New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2034871 | 69 (1.040) | 3 (0.050) | 3/268 | 9.9 | 4.3% | pseudogene (159/531 nt) | yedS | pseudogene, outer membrane protein homology; putative outer membrane protein |
? | NC_000913 | = 2034893 | 67 (1.070) | pseudogene (181/531 nt) | yedS | pseudogene, outer membrane protein homology; putative outer membrane protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTGCGCCCGTCCATCGCTTACCTGCAATCTA > NC_000913/2034733‑2035013 | tCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAata > 1:894531/1‑143 (MQ=255) tCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGATGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAata > 1:606939/1‑143 (MQ=255) gTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTCGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCCATCTg > 1:250174/1‑143 (MQ=255) aGGTTGGAGGTGGGTTGAATGGTCGTAGCCGTAGCCACCGAAATGCTTGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGAcc < 2:449619/143‑1 (MQ=255) ttGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGGGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATAtggt > 1:589780/1‑143 (MQ=255) tttAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATgtggtggtg > 2:670806/1‑143 (MQ=255) ttAAATGGTCGTAACCAGAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGAGGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATAtggtggtgg < 2:110184/143‑1 (MQ=255) ttAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCGCATAgggtggtgg > 1:1051213/1‑143 (MQ=255) ttAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGAGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATAtggtggtgg > 2:1183509/1‑143 (MQ=255) ttAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGATGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGATATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCAAATAtgttgctgg > 2:326136/1‑143 (MQ=255) tAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCACAATATGACCCCATATGGTGGTCGc > 1:80296/1‑143 (MQ=255) caacgagcGTAACCAGAGTTGCAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCg < 2:637047/136‑1 (MQ=255) aaTGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGa > 1:839863/1‑143 (MQ=255) tGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGt > 1:1038587/1‑143 (MQ=255) gATCGTAACCAGAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGtt < 2:81955/143‑1 (MQ=255) cGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGCCTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCCATATGACGCCACATGGGGGTGGCGAGTATGa > 2:353036/1‑143 (MQ=255) cGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGa < 2:363407/143‑1 (MQ=255) gTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGCCTGTTGGTGCAAAATATGGTGGAAAAAATGTGGACTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGAt > 1:1198377/1‑143 (MQ=255) gTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGAt < 1:842562/143‑1 (MQ=255) aCCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAAt > 2:224162/1‑143 (MQ=255) cATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATgg > 1:975064/1‑143 (MQ=255) aggaaCAGAAAGGCGGGTGGTGGAACCGCTGGAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGGATTTAGCAGCTATGTACGCTGTAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGa < 2:365905/140‑1 (MQ=255) gtgaCAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGaa < 2:1201685/140‑1 (MQ=255) aaCAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTAAGCTGAAACTCGCAATATGACACCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATc > 2:415288/1‑143 (MQ=255) aCAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCa < 1:126193/143‑1 (MQ=255) ctGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTTATAATTTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑Ca < 1:520021/142‑1 (MQ=255) aggCTCGTTGTGGAACCGCTTAACGGTGGACTGTGGGTGCACAATATGTGGCTCATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATACTGGTGAATCAAGAT‑‑Ca < 2:378771/141‑1 (MQ=255) aTGCTGGTGGTGTAACCGCTGAAGCATTGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑Ca < 2:979077/143‑1 (MQ=255) aTGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATCTGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑Ca < 1:720693/143‑1 (MQ=255) aTGCTGCTGGGGAAACCGCTGGAGCATGGACTGTTGGTGCAATATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTTTGTTCGCTGAAACGCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCTTGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑Ca < 2:449924/143‑1 (MQ=255) tggtggGGAACCCGCTGTAGCATGGATTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCa < 2:37019/143‑1 (MQ=255) gaggtgCAACCGCTGACGCAGCGACTCTTGGCGCAAAATAGCATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATCACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATc < 1:14199/141‑1 (MQ=255) ggtgAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCGATCGc > 1:437351/1‑143 (MQ=255) aaaCCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAGTAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCACGAT‑‑CCGCCATCGCTAAc > 2:983212/1‑143 (MQ=255) aCCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACaa > 1:711702/1‑143 (MQ=255) aCCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGGTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCGAACaa > 2:647151/1‑143 (MQ=255) cGCCGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTCCGCTGAAGCTCGTAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACaaaa < 1:732296/143‑1 (MQ=255) gCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAAc < 2:815390/143‑1 (MQ=255) ttgACTGTTCGTGCAAAATACGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCGATGTACGCTGAAACTCGCAACATGACCCCATATGGTGGTGGCGCGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACtt < 2:1085573/141‑1 (MQ=255) cTGTCGGTGCAAAATACGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCGGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATTGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGaa < 2:515120/143‑1 (MQ=255) tGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGCGTTTGTCCCGGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAg > 1:45657/1‑143 (MQ=255) tGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGttgttg < 2:589780/143‑1 (MQ=255) tGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGGTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGttgttg < 1:1174596/143‑1 (MQ=255) cAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCt < 1:751998/143‑1 (MQ=255) aaaTATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGCCCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCa < 1:1174985/143‑1 (MQ=255) atatGATGCTAATAATGTGTTTTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGt < 1:519187/143‑1 (MQ=255) atatGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAAGTTTGAAGATGTTGCTCAGt > 2:280040/1‑143 (MQ=255) tgatgGTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCGGAAGCTCGCAATATGACCGGATGTGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCCTCGCTGACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATc < 2:203914/143‑1 (MQ=255) taataaTGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCTCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACTCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCg > 1:52591/1‑143 (MQ=255) aataatGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGa > 1:962828/1‑143 (MQ=255) ataatGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAACCTAGGAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGGTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCCGTTCGAc > 1:824718/1‑143 (MQ=255) taatGTGTCTTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCTCATATGGTGGTGGCCACTTCGATAATTGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTCACAAAACCAGAAACTGTGAAGTCGTTGCTCAGTGTCAGGTCgccc > 2:1111911/1‑140 (MQ=255) atGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCACATATTTTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACttt < 1:224162/143‑1 (MQ=255) gtgtATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCGCTCGCTAACAAACCCCAAAACTTTGAAGGTGTTGATCAGTATCAGTTCGACTATgg > 2:472987/1‑143 (MQ=255) gtgtATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTgg > 2:611485/1‑143 (MQ=255) tgtATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACATTGGc > 1:289394/1‑143 (MQ=255) gtATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGcc > 2:313087/1‑143 (MQ=255) tATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGATACCATCCATC‑C‑AGCGAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCt > 1:553559/1‑143 (MQ=255) tttAGTAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTgc < 2:702993/143‑1 (MQ=255) ttAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTgcg < 1:463112/143‑1 (MQ=255) tAGAAGTTATGTACGCTGGAACGCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTgcgc < 2:707812/143‑1 (MQ=255) gcagcTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCCGCGccc < 2:1072241/143‑1 (MQ=255) agcTATGTACGCTGACACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTGCGCCCGt < 1:652539/143‑1 (MQ=255) tACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTGCGCTCGTCCAtagg > 2:501146/1‑140 (MQ=255) gCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGCCTTTGGCCTGCGCCCGTCCATCGCTTa > 2:1146732/1‑143 (MQ=255) tGAAACTCGCAATCTGACCCCATATGGTGGTGGCGAGCTCGATAATCGTGAATCAAAAT‑‑CCGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACCTTGAAGTTGTTGCCCAGTCCCAGAGCGCCCCCGGACTCCGCCCGCCCCTCGCTCAcc > 2:376920/1‑143 (MQ=255) tGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGATTGATAATTGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTGCGCCCGTCCATCGCTTAcc < 1:999545/143‑1 (MQ=255) gAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGCGAATCAACAT‑‑CTGCCATTGATCACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTAAGTCTTTGGCCTGCGCCCGTCCATCGCTTACCt < 2:975064/143‑1 (MQ=255) aCTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTGCGCCCGTCCATCGCTTACCTGCa < 1:1120921/143‑1 (MQ=255) cAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTGCGCCCGTCCATCGCTTACCTGCAATCTa > 1:181340/1‑143 (MQ=255) | TCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATGTGTATTTAGCAGCTATGTACGCTGAAACTCGCAATATGACCCCATATGGTGGTGGCGAGTTTGATAATGGTGAATCAAGAT‑‑CAGCCATCGCTAACAAAACCCAAAACTTTGAAGTTGTTGCTCAGTATCAGTTCGACTTTGGCCTGCGCCCGTCCATCGCTTACCTGCAATCTA > NC_000913/2034733‑2035013 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |