New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3845531 = | 62 (0.830) | 87 (1.210) | 58/492 | NT | 57.5% | coding (1568/1767 nt) | adeD | cryptic adenine deaminase |
? | NC_000913 | = 3992760 | 69 (0.960) | coding (1608/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase |
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
AAAATGGTTTTGATCGCGATGATGTGAGCTTTATTGCCGTACTTGAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGGCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGCGACGGTCAGCCATGACAGCCATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCAGTCAGGGGCTATTTGATGGCGAGAAGTTTGCCTTCACTACGCTGGAAGTCACGGAATAATAAAAAAAGCCCGGCGTCATGCCGGGCAAAAGTCACCAGTTACGTTTATGCCACTGTCAACTGCTGAATTTTTTTCTCGCGGCGGATT > NC_000913/3845249‑3845818 | aaaaTGGTTTTGATCGCGATGATGTGAGCTTTATTGCCGTACTTGAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGGCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGCGACGGTCAGCCATGACAGCCATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGGGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCGTTGCCGGGCTCATGAGCCCCg > 2:309927/1‑288 (MQ=255) 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tGATCGCGATGATGTGAGCTTTATTGCCGTACTTGAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGGCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGCGACGGTCAGCCATGACAGCCATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTAACCATTGCCGGGGTGATGAGCACCGACACGGCGCAg > 1:73576/1‑289 (MQ=255) accgaatctgacctttatttatgtgccgccgggccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAg < 2:447793‑M1/17‑1 (MQ=255) tatttatgtgccgccgggccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACaaa < 1:4370‑M1/33‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
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