTTCATGTCaccttttctg < 2:645105‑M1/124‑4 (MQ=255) gtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATCAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATg > 1:1007490‑M1/20‑143 (MQ=255) aaaaTTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatcttcagataatgcccgctgactttgtcatgcacctccaccgattttgagaacgacaccgccttcgctcccagccgtgccaggtcat < 1:723359‑M2/143‑120 (MQ=255) tggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGgaga > 2:809325‑M1/14‑143 (MQ=255) tCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcaga > 2:239806‑M2/1‑16 (MQ=255) catcaccTTGTGCCGCCAATAAAGTTCTTGGCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGCTAAAACTTCCTGATTCATGCCACATTTTATGGGGCGattaccg < 1:710093‑M1/136‑4 (MQ=255) ttATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattc > 1:104192‑M2/1‑13 (MQ=255) tcaccTTGGGCTGCTAATAAAGATCTTTTCATAAAATTAGACAGAAAAGGCGCGGCATATAGACCTATTTACACCGATGATGTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTa > 2:585450‑M1/6‑143 (MQ=255) tATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattca < 2:1057537‑M2/143‑132 (MQ=255) tATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattca > 2:52402‑M2/1‑12 (MQ=255) agtttgtGCCGggtaatggctccgacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttggagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcag > 1:1105991‑M2/3‑11 (MQ=255) aTTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcag > 2:817753‑M2/1‑11 (MQ=255) ccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGc < 1:836728‑M1/141‑1 (MQ=255) gttGTGTCGGTAATAAATTTCTTTTCATTCAATTAGCCAGATAAGACGCGGCATATAGCCATATTTACATCGATGAGTTCGCAGCACGTGAGGGTAATACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCt < 1:730986/142‑1 (MQ=255) cTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGAGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATCCTCGTAGgcc < 1:338511‑M1/142‑2 (MQ=255) | GATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCT > NC_000913/1292890‑1293173 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |