| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 957,906 | T→C | 5.3% | L85P (CTG→CCG) | serC → | 3‑phosphoserine/phosphohydroxythreonine aminotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 957,906 | 0 | T | C | 5.3% | 227.8 / 2.3 | 75 | L85P (CTG→CCG) | serC | 3‑phosphoserine/phosphohydroxythreonine aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/32); new base C (2/2); total (41/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.34e-01 | |||||||||||
ATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGTTGATGGTCTGCGCGCGGTTAAGCCAAT > NC_000913/957761‑958053 | aTGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGaa > 3:93562/1‑149 (MQ=255) tGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAat < 1:26656/149‑1 (MQ=255) gAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCCGAatat > 4:143723/1‑149 (MQ=255) gAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCCGAatat > 4:148801/1‑149 (MQ=255) tGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATtctc > 5:243596/1‑149 (MQ=255) ggcACCGTGGCAAAGAGTTCCTTCAGTGTGCCGAGGAAGCCGAGCCGGCTTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCACCTACAAGTTATTATTCTGCCAGGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCggg < 5:80328/147‑2 (MQ=255) gTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGt < 6:243596/149‑1 (MQ=255) cACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGa > 2:199786/1‑149 (MQ=255) ccGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGGGAt > 2:207576/1‑148 (MQ=255) gCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAac > 7:225001/1‑148 (MQ=255) gagTTCATTCAGGGTGCAGAGGACGCCGAGAAGGAGTTTCGCGATCTGCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGc < 6:76071/149‑1 (MQ=255) agTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCg > 8:28991/1‑147 (MQ=255) attcaGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTGTTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTa > 7:162574/1‑149 (MQ=255) attcaGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGCTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACAGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGAAGATTa > 6:345691/1‑149 (MQ=255) ttcaGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTAt < 2:281890/149‑1 (MQ=255) cggTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGGCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGt < 2:139981/147‑1 (MQ=255) aGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGtt < 7:225369/149‑1 (MQ=255) ggTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTg < 7:46531/149‑1 (MQ=255) gtggCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACCAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGa < 6:269596/146‑1 (MQ=255) gTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGa < 7:28991/149‑1 (MQ=255) cAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTGTTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGc < 8:162574/148‑1 (MQ=255) cAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGcc > 2:15983/1‑149 (MQ=255) agagGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGCTTATGTTGATGCCg > 3:294471/1‑149 (MQ=255) agGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAACACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGt > 2:141462/1‑149 (MQ=255) agGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGt > 8:220323/1‑149 (MQ=255) gAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTa < 1:199786/149‑1 (MQ=255) gAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTa > 3:25953/1‑149 (MQ=255) ccGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTgg > 3:190079/1‑149 (MQ=255) cGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCATCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTggg > 5:296787/1‑149 (MQ=255) gagaAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTa > 5:192915/1‑128 (MQ=255) gagaAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTa < 6:192915/128‑1 (MQ=255) gagaAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGggc > 5:111751/1‑149 (MQ=255) aaGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGggcgg > 8:22426/1‑148 (MQ=255) aTTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGt > 5:42963/1‑149 (MQ=255) tCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGggcggc < 6:84209/141‑1 (MQ=255) tCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGggcggc > 5:84209/1‑141 (MQ=255) tcttAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATCGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAaagaa < 6:296787/148‑1 (MQ=255) cttAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTaa < 6:2026/143‑1 (MQ=255) cttAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCCGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAaagaa < 3:148801/147‑1 (MQ=255) cttAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCCGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAaagaa < 3:143723/147‑1 (MQ=255) aaTGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAaagaag > 3:49024/1‑145 (MQ=255) aaTGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAaagaag < 4:49024/145‑1 (MQ=255) tCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGaaaaaa < 7:22426/149‑1 (MQ=255) cTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACt > 3:258011/1‑149 (MQ=255) cAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATa > 7:127467/1‑144 (MQ=255) cAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATa < 8:127467/144‑1 (MQ=255) cTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGTTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGc < 5:286526/149‑1 (MQ=255) cTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCGGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGc > 8:142442/1‑149 (MQ=255) aaGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTaa > 8:281632/1‑149 (MQ=255) aaGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTaa < 7:220323/149‑1 (MQ=255) ggTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAACACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGGGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATg > 6:155330/1‑149 (MQ=255) ttCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGa < 6:42963/149‑1 (MQ=255) ttCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGa > 1:225940/1‑149 (MQ=255) tggtCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTg < 7:281632/149‑1 (MQ=255) gtCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGt < 6:111751/148‑1 (MQ=255) tCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGtt > 7:151714/1‑148 (MQ=255) tCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTGACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTACTGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGTTg < 4:190079/149‑1 (MQ=255) cgGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTTAATATTCTCGGTGATAAAACCACCTCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGTTGATg < 6:120513/149‑1 (MQ=255) gTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGTTGATGGt > 2:88907/1‑149 (MQ=255) gTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACAACAGCAGATTATGTTGATGCCGGATACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGTTGATGGt > 1:211951/1‑149 (MQ=255) gggtgctgcGGTACCGCTGAATCTTCTCGGCGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAACGAACCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCGAAAGTGACTGTTGATGGGCTgc < 6:253956/146‑1 (MQ=255) tttGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATa > 2:62779/1‑101 (MQ=255) tttGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATa < 1:62779/101‑1 (MQ=255) tgcGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGACATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGTTGATGGTCTGCGCGCgg > 5:145261/1‑149 (MQ=255) cGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGTTGATGGTCTGCGCGCGGt > 2:191830/1‑148 (MQ=255) cGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTAAGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAaag > 2:338830/1‑81 (MQ=255) cGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTAAGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAaag < 1:338830/81‑1 (MQ=255) gTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGTTGATGGTCTGCGCGCGGtt > 2:94582/1‑147 (MQ=255) gTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGTTGATGGTCTGCGCGCGGTTaa < 2:8540/149‑1 (MQ=255) tACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGTTGATGGTCt > 7:181037/1‑136 (MQ=255) tACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGTTGATGGTCt < 8:181037/136‑1 (MQ=255) cGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGTTGATGGTCTGCGCGCGGTTAAGcc > 3:270312/1‑148 (MQ=255) cTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGa < 2:322361/107‑1 (MQ=255) cTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGa > 1:322361/1‑107 (MQ=255) cTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGTTGATGGTCTGCGCGCGGTTAAGCCAAt > 6:170640/1‑149 (MQ=255) atGAAAATTCTCGGTGATAAAACCACCTCAGATTATGTTGATGCCGGTAACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGACAAAGTGACTGTTGATGGTCTGCGCGCGGTTAAGCCAAt < 3:269242/148‑1 (MQ=255) | ATGGAAGTGAGTCACCGTGGCAAAGAGTTCATTCAGGTTGCAGAGGAAGCCGAGAAGGATTTTCGCGATCTTCTTAATGTCCCCTCCAACTACAAGGTATTATTCTGCCATGGCGGTGGTCGCGGTCAGTTTGCTGCGGTACCGCTGAATATTCTCGGTGATAAAACCACCGCAGATTATGTTGATGCCGGTTACTGGGCGGCAAGTGCCATTAAAGAAGCGAAAAAATACTGCACGCCTAATGTCTTTGACGCCAAAGTGACTGTTGATGGTCTGCGCGCGGTTAAGCCAAT > NC_000913/957761‑958053 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |