New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 3845530 = | 64 (0.850) | 88 (1.220) | 58/492 | NT | 57.2% | coding (1568/1767 nt) | adeD | cryptic adenine deaminase |
? | NC_000913 | = 3992759 | 70 (0.970) | coding (1608/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase |
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
TCTCTCGGAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCCATCTGGCGATTATCGTTAACCTGGAATATGACCCGACAGCGGCGTTCCGCAATCAGGTGGTGCATTTCGATTTCCGTAAGCTGGATGTCTTCAGCTTTGGCGAGAATCAAAATTGCCTGGTAGGTAGCGTTGACCTGCTGTACCGCAACTCGTGGAACGAAGTGCGTACGCTGCACTTCAACGGCGAGCAATCGATGATCGAAGCCCTGAAAACTATTCTCGGCAAAATGCATCAGGACGCCGCA > NC_000913/3992480‑3993047 | ggAACCGAATCTGACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTgcaccgacacggcg < 2:571696‑M2/288‑15 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |