| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3845530 = | 71 (0.920) | 78 (1.060) | 59/486 | NT | 52.7% | coding (1568/1767 nt) | adeD | cryptic adenine deaminase |
| ? | NC_000913 | = 3992759 | 72 (0.980) | coding (1608/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase | |||||
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
ACAGCGAAAATGGTTTTGATCGCGATGATGTGAGCTTTATTGCCGTACTTGAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGGCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGCGACGGTCAGCCATGACAGCCATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCAGTCAGGGGCTATTTGATGGCGAGAAGTTTGCCTTCACTACGCTGGAAGTCACGGAATAATAAAAAAAGCCCGGCGTCATGCCGGGCAAAAGTCACCAGTTACGTTTATGCCACTGTCAACTGCTGAATTTTTTTCTCGC > NC_000913/3845242‑3845809 | gcacccgatcgctcggaaccgaatctgacctttttttatgtgccgccgagccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctg > 2:12686‑M1/289‑289 (MQ=255) atctctcggaaccgaatctgacctttatttatgtgccgccgggccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtagccgacgtgtcgcaccatttcccgcttcgcctacctGCACCGa < 2:515050‑M1/7‑1 (MQ=255) ttttGATCGCGATGATGTGAGCTTTATTGCCGTACTTGAGCGTTACGGGCAACGGCTGGCTCCGGCTTGTGGTTTGCTTGGCGGCTTTGGACTGAATGAAGGTGCGCTGGCTGCGACGGTCAGCCATGACAGCCATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGgcg < 1:592113/289‑1 (MQ=255) tctgacctttatttatgtgccgccgggccgggctaaccgttcaggttggtatctgtataaccgcgcgccaaatattgagtcgatcatcagccatcagccgctggaatataaccgttacctgaataaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTgg > 1:364411‑M1/266‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |