New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1051218 = | 59 (0.770) | 4 (0.050) | 4/498 | NT | 6.6% | intergenic (‑43/‑243) | cspH/cspG | stress protein, member of the CspA‑family/cold shock protein homolog, cold‑inducible |
? | NC_000913 | 1051370 = | 56 (0.740) | intergenic (‑195/‑91) | cspH/cspG | stress protein, member of the CspA‑family/cold shock protein homolog, cold‑inducible |
AAAACCAGTCAGCTTTAAACAAGCAGCGTCATATTAAGAGAGATAAACATTTGCCGCTGTTGGTCCTCGCAGGCCATTTACGCGGCAAAATTCCACACGTAATCCTGGTATAAGCACTTCTGCGTCGCGGGGAGTGAATGCGGAAATATGGACCTGAACTTCTTTACGACCGTCGGAGGGGATAATGAATCCTTTGCCGCTTTTGCGATCAAAGGTTTTGACAATTCCTGTCATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGACGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTACTAAAGCAGTTCTCATTATCAGGCATTATCCCCTTCTTTTGAGTCTCTCTCCTGAACACTAAGTAGTTTCTGTATTAAAGCCCTGTTTGCCGAAAGGCCCAAAATGAAGGAAGTAAAATATGTCTAATAAAATGACTGGTTTAGTAAAATGGTTTAACGCAG > NC_000913/1050930‑1051503 | ttcgctgccgcggggccacgttgcccctgctcaatagaaaattcaactttctgattttcgttcagcgtgcggaattcattgctctggatggcggtgaaatggacgaaaacgtctttgctgccatcatcaggagtgataaagccaaaacctttatctgcgttaaaccattttactaaaccagtcattttattagacatattttacttccttcattttgggcctttcggcaaacagggctttaatacagaaactacttagtgttcaggagagagactcaaaagaaggggat > 2:612478‑M1/289‑289 (MQ=255) tcgcggccgcgggggcacgttgccgctgctaaataggaaattaaacgtactgattttcgttcagcgtgcggaattcattgctctggatggcggtgaaatggacgaaaacgtctttgctgccatcatcaggagtgataaagccaaaacctttatctgcgttaaaccattttactaaaccagtcattttattagacatattttacttccttcattttgggcctttcggcaaacacggctttaatacagaaactacttagtgttcaggagagagacgcaaaagaaggggata > 2:663116‑M1/288‑289 (MQ=255) aCCAGTCAGCTTTAAACAAGCAGCGTCATATTAAGAGAGATAAACATTTGCCGCTGTTGGTCCTCGCAGGCCATTTACGCGGCAAAATTCCACACGTAATCCTGGTATAAGCACTTCTGCGTCGCGGGGAGTGAATGCGGAAATATGGACCTGAACTTCTTTACGACCGTCGGAGGGGATAATGAATCCTTTGCCGCTTTTGCGCTCAAAGGTTTTGACAATTCCTGTCATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTtaat > 1:598262/1‑289 (MQ=255) gTCAGCTTTAAACAAGCAGCGTCATATTAAGAGAGATAAACATTTGCCGCTGTTGGTCCTCGCAGGCCATTTACGCGGCAAAATTCCACACGTAATCCTGGTATAAGCACTTCTGCGTCGCGGGGAGTGAATGCGGAAATATGGACCTGAACTTCTTTACGACCGTCGGAGGGGATAATGAATCCTTTGCCGCTTTTGCGATCAAAGGTTTTGACAATTCCTGTCATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTaataaaa > 2:498447/1‑289 (MQ=255) aaaCAAGCAGCGTCATATTAAGAGAGATAAACATTTGCCGCTGTTGGTCCTCGCAGGCCATTTACGCGGCAAAATTCCACACGTAATCCTGGTATAAGCACTTCTGCGTCGCGGGGAGTGAATGCGGAAATATGGACCTGAACTTCTTTACGACCGTCGGAGGGGATAATGAATCCTTTGCCGCTTTTGCGATCAAAGGTTTTGACAATTCCTGTCATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAg < 1:543409/289‑1 (MQ=255) aaaCAAGCAGCGTCATATTAAGAGAGATAAACATTTGCCGCTGTTGGTCCTCGCAGGCCATTTACGCGGCAAAATTCCACACGTAATCCTGGTATAAGCACTTCTGCGTCGCGGGGAGTGAATGCGGAAATATGGACCTGAACTTCTTTACGACCGTCGGAGGGGATAATGAATCCTTTGCCGCTTTTGCGATCAAAGGTTTTGACAATTCCTGTCATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAg < 1:128452/289‑1 (MQ=255) agggagaTCAACATTTGCCGCTGTTGGTCCTGCCAGGCCATTTACGCGGCAAAATTCCACACGTAATCCTGGTATAAGCACTTCTGCGTCGCGGGGAGTGAATGCGGAAATATGGACCTGAACTTCTTTACGACCGTCGGAGGGGATAATGAATCCTTTGCCGCTTTTGCGATCAAAGGTTTTGACAATTCCTGTCATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGa < 2:155567/286‑1 (MQ=255) agagagATAAACATTTGCCGCTGTTGGTCCTCGCAGGCCATTTACGCGGCAAAATTCCACACGTAATCCTGGTATAAGCACTTCTGCGTCGCGGGGAGTGAATGCGGAAATATGGACCTGAACTTCTTTACGACCGTCGGAGGGGATAATGAATCCTTTGCCGCTTTTGCGATCAAAGGTTTTGACAATTCCTGTCATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGTCAGCGATATTTAAGACCGCCgg > 2:235773/1‑288 (MQ=255) agagaTAAACATTTGCCGCTGTTGGTCCTCGCAGGCCATTTACGCGGCAAAATTCCACACGTAATCCTGGTATAAGCACTTCTGCGTCGCGGGGAGTGAATGCGGAAATATGGACCTGAACTTCTTTACGACCGTCGGAGGGGATAATGAATCCTTTGCCGCTTTTGCGATCAAAGGTTTTGACAATTCCTGTCATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGACg > 2:691561/1‑289 (MQ=255) aTAAACATTTGCCGCTGTTGGTCCTCGCAGGCCATTTACGCGGCAAAATTCCACACGTAATCCTGGTATAAGCACTTCTGCGTCGCGGGGAGTGAATGCGGAAATATGGACCTGAACTTCTTTACGACCGTCGGAGGGGATAATGAATCCTTTGCCGCTTTTGCGATCAAAGGTTTTGACAATTCCTGTCATTTTACGGTACAACCAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATTCGGGGTTACTAAAATAAAGCCAGCGATATTTCAGACCGCCGGACGGCta > 2:321900/1‑289 (MQ=255) 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tGGTCCTCGCAGGCCATTTACGCGGCAAAATTCCACACGTAATCCTGGTATAAGCACTTCTGCGTCGCGGGGAGTGAATGCGGAAATATGGACCTGAACTTCTTTACGACCGTCGGAGGGGATAATGAATCCTTTGCCGCTTTTGCGATCAAAGGTTTTGACAATTCCTGTCATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGACGGCTAAAATAAAATTTGCTTAAt < 1:691561/289‑1 (MQ=255) tGGTCCTCGCAGGCCATTTACGCGGCAAAATTCCACACGTAATCCTGGTATAAGCACTTCTGCGTCGCGGGGAGTGAATGCGGAAATATGGACCTGAACTTCTTTACGACCGTCGGAGGGGATAATGAATCCTTTGCCGCTTTTGCGATCAAAGGTTTTGACAATTCCTGTCATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGACGGCTAAAATAAAATTTGCTTAAt < 2:714560/289‑1 (MQ=255) ccATTTACGCGGCAAAATTCCACACGTAATCCTGGTATAAGCACTTCTGCGTCGCGGGGAGTGAATGCGGAAATATGGACCTGAACTTCTTTACGACCGTCGGAGGGGATAATGAATCCTTTGCCGCTTTTGCGATCAAAGGTTTTGACAATTCCTGTCATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGACGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATc < 2:142642/286‑1 (MQ=255) 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tGCCGCTTTTGCGATCAAAGGTTTTGACAATTCCTGTCATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGACGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTACTAAAGCAGTTCTCATTATCAGGCATTATCCCCTTCTTTTGAGTCTCTCTCCTGAACACTAAGTAGtt > 1:632211/1‑286 (MQ=255) cGCTTTTGCGATCAAAGGTTTTGACAATTCCTGTCATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGACGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTACTAAAGCAGTTCTCATTATCAGGCATTATCCCCTTCTTTTGAGTCTCTCTCCTGAACACTAAGTAGTTTCTGTa < 2:92056/289‑1 (MQ=255) tGACAATTCCTGTCATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGACGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTACTAAAGCAGTTCTCATTATCAGGCATTATCCCCTTCTTTTGAGTCTCTCTCCTGAACACTAAGTAGTTTCTGTATTAAAGCCCTGTTTGCCGaaa > 2:44858/1‑289 (MQ=255) 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AAAACCAGTCAGCTTTAAACAAGCAGCGTCATATTAAGAGAGATAAACATTTGCCGCTGTTGGTCCTCGCAGGCCATTTACGCGGCAAAATTCCACACGTAATCCTGGTATAAGCACTTCTGCGTCGCGGGGAGTGAATGCGGAAATATGGACCTGAACTTCTTTACGACCGTCGGAGGGGATAATGAATCCTTTGCCGCTTTTGCGATCAAAGGTTTTGACAATTCCTGTCATTTTACGGGACAAACAAATTCCTTACTGAAAATACTGCGCTGCACTATACGGGGTTAATAAAATAAAGCCAGCGATATTTAAGACCGCCGGACGGCTAAAATAAAATTTGCTTAATCTCAATTATCATGCGTTAATAGCTGCGTCGGTTTGAAAGACAGACAGCATACAAAGTAGTTTACTAAAGCAGTTCTCATTATCAGGCATTATCCCCTTCTTTTGAGTCTCTCTCCTGAACACTAAGTAGTTTCTGTATTAAAGCCCTGTTTGCCGAAAGGCCCAAAATGAAGGAAGTAAAATATGTCTAATAAAATGACTGGTTTAGTAAAATGGTTTAACGCAG > NC_000913/1050930‑1051503 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |