| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,678,024 | C→T | intergenic (‑121/‑403) | pntA ← / → ydgH | pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit/DUF1471 family periplasmic protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,678,024 | 0 | C | T | 98.8% | 260.1 / NA | 84 | intergenic (‑121/‑403) | pntA/ydgH | pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit/DUF1471 family periplasmic protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (42/41); minor base A (1/0); total (43/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATAATTGTCTTCGACG > NC_000913/1677885‑1678161 | ttGGTATGCCAATTCGCATGGTATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTGAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTa < 1:612811/143‑1 (MQ=255)ttGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTa < 2:452914/143‑1 (MQ=255) cggTATGCCAATTCGCATGATATCCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTAc < 2:806533/142‑1 (MQ=255) gCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGCATTATTGATGATTTTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGaaaa > 2:800939/1‑143 (MQ=255) ccAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAAt < 1:303959/143‑1 (MQ=255) aTTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTAt < 1:269128/143‑1 (MQ=255) ttCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATg < 2:693895/143‑1 (MQ=255) cATGATATTCCCTTCCATCGGTCTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGACAGGAGCCACACCAGCTGCTCATGTCCGCGCTAAATGTTACTCCGTAAAACGAAATCAGTAACAACCGCCCTCTAGTGTGCTGAAAATTATCCCtg > 1:489060/1‑143 (MQ=255) tGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCtgt < 2:373459/142‑1 (MQ=255) tGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCtgt > 1:373459/1‑142 (MQ=255) tGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAAATATGCCtgtg > 1:1029066/1‑143 (MQ=255) atatTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCGCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAAGAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGAt > 2:593775/1‑143 (MQ=255) ttCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTa > 2:1115205/1‑143 (MQ=255) ttCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTa < 2:194947/143‑1 (MQ=255) ttCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTCTGATCTa > 1:63804/1‑143 (MQ=255) tCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGAACTAg > 2:566761/1‑143 (MQ=255) cccTTCCGTCGGTTTTATTGATGATGGGTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAgc < 1:847080/143‑1 (MQ=255) ccTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAgcg > 2:3116/1‑143 (MQ=255) ttCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGcc > 1:342926/1‑143 (MQ=255) cATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCaaa > 1:737175/1‑143 (MQ=255) cATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCaaa > 1:666262/1‑143 (MQ=255) aTCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATCATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCaaaa > 2:759241/1‑143 (MQ=255) aTCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATCATGTACTGAAAATTATGCCTGTGAACTAGCGCCaaac > 1:971054/1‑142 (MQ=255) aTCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCaaaa > 2:979717/1‑143 (MQ=255) aTCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCaaaa > 1:399522/1‑143 (MQ=255) ctctgctATTTATGACGGTTGGCCTGTGTCCTGAGCCACACAACCGCCGCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGCTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAAt < 1:187809/137‑1 (MQ=255) ggTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATACTGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCGAGCGCCAAAAATc > 2:224224/1‑143 (MQ=255) tttATTGGTGATGGTGTGCGTGTGCCAGGAGCCCCGCAAGCTGCTCATGTGCGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGt < 1:223160/143‑1 (MQ=255) ttATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAACTTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTa > 2:243308/1‑143 (MQ=255) tgatgGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGc < 2:708546/143‑1 (MQ=255) tgatgGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGc < 2:183742/143‑1 (MQ=255) atgGTTTGCGTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGt < 2:66178/143‑1 (MQ=255) tgGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGtgtg > 2:170739/1‑143 (MQ=255) ccTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGc < 2:529458/143‑1 (MQ=255) ccTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGc < 2:768585/143‑1 (MQ=255) cTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGACAATAATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCCGTATTTCGGCCTGAAGCCGCa > 1:125082/1‑143 (MQ=255) cTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGCTCTCGCGCCAACAATCAGTATTTCGTCGTGAAGTCGCa > 1:230745/1‑143 (MQ=255) cTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCa > 2:223923/1‑143 (MQ=255) gtCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAat > 2:1049889/1‑143 (MQ=255) tCAGGAGCCACGCAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTCTAATGTACTGCAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAata > 2:888120/1‑143 (MQ=255) gAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTaa < 2:20508/143‑1 (MQ=255) gAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTaa > 2:301829/1‑143 (MQ=255) aGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAAc < 2:1056800/143‑1 (MQ=255) cacaAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAACAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCGAAATATTAACGATTc > 2:826245/1‑143 (MQ=255) gctCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGa < 2:273924/143‑1 (MQ=255) tCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATa < 1:800939/143‑1 (MQ=255) aTGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTAAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCATGATAGt > 1:603895/1‑143 (MQ=255) gTACGAGCTAAATGTTACTCTGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTCGCGCCTTAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTgg < 1:1134593/143‑1 (MQ=255) gTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTgg < 1:112032/143‑1 (MQ=255) cGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGAt < 2:708721/143‑1 (MQ=255) aGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATaa < 2:323037/143‑1 (MQ=255) aGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGACCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAAACAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATAAAAGAATCAGCCGTCATAGTGGGATaa > 1:563648/1‑143 (MQ=255) aaaTGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAACTATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAacac > 1:790752/1‑143 (MQ=255) tGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCtt > 2:665446/1‑143 (MQ=255) gTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTa < 2:778446/143‑1 (MQ=255) aCTCCGTTAAAATAAATTAGTACCAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGaa < 1:557321/143‑1 (MQ=255) aCTCCGTTAAAATAAATTAGTAACTAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGTCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGaa < 1:557346/143‑1 (MQ=255) aCTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGaa < 1:50497/143‑1 (MQ=255) tCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCC‑AAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCCGCCGTGATAGTGCGATAAGCACCttgcgacgc > 1:801486/1‑136 (MQ=255) ctttAAAATATATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGcc < 1:379890/141‑1 (MQ=255) ccttAAAATAAATTAGTAACAACCGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGcc < 2:133766/141‑1 (MQ=255) cGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGcc < 1:979717/143‑1 (MQ=255) cGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGATATCTAAAGAACGGAAAAATATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGcc > 1:85976/1‑143 (MQ=255) ttAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAAAGAATCAGCCGTGACAGTGGGATAAACACCTTACAACGCCgg > 1:493090/1‑143 (MQ=255) ttAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCAAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAACATATTAACGATTCAGCCGGGATAGTGGGATAAACAGCTTAGCACGCCgg > 1:1092904/1‑143 (MQ=255) aaaaTAAATTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGAt < 2:674621/143‑1 (MQ=255) aaataaatTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGGCAAATAGCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATa > 2:795094/1‑143 (MQ=255) ataaatTAGTAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATaaa < 2:342926/143‑1 (MQ=255) tAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATaa > 2:418534/1‑143 (MQ=255) tAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATaa < 1:1049889/143‑1 (MQ=255) tAACAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATaa > 1:177330/1‑143 (MQ=255) aCAAACGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATCTTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCCGATAAAGACTGATCAtt > 1:1029557/1‑143 (MQ=255) aaaCGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAACGACTGATAATTGt > 2:578300/1‑143 (MQ=255) aaCGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGCTAAAGACTGATAATTATc > 1:759399/1‑143 (MQ=255) aaCGCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATAATTGTc < 1:223923/143‑1 (MQ=255) gCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGTGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATAATTGTCTTc < 1:170739/143‑1 (MQ=255) gCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATAATTGTCTTc < 2:737175/143‑1 (MQ=255) gCCCTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATAATTGTCTTc < 1:602519/143‑1 (MQ=255) cacTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATAAGTATTTCGGCGTAAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGAAAGTAGGATAAAAACATTAGAACGCCGGATCAAGACTGGTAATTGtactgg > 1:187543/3‑138 (MQ=255) ccTATAGTGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATAATTGTCTTCGa < 2:125082/143‑1 (MQ=255) ccTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATAATTGTCTTCGa > 1:810934/1‑143 (MQ=255) cgataATGTACTGAAAACTAAGCCCCTAATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATAATTGTCTTCGAc < 2:210649/141‑1 (MQ=255) cTATAATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATAATTGTCTTCGAc < 2:418913/143‑1 (MQ=255) tataATGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGAGAAACTGGTATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATAATTGTCTTCGACg > 2:1152786/1‑143 (MQ=255) | TTGGTATGCCAATTCGCATGATATTCCCTTCCATCGGTTTTATTGATGATGGTTTGCCTGTGTCAGGAGCCACACAAGCTGCTCATGTACGAGCTAAATGTTACTCCGTTAAAATAAATTAGTAACAAACGCCCTATAACGTACTGAAAATTATGCCTGTGATCTAGCGCCAAAAATCAGTATTTCGGCGTGAACTCGCAAAATATTAACGATTCAGCCGTGATAGTGGGATAAACACCTTAGAACGCCGGATAAAGACTGATAATTGTCTTCGACG > NC_000913/1677885‑1678161 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |