| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4553753 | 21 (0.620) | 3 (0.090) | 3/468 | NT | 8.5% | coding (853/1461 nt) | uxuB | D‑mannonate oxidoreductase, NAD‑dependent |
| ? | NC_000913 | = 4554835 | 45 (1.420) | coding (260/774 nt) | uxuR | fructuronate‑inducible hexuronate regulon transcriptional repressor; autorepressor | |||||
CATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTACCAGGAAGTCGGGGCGATGATCCGCGATCTGATCATAAAGACGCCGTACAATCCTGGCGAACGGCTGCCGCCGGAGCGTGAAATTGCAGAAATGCTTGATGTCACGCGGACGGTGGTACGTGAAGCGCTGATCATGCTGGAGATCAAAGGGCTGGTGGAAGTACGCCGGGGTGCCGGTATCTATGTTCTTGATAACTCAGGCAGCCAGAACACAGACAGTCCGGATGCCAACGTCTGCAACGATGCCGGTCCTTTTGAGCTGTTACAGGCGCGGCAGTTATTGGAGAGCAACATCGCCGAGTTTGCCGCTTTGCAGGCTACCCGCGAAGATATCGTCAAAATGCGTCAGGCATTGCAACTGGAAGAGCGTGAACTGGCTTCCAGTGCGCCGGGCAGCAGCGAAAGCGGTGACATGCAGTTCCATCTCGCTATTGCCGAAGCAACGCATAACAGCATGCTGGTGGAGCTGTTCCGTCAGTCCTGGCAGTGGCGGGAAAACAATCCAATG > NC_000913/4554575‑4555115 | cATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTACCAGGAAGTCGGGGCGATGATCCGCGATCTGATCATAAAGACGCCGTACAATCCTGGCGAACGGCTGCCGCCGGAGCGTGAAATTGCAGAAATGCTTGATGTCACGCGGACGGTGGTACGTGAAGCGCTGATCATGCTGGAGATCAAAGGGCTGGTGGAAGTACGCCGGGGTGCCGGTATCTATGTTCTTGATAACTCAGGCAGCCAGAACACAGACAGTCCGGATGCCAACGTCTGCAACGATGCCGGTCCtttt > 1:255335/1‑289 (MQ=255) aTGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTACCAGGAAGTCGGGGCGATGATCCGCGATCTGATCATAAAGACGCCGTACAATCCTGGCGAACGGCTGCCGCCGGAGCGTGAAATTGCAGAAATGCTTGATGTCACGCGGACGGTGGTACGTGAAGCGCTGATCATGCTGGAGATCAAAGGGCTGGTGGAAGTACGCCGGGGTGCCGGTATCTATGTTCTTGATAACTCAGGCAGCCAGAACACAGCCAGTCCGGATGCCAACGTCTGCAACGATGCCGGTCCTTTTg > 2:157688/1‑289 (MQ=255) tGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTACCAGGAAGTCGGGGCGATGATCCGCGATCTGATCATAAAGACGCCGTACAATCCTGGCGAACGGCTGCCGCCGGAGCGTGAAATTGCAGAAATGCTTGATGTCACGCGGACGGTGGTACGTGAAGCGCTGATCATGCTGGAGATCAAAGGGCTGGTGGAAGTACGCCGGGGTGCCGGTATCTATGTTCTTGATAACTCAGGCAGCCAGAACACCGACAGTACGGATGCCAACGTCTGCAACGATGCAGGTCCTTTTAAGCTCtt > 1:265370/1‑288 (MQ=255) gCCACCTCTGCGCAAAGACCTTACCAGGAAGTCGGGGCGATGATCCGCGATCTGATCATAAAGACGCCGTACAATCCTGGCGAACGGCTGCCGCCGGAGCGTGAAATTGCAGAAATGCTTGATGTCACGCGGACGGTGGTACGTGAAGCGCTGATCATGCTGGAGATCAAAGGGCTGGTGGAAGTACGCCGGGGTGCCGGTATCTATGTTCTTGATAACTCAGGCAGCCAGAACACAGACAGTCCGGATGCcaacgtctgcaac < 2:90975‑M2/264‑14 (MQ=255) gCCACCTCTGCGCAAAGACCTTACCAGGAAGTCGGGGCGATGATCCGCGATCTGATCATAAAGACGCCGTACAATCCTGGCGAACGGCTGCCGCCGGAGCGTGAAATTGCAGAAATGCTTGATGTCACGCGGACGGTGGTACGTGAAGCGCTGATCATGCTGGAGATCAAAGGGCTGGTGGAAGTACGCCGGGGTGCCGGTATCTATGTTCTTGATAACTCAGGCAGCCAGAACACAGACAGTCCGGATGCcaacgtctgcaac > 1:90975‑M2/1‑251 (MQ=255) gcAAAGACCTTACCAGGAAGTCGGGGCGATGATCCGCGATCTGATCATAAAGACGCCGTACAATCCTGGCGAACGGCTGCCGCCGGAGCGTGAAATTGCAGAAATGCTTGATGTCACGCGGACGGTGGTACGTGAAGCGCTGATCATGCTGGGGATCAAAGGGCTGGTGGAAGTACGCCGGGGTGCCGGTATCTATGTTCTTGATAACTCAGGCAGCCAGAACACAGACAGTCCGGATGCCAACGTCTGCAACGATGCCGGTCCTTTTGAGCTGTTACAGGCGCGGCAg > 2:112063/1‑289 (MQ=255) gACCTTACCAGGAAGTCGGGGCGATGATCCGCGATCTGATCATAAAGACGCCGTACAATCCTGGCGAACGGCTGCCGCCGGAGCGTGAAATTGCAGAAATGCTTGATGTCACGCGGACGGTGGTACGTGAAGCGCTGATCATGCTGGAGATCAAAGGGCTGGTGGAAGTACGCCGGGGTGCCGGTATCTATGTTCTTGATAACTCAGGCAGCCAGAACACAGACAGTCCGGATGCCAACGTCTGCAACGATGCCGGTCCTTTTGAGCTGTTACAGGCGCGGCAGTTAtt > 1:85430/1‑289 (MQ=255) 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tCCTGGCGAACGGCTGCCGCCGGAGCGTGAAATTGCAGAAATGCTTGATGTCACGCGGACGGTGGTACGTGAAGCGCTGATCATGCTGGGGATCAAAGGGCTGGTGGAAGTACGCCGGGGTGCCGGTATCTATGTTCTTGATAACTCAGGCAGCCAGAACACAGACAGTCCGGATGCCAACGTCTGCAACGATGCCGGTCCTTTTGAGCTGTTACAGGCGCGGCAGTTATTGGAGAGCAACATCGCCGAGTTTGCCGCTTTGCAGGCTACCCGCGAAGATATCGTCaaa < 1:112063/289‑1 (MQ=255) tCCTGGCGAACGGCTGCCGCCGGAGCGTGAAATTGCAGAAATGCTTGATGTCACGCGGACGGTGGTACGTGAAGCGCTGATCATGCTGGAGATCAAAGGGCTGGTGGAAGTACGCCGGGGTGCCGGTATCTATGTTCTTGATAACTCAGGCAGCCAGAACACAGACAGTCCGGATGCCAACGTCTGCAACGATGCCGGTCCTTTTGAGCTGTTACAGGCGCGGCAGTTATTGGAGAGCAACATCGCCGAGTTTGCCGCTTTGCAGGCTACCCGCGAAGATATCGTCaaa > 2:143624/1‑289 (MQ=255) aaCGGCTGCCGCCGGAGCGTGAAATTGCAGAAATGCTTGATGTCACGCGGACGGTGGTACGTGAAGCGCTGATCATGCTGGAGATCAAAGGGCTGGTGGAAGTACGCCGGGGTGCCGGTATCTATGTTCTTGATAACTCAGGCAGCCAGAACACAGACAGTCCGGATGCCAACGTCTGCAACGATGCCGGTCCTTTTGAGCTGTTACAGGCGCGGCAGTTATTGGAGAGCAACATCGCCGAGTTTGCCGCTTTGCAGGCTACCCGCGAAGATATCGTCAAAATGCGTCa > 1:73497/1‑289 (MQ=255) 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cTCAGGCAGCCAGAACACAGACAGTCCGGATGCCAACGTCTGCAACGATGCCGGTCCTTTTGAGCTGTTACAGGCGCGGc > 1:90810/1‑80 (MQ=255) aGGCAGCCAGAACACAGACAGTCCGGATGCCAACGTCTGCAACGATGCCGGTCCTTTTGAGCTGTTACAGGCGCGGCAGTTACTGGAGAGCAACATCGCCGAGTTTGCCGCTTTGCAGGCTCCCCGCGAAGATAACGTCAAAATGCGTCCGGCATTGCAACTGGAAGAGCGTGAACTGGCTTCCAGTGCGCCGGGCAGCAGCTAAAGCGGTCACATGCAGTTCCATCTCGCTATTGCCCAAGCAACGCATAACAGCATGCTGGTGGAGCCGTTCCGTCAGTCCTGGctg > 2:119761/1‑287 (MQ=255) acacAGACAGTCCGGATGCCAACGTCTGCAACGATGCCGGTCCTTTTGAGCTGTTACAGGCGCGGCAGTTATTGGAGAGCAACATCGCCGAGTTTGCCGCTTTGCAGGCTACCCGCGAAGATATCGTCAAAATGCGTCAGGCATTGCAACTGGAAGAGCGTGAACTGGCTTCCAGTGCGCCGGGCAGCAGCGAAAGCGGTGACATGCAGTTCCATCTCGCTATTGCCGAAGCAACGCATAACAGCATGCTGGTGGAGCTGTTCCGTCAGTCCTGGCAGTGGCGGGaaaa < 1:267112/289‑1 (MQ=255) cgTCCGGATGCCAACGTCGTCAACGATGCCGGTCCTTTTGAGCTGTTACAGGCGCGGCAGTTATTGGAGAGCAACATCGCCGAGTTTGCCGCTTTGCAGGCTACCCGCGAAGATATCGTCAAAATGCGTCAGGCATTGCAACTGGAAGAGCGTGAACTGGCTTCCAGTGCGCCGGGCAGCAGCGAAAGCGGTGACATGCAGTTCCATCTCGCTATTGCCGAAGCAACGCATAACAGCATGCTGGTGGAGCTGTTCCGTCAGTCCTGGCAGTGGCGGGAAAACAATCCaa < 2:182124/288‑1 (MQ=255) gTCCGGATGCCAACGTCTGCAACGATGCCGGTCCTTTTGAGCTGTTACAGGCGCGGCAGTTATTGGAGAGCAACATCGCCGAGTTTGCCGCTTTGCAGGCTACCCGCGAAGATATCGTCAAAATGCGTCAGGCATTGCAACTGGAAGAGCGTGAACTGGCTTCCAGTGCGCCGGGCAGCAGCGAAAGCGGTGACATGCAGTTCCATCTCGCTATTGCCGAAGCAACGCATAACAGCATGCTGGTGGAGCTGTTCCGTCAGTCCTGGCAGTGGCGGGAAAACCATCCAAt > 1:5537/1‑289 (MQ=255) tCCGGATGCCAACGTCTGCAACGATGCCGGTCCTTTTGAGCTGTTACAGGCGCGGCAGTTATTGGAGAGCAACATCGCCGAGTTTGCCGCTTTGCAGGCTACCCGCGAAGATATCGTCAAAATGCGTCAGGCATTGCAACTGGAAGAGCGTGAACTGGCTTCCAGTGCGCCGGGCAGCAGCGAAAGCGGTGACATGCAGTTCCATCTCGCTATTGCCGAAGCAACGCATAACAGCATGCTGGTGGAGCTTTTCCGTCAGTCCTGGCAGGGGCTGGAAAACAATCCCAtg > 2:17916/1‑289 (MQ=255) gATGCCAACGTCTGCAACGATGCCGGTCCTTTTGAGCTGTTACAGGCGCGGCAGTTATTGGAGAGCAACATCGCCGAGTTTGCCGCTTTGCAGGCTACCCGCGAAGATATCGTCAAAATGCGTCAGGCATTGCAACTGGAAGAGCGTGAACTGGCTTCCAGTGCGCCGGGCAGCAGCGAAAGCGGTGACATGCAGTTCCATCTCGCTATTGCCGAAGCAACGCATAACAGCATGCTGGTGGAGCTGTTCCGTCAGTCCTGGCAGTGGCGGGaaaa < 2:168167/275‑1 (MQ=255) gATGCCAACGTCTGCAACGATGCCGGTCCTTTTGAGCTGTTACAGGCGCGGCAGTTATTGGAGAGCAACATCGCCGAGTTTGCCGCTTTGCAGGCTACCCGCGAAGATATCGTCAAAATGCGTCAGGCATTGCAACTGGAAGAGCGTGAACTGGCTTCCAGTGCGCCGGGCAGCAGCGAAAGCGGTGACATGCAGTTCCATCTCGCTATTGCCGAAGCAACGCATAACAGCATGCTGGTGGAGCTGTTCCGTCAGTCCTGGCAGTGGCGGGaaaa > 1:168167/1‑275 (MQ=255) | CATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTACCAGGAAGTCGGGGCGATGATCCGCGATCTGATCATAAAGACGCCGTACAATCCTGGCGAACGGCTGCCGCCGGAGCGTGAAATTGCAGAAATGCTTGATGTCACGCGGACGGTGGTACGTGAAGCGCTGATCATGCTGGAGATCAAAGGGCTGGTGGAAGTACGCCGGGGTGCCGGTATCTATGTTCTTGATAACTCAGGCAGCCAGAACACAGACAGTCCGGATGCCAACGTCTGCAACGATGCCGGTCCTTTTGAGCTGTTACAGGCGCGGCAGTTATTGGAGAGCAACATCGCCGAGTTTGCCGCTTTGCAGGCTACCCGCGAAGATATCGTCAAAATGCGTCAGGCATTGCAACTGGAAGAGCGTGAACTGGCTTCCAGTGCGCCGGGCAGCAGCGAAAGCGGTGACATGCAGTTCCATCTCGCTATTGCCGAAGCAACGCATAACAGCATGCTGGTGGAGCTGTTCCGTCAGTCCTGGCAGTGGCGGGAAAACAATCCAATG > NC_000913/4554575‑4555115 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |