New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | = 3992760 | 65 (1.050) | coding (1608/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase |
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
TAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTT > NC_000913/3992619‑3992901 | tAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCACACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTg < 1:175397‑M2/143‑2 (MQ=255) cTGGTAGCGTGAGCATAGTTCAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACGCGTGTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcacc > 1:728807‑M2/1‑138 (MQ=255) cTGATGGCTTGAGCATGGTTTAACGGCATCCGGAGCCCGCGCGCCCGGTTGTATATCAAAGGTAACGGCATTGTCGCTTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcacc > 1:152612‑M2/1‑138 (MQ=255) tggtggCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccg < 1:1177222‑M2/143‑7 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aTGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGgcgc > 1:729099/1‑143 (MQ=255) aTGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGgcgc < 1:1158982/143‑1 (MQ=255) aTGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGgcgc < 2:515325/143‑1 (MQ=255) gTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGACATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCTCTGCGCTTATCTgcaccgacacggcgcagtcgct < 1:113640‑M2/143‑23 (MQ=255) tttAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGCCACCGAACGCGCTCTa > 1:802849/1‑143 (MQ=255) ttAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATGTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctgg > 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> 1:519944/1‑143 (MQ=255) ccTCGCGCACCCGTTTGTCTGTAAAAGGTAACGGCATTGTCGATGTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATc < 1:808045/143‑1 (MQ=255) cTCGCTCTCCTGTTTGTATATTAGAGTTAGCGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGAAGGAGATGGTCGCCGCCGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCTCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATcc < 2:793352/143‑1 (MQ=255) cTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgc < 1:1007308‑M2/143‑41 (MQ=255) tCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTtcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgcc < 1:551160‑M2/143‑42 (MQ=255) cgcgCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgcct < 1:430020‑M2/143‑43 (MQ=255) gcgcACCCGTTTGTATATTAAAGGTAAAGGCATTGTCGATTTGCATAAGTTGCAGGAGATGGGGGCAGTTGGGTCGCACCATTTCACGATGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGACGCTGTACAACACGTGTgcgactcgcg > 2:1110968/1‑137 (MQ=255) gcACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgccccgccacgacgcagtcgcccgcggaacaacttgacgccttga < 1:1069424‑M2/143‑46 (MQ=255) cACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaa > 1:15485‑M2/1‑97 (MQ=255) aCCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCCATTCGCCTAAGTTACAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATCTCCCGCTGCCCTTACCTCCACCGACCCCGAAGGCGCCCTCCCGCCCCCGTGCCATCCGcacgcg > 2:388866/1‑138 (MQ=255) cccGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaag > 2:461137‑M2/1‑95 (MQ=255) 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1:259067/138‑1 (MQ=255) cGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgaagcgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtgcgttacccagtgagccggttattccgagggcgtttctttacct < 2:857489‑M2/143‑113 (MQ=255) tCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgcca > 2:1112487‑M2/1‑27 (MQ=255) tCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGCCTATCGTCAACCTGGAACATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCACTCGGGTGGTGCATTTCGAttt > 2:111799/1‑143 (MQ=255) gCACCGTGTCCCGCTGCGCTTACCTGCGCCGATACGGTCGGCAGGCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTcc < 2:528374/143‑1 (MQ=255) gCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagaaggcgtttctttctctgccagt < 2:920464‑M2/143‑119 (MQ=255) gCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTcc > 1:619188/1‑143 (MQ=255) gCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTCGCGCCTCTCGGCAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCCCAATCAGCTGGTGCATTTCCATCTcc > 2:235016/1‑143 (MQ=255) cACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtg < 1:539619‑M2/143‑120 (MQ=255) cACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCCGGTGGTGCACTTCGATTTccc > 2:886064/1‑142 (MQ=255) cACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCGTTTCGATTTCCg > 1:647880/1‑143 (MQ=255) aCCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGt < 1:851622/143‑1 (MQ=255) tttCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccc > 1:975185‑M2/1‑19 (MQ=255) cccTCTGCGCGTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaggccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagacgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgc > 2:818230‑M2/1‑16 (MQ=255) cccGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCAGGGGCTTATCGTTAACCTGGGATATGACCGGACAGCGGCGTTACGCAACCAGGTGGGGCATTGCGAATACCGTGAGCTgg > 2:1039235/1‑143 (MQ=255) cGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaacgcggtagctccgccgatgagccgtttattcagaaggcgtttctttctctgccagtgatacccgcgc < 1:876260‑M2/143‑130 (MQ=255) cgcTTACCTgcaccgagacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgctacccgatgagccgtttattcagctggagtttccttctctgccagtgatccccgcgctaaaa > 2:427765‑M2/1‑9 (MQ=255) ttACCTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgtttcccgctgtgccgtttattcagttgtcgtttctttctctgccagtgctcccctcgctaaaacta < 1:252459‑M2/143‑138 (MQ=255) ttACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATTCGCAATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAg > 1:332573/1‑143 (MQ=255) aCCTgtacctacactgctcagtcgctggcggaacaaattgacgccttcaaagccgccgcccgttaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctaaaactaac > 1:80258‑M2/1‑4 (MQ=255) cTgcaccgacacggcgcagtcgctggcggaacaaattgacgccttgaaagccgccgcccgtgaatgcggtccgttacccgatgagccgtttattcagatggcgtttctttctctgccagtgatccccgcgctgaacctaccca < 1:960276‑M2/143‑142 (MQ=255) cTGCACCGACACCGAAGGCGCCCTAAAGCCCATGTGAGATCCGCCAGCTGGCGATTAGCGTCAACCTGGGATATGGCCCGACAGCGGCGTTCCGCAGTCAGGTGGTGCGTGTCGATCTCCGTACGCTGGAGGTCGTCGGCtgg > 2:535710/1‑141 (MQ=255) | TAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTT > NC_000913/3992619‑3992901 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |