New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4380827 | 56 (0.740) | 3 (0.040) | 3/496 | NT | 3.7% | coding (1493/1809 nt) | frdA | anaerobic fumarate reductase catalytic and NAD/flavoprotein subunit |
? | NC_000913 | = 4381015 | 101 (1.380) | coding (1305/1809 nt) | frdA | anaerobic fumarate reductase catalytic and NAD/flavoprotein subunit |
TGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGTTGCCATTACCGGCAGTTGCTGCACGCTCTGTCGCTTGTTCACCGGCCAGACGGCCGA > NC_000913/4380541‑4381112 | ggctTCCGCCGTATCGGCTCGATCGGCTCCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACg < 1:92886/288‑1 (MQ=255) ctTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACA < 1:42887‑M1/285‑1 (MQ=255) ctTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACA > 2:42887‑M1/1‑285 (MQ=255) ccgcctgtgtgcagcttacggCTTCGCAACCGGAATGGCGTTTGGCTGGCGGCGGCCTAGTAAGCTTCACTTCGCGGTACGCCAGGCGAGTCGGGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGGGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGGCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGa < 1:358765/269‑1 (MQ=255) gCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAg < 2:117331/289‑1 (MQ=255) cTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAATGGGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAgt < 2:420503/289‑1 (MQ=255) tCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAgtgt > 2:92886/1‑286 (MQ=255) tCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCa < 2:366653/289‑1 (MQ=255) tCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCa < 1:158821/289‑1 (MQ=255) ttCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTGCGTGTTGAACCCGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCAcgc > 1:231910/1‑287 (MQ=255) aGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTTTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCGGCAGGCATTCCAGCTTg > 1:550733/1‑288 (MQ=255) gTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCAt > 1:477616/1‑288 (MQ=255) cGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAg < 1:201709/256‑1 (MQ=255) cGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAg > 2:201709/1‑256 (MQ=255) cTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGc < 2:254204/289‑1 (MQ=255) cTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGc < 2:187641/289‑1 (MQ=255) cAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGt > 2:46380/1‑288 (MQ=255) cAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTa < 1:448052/289‑1 (MQ=255) gAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTCCGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACCCTGTAAGTGTCGGTGATGCGCCCGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCTAGCTTGCCGATGGCTTTCTTCATCAGTTCCGCCGTACGGTa > 1:447399/1‑289 (MQ=255) gCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGGCGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCg < 2:548552/289‑1 (MQ=255) ccATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCTAGCTTGACGTTGGTTTTCCGCATCAGTTCCGGCGTCCGGTCGATACCGc > 1:472545/1‑289 (MQ=255) aTCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAg < 1:299892/289‑1 (MQ=255) cAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGcc < 2:652050/289‑1 (MQ=255) gaTCGCGGAAGGCGAGGGTGGGTTTGAGGAGGTTGACGCCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCctt < 1:262325/287‑1 (MQ=255) aTCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCctt < 2:477616/287‑1 (MQ=255) ggAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGGGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑TGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCa < 2:686683/288‑1 (MQ=255) tttGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACAacgtctgaaagatctggttaaccaggatggcggcgaaaactgggcgaagatccgcgacgaaatgggcctggctatggaagaaggctgcggtatctaccgtacgccggaactgatgcagaaaaccatcgaca > 2:156327‑M1/1‑158 (MQ=255) aGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTcgc > 2:28378/1‑289 (MQ=255) tcgtcACGCTCGGTGCAACCTCCGTCCGGAGGCTGGTGCGCGCCGCGGGCCTCTTTACGTGCCATTGCGGAGGGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGcc < 1:224030/288‑1 (MQ=255) gtcACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAg > 2:462639/1‑289 (MQ=255) tcACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGt > 1:636736/1‑289 (MQ=255) tCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGCGTCCGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCCGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCAGTTCGTCGCGGATCTCCGCCACGTTTTcg > 1:138990/1‑288 (MQ=255) tGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCa < 1:624074/153‑1 (MQ=255) tGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCa > 2:624074/1‑153 (MQ=255) tGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTcgccgc > 1:683933/1‑288 (MQ=255) tCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTCAGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTGGCCGCCATTCTGGt > 1:208681/1‑289 (MQ=255) gTCCCGAGGGTGGGGCGCGCCGCGGGACTCGTTACGGGCCATTGCGGAGTGAGCAATTCATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGGGCAGGTCGGTGTTGAAGAacggctgaaagatctggttaaccaggatggcggcgaaaactgggcgaagatccgcgacgaaatgggcctggctatggaagaaggctgcggtatctaccgtacgccggaactgatgcagaaaaccatcgacaagctggcagagctgcaggaacgcttcaagcgcgtgcgc < 1:360169‑M1/288‑170 (MQ=255) gCTGGGGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACAacgtctgaaagatctggttaaccaggatggcggcgaaaactgggcgaagatccgcgacgaaatgggcctggctatggaagaaggctgcggtatctaccgtacgccggaactgatgcagaaaaccatcgacaagctggcagagctgcaggaacgcttcaagcgcgtgcgcatcaccga < 1:156327‑M1/288‑178 (MQ=255) gcgcgcCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTACCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAg > 2:693193/1‑289 (MQ=255) cgGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTtgtt < 1:560686‑M2/289‑5 (MQ=255) ccATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGAACTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGctgcct > 2:667892/1‑288 (MQ=255) aTTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCa < 2:296383/103‑1 (MQ=255) aTTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCa > 1:296383/1‑103 (MQ=255) tGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAAtt > 1:162247/1‑288 (MQ=255) gcCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGcc < 2:683933/288‑1 (MQ=255) tCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGGCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTAGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCCTTTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCCTTTCGTCGCGGACCTCCTCCCAGTTTTCGACGCTCACCTGGTTAAACACATACTTACTATGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTgaccgttccgtg > 1:331401/1‑277 (MQ=255) aaCGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGTTGCCAtt > 1:434897/1‑288 (MQ=255) cGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGTTTCCATTAcc > 2:456512/1‑289 (MQ=255) tCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTTTTCACCGCCCGCTGCCTGCCCTTCAATTGCCGCCTCGTTTCCATTACCgt > 1:136752/1‑287 (MQ=255) aCCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATTAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCACTTGCCGCTTCGTTGCCATTACCGCCAGtt > 1:167284/1‑289 (MQ=255) tGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGTTGCCATTACCGGCAGTtgct > 2:68508/1‑288 (MQ=255) ggCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGt > 2:467992/1‑267 (MQ=255) ggCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGt < 1:467992/267‑1 (MQ=255) ggCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGTTGCCATTACCGGCAGTtgctgc < 2:231910/289‑1 (MQ=255) ggCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGTTGCCATTACCGGCAGTtgctg > 1:423635/1‑288 (MQ=255) gTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGTTGCCATTACCGGCCGTTGCTGCCCGCTCTGTCGCCTGTTCACCGGc > 1:236686/1‑288 (MQ=255) gTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGTTGCCATTACCGGCAGtt > 1:148971/1‑259 (MQ=255) gTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGTTGCCATTACCGGCAGtt < 2:148971/259‑1 (MQ=255) gTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGTTGCCATTACCGGCAGTTGCTGCCCGCTCTGTCGCTTGTTCACCGGc > 1:328384/1‑288 (MQ=255) gTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGTTGCCATTACCGGCAGTTGCTGCACGCTCTGTCGCTTGTTCACCGGcc > 2:85567/1‑289 (MQ=255) gTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTACATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGTTGCCCTTACCGGCAGTTTCTGCACGCTCTGTCGCTTGTTCACCCGc > 1:678708/1‑288 (MQ=255) tgttttGAACACGCTGTAACTGTCGGTAATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGTTGCCATTACCGGCAGTTGCTGCACGCTCTGTCGCTTGTTCACCGGCCAGa < 1:577877/285‑1 (MQ=255) tGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGTTGCCATTACCGGCAGTTGCTGCACGCTCTGTCGCTTGTTCACCGGCCAGACGGc < 2:636736/288‑1 (MQ=255) aacaacgtctgaaagatctggttaaccaggatggcggcgaaaactgggcgaagatccgcgacgaaatgggcctggctatggaagaaggctgcggtatctaccgtacgccggaactgatgcagaaaaccatcgacaagctggcagagctgcaggaacgcttcaagcgcgtgcgcatcaccgacacttccagcgtgttcaacaccgacctgctctacaccattgaactgggccacggtctgaacgttgctgaatgtatggcgcactccgcaatggcacgtaaagagtcccg < 1:560686‑M1/289‑286 (MQ=255) aaCACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGTTGCCATTACCGGCAGTTGCTGCCCGCTCATGCGCTTGTTTACCGGCCAGGCCGCCGa > 1:17194/1‑289 (MQ=255) aaCACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGTTGCCATTACCGGCAGTTGCTGCACGCTCTGTCGCTTGTTCACCGGCCAGACGGCCGa > 2:90864/1‑289 (MQ=255) aaCACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGACTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGTTGCCATTACCGGCCGTTTCTGCACGCTCTGTCGCTTGTTCCCCGGCCCGACGGCCGa > 1:503/1‑289 (MQ=255) | TGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGCGGCAGCGTAGTAATCTTCACGTCGCTGTACTCCAGGCGAGTCGTGCCATCAGCATCGCGGAAGGCGAGGGTGTGTTTGAGGAAGTTGACGTCGTCACGCTCGGTGCAACCTTCGTCCAGACGCTGGTGCGCGCCGCGGGACTCTTTACGTGCCATTGCGGAGTGCGCCATACATTCAGCAACGTTCAGACCGTGGCCCAGTTCAAT‑GGTGTAGAGCAGGTCGGTGTTGAACACGCTGGAAGTGTCGGTGATGCGCACGCGCTTGAAGCGTTCCTGCAGCTCTGCCAGCTTGTCGATGGTTTTCTGCATCAGTTCCGGCGTACGGTAGATACCGCAGCCTTCTTCCATAGCCAGGCCCATTTCGTCGCGGATCTTCGCCCAGTTTTCGCCGCCATCCTGGTTAACCAGATCTTTCAGACGTTGTTCAACGCCAGCTGCCTGCGCTTCAATTGCCGCTTCGTTGCCATTACCGGCAGTTGCTGCACGCTCTGTCGCTTGTTCACCGGCCAGACGGCCGA > NC_000913/4380541‑4381112 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |