| New junction evidence | |||||||||||
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CGTGCTTTCGGAGAAGAAACCACCGGAATACGGATAGACGCAGAACGGTTACGCGCAGAGTAAGCCAGCATTACCGGTGCTTCATAGCCCGGGACCAGACGCTTATAAGAGTTGGTGGTCGGGTTTGCCAGGGCGTTAATCGCTTTAGCGTGTTTGATTACGCCGCCAATGTAGTACAGCGCCTGCTCAGACAGACCTGCGTATTTGTCGCCTGCGAACAGGTTAACGCCGTTTTTAGACAGAGACATGTGGCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGTTTTGGCATAAAGGTCGCGGTTTTACCGAAGCGGTGCGCTACGTTGTGCACAACATATTTGTAGATCTGAATTTCGTCAGCTTTTTTGGTCATGGTATTGAAGCGGGTAGCCACTTCGTTCTGACCAGCAGTCGCTACTTCGTGGTGATGGGCTTCAACCACCAGACCCATCTGTTCCATCACCAGACACATTTCAGAACGAATATCCTGAGCCGAGTCTACCGGTGGAACCGGGAAGTAACCGCCTTTCACTGCCGGACGGTGACCTTTGTTACCACCT > NC_000913/4056970‑4057536 | cgTGCTTTCGGAGAAGAAACCACCGGAATACGGATAGACGCAGAACGGTTACGCGCAGAGTAAGCCAGCATTACCGGTGCTTCATAGCCCGGGACCAGACGCTTATAAGAGTTGGTGGTCGGGTTTGCCAGGGCGTTAATCGCTTTAGCGTGTTTGATTACGCCGCCAATGTAGTACAGCGCCTGCTCAGACAGACCTGCGTATTTGTCGCCTGCGAACAGGTTAACGCCGTTTTTAGACAGAGACATGTGGCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGtt < 1:204473/289‑1 (MQ=255) agaaACCACCGGAATACGGATAGACGCAGAACGGTTACGCGCAGAGTAAGCCAGCATTACCGGTGCTTCATAGCCCGGGACCAGACGCTTATAAGAGTTGGTGGTCGGGTTTGCCAGGGCGTTAATCGCTTTAGCGTGTTTGATTACGCCGCCAATGTAGTACAGCGCCTGCTCAGACAGACCTGCGTATTTGTCGCCTGCGAACAGGTTAACGCCGTTTTTAGACAGAGACATGTGGCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGTTTTGGCATAAAGGt < 2:425921/288‑1 (MQ=255) ggATAGACGCAGAACGGTTACGCGCAGAGTAAGCCAGCATTACCGGTGCTTCATAGCCCGGGACCAGACGCTTATAAGAGTTGGTGGTCGGGTTTGCCAGGGCGTTAATCGCTTTAGCGTGTTTGATTACGCCGCCAATGTAGTACAGCGCCTGCTCAGACAGACCTGCGTATTTGTCGCCTGCGAACAGGTTAACGCCGTTTTTAGACAGAGACATGTGGCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGTTTTGGCATAAAGGTCGCGGTTTTACCGAAGCg < 2:17987/289‑1 (MQ=255) tAGACGCAGAACGGTTACGACCAGTGTAAGCCAGCATTACCGGTGCTTCATAGCCCGTGAACAGACGCTTATAAGAGTTGGTGGTCGGGTTTGCCAGGGCGTTAATCGCTTTAGCGTGTTTGATTACGCCTCCAATGTAGTGCAGCGCCTGCTCAGACAGACCTGCGTATTTGTCGCCTGCGAACAGGTTAACGCCGTTTTTAGACAGAGACATGTGGCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGTTTTGGCATAAAGGTCGCGGTTTTACCGAAGCGGt < 1:130302/288‑1 (MQ=255) cgcgGAACGGTAACGCGCAGAGTAAGCCAGCATAACCGGTGCTTCATAGCCCGGGACCAGACGCTTATAAGGGTTGGTGGTCGGGTTTGCCAGGGCGTTAATCGCTTTAGCGTGTTTGATTACGCCGCCAATGTAGTACAGCGCCTGCTCAGACAGACCTGCGTATTTGTCGCCTGCGAACAGGTTAACGCCGTTTTTAGACAGAGACATGTGGCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGTTTTGGCATAAAGGCCGCGGTTTTACCGAAGCGGTGCGCt < 2:191784/289‑1 (MQ=255) cGCAGAACGGTTACGCGCAGAGTAAGCCAGCATTACCGGTGCTTCATAGCCCGGGACCAGACGCTTATAAGAGTTGGTGGTCGGGTTTGCCAGGGCGTTAATCGCTTTAGCGTGTTTGATTACGCCGCCAATGTAGTACAGCGCCTGCTCAGACAGACCTGCGTATTTGTCGCCTGCGAACAGGTTAACGCCGTTTTTAGACAGAGACATGTGGCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGTTTTGGCATAAAGGTCGCGGTTTTACCGAAGCGGTGCGCt < 2:72897/289‑1 (MQ=255) aaCGGTTACGCGCAGAGTAAGCCAGCATTACCGGTGCTTCATAGCCCGGGACCAGACGCTTATAAGAGTTGGTGGTCGGGTTTGCCAGGGCGTTAATCGCTTTAGCGTGTTTGATTACGCCGCCAATGTAGTACAGCGCCTGCTCAGACAGACCTGCGTATTTGTCGCCTGCGAACAGGTTAACGCCGTTTTTAGACAGAGACATGTGGCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGTTTTGGCATAAAGGTCGCGGTTTTACCGAAGCGGTGCGCTACGtt > 2:168590/1‑289 (MQ=255) 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cGAACAGGTTAACGCCGTTTTTAGACAGAGACATGTGGCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGTTTTGGCATAAAGGTCGCGGTTTTACCGAAGCGGTGCGCTACGTTGTGCACAACATATTTGTAGATCTGAATTTCGTCAGCTTTTTTGGTCATGGTATTGAAGCGGGTAGCCACTTCGTTCTGACCAGCAGTCGCTACTTCGTGGTGATGGGCTTCAACCACCAGACCCATCTGTTCCATCACCAGACACATTTCAGAACGAATATCCTGAGCCGa > 1:136025/1‑289 (MQ=255) gTTAACGCCGTTTTTAGACAGAGACATGTGGCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGTTTTGGCATAAAGGTCGCGGTTTTACCGAAGCGGTGCGCTACGTTGTGCACAACATATTTGTAGATCTGAATTTCGTCAGCTTTTTTGGTCATGGTATTGAAGCGGGTAGCCACTTCGTTCTGACCAGCAGTCGCTACTTCGTGGTGATGGGCTTCAACCACCAGACCCATc < 2:138263/238‑1 (MQ=255) gTTAACGCCGTTTTTAGACAGAGACATGTGGCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGTTTTGGCATAAAGGTCGCGGTTTTACCGAAGCGGTGCGCTACGTTGTGCACAACATATTTGTAGATCTGAATTTCGTCAGCTTTTTTGGTCATGGTATTGAAGCGGGTAGCCACTTCGTTCTGACCAGCAGTCGCTACTTCGTGGTGATGGGCTTCAACCACCAGACCCATc > 1:138263/1‑238 (MQ=255) 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tttttAGACAGAGACATGTGGCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGTTTTGGCATAAAGGTCGCGGTTTTACCGAAGCGGTGCGCTACGTTGTGCACAACATATTTGTAGATCTGAATTTCGTCAGCTTTTTTGGTCATGGTATTGAAGCGGGTAGCCACTTCGTTCTGACCAGCAGTCGCTACTTCGTGGTGATGGGCTTCAACCACCAGACCCATCTGTTCCATCACCAGACACATTTCAGAACGAATATCCTGAGCCGAGTCTACCGGTGGAACCg > 1:64195/1‑289 (MQ=255) tttttAGACAGAGACATGTGGCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGTTTTGGCATAAAGGTCGCGGTTTTACCGAAGCGGTGCGCTACGTTGTGCACAACATATTTGTAGATCTGAATTTCGTCAGCTTTTTTGGTCATGGTATTGAAGCGGGTAGCCACTTCGTTCTGACCAGCAGTCGCTACTTCGTGGTGATGGGCTTCAACCACCAGACCCATCTGTTCCATCACCAGACACATTTCAGAACGAATATCCTGAGCCGAGTCTACCGGTGGAACCg > 2:502403/1‑289 (MQ=255) ggCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGTTTTGGCATAAAGGTCGCGGTTTTACCGAAGCGGTGCGCTACGTTGTGCACAACATATTTGTAGATCTGAATTTCGTCAGCTTTTTTGGTCATGGTATTGAAGCGGGTAGCCACTTCGTTCTGACCAGCAGTCGCTACTTCGTGGTGATGGGCTTCAACCACCAGACCCATCTGTTCCATCACCAGACACATTTCAGAACGAATATCCTGAGCCGAGTCTACCGGTGGAACCGGGAAGTAACCGCCTTTCa < 2:418692/288‑1 (MQ=255) 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CGTGCTTTCGGAGAAGAAACCACCGGAATACGGATAGACGCAGAACGGTTACGCGCAGAGTAAGCCAGCATTACCGGTGCTTCATAGCCCGGGACCAGACGCTTATAAGAGTTGGTGGTCGGGTTTGCCAGGGCGTTAATCGCTTTAGCGTGTTTGATTACGCCGCCAATGTAGTACAGCGCCTGCTCAGACAGACCTGCGTATTTGTCGCCTGCGAACAGGTTAACGCCGTTTTTAGACAGAGACATGTGGCAGTGCATACCGGAGCCGTTATCACCGAACATCGGTTTTGGCATAAAGGTCGCGGTTTTACCGAAGCGGTGCGCTACGTTGTGCACAACATATTTGTAGATCTGAATTTCGTCAGCTTTTTTGGTCATGGTATTGAAGCGGGTAGCCACTTCGTTCTGACCAGCAGTCGCTACTTCGTGGTGATGGGCTTCAACCACCAGACCCATCTGTTCCATCACCAGACACATTTCAGAACGAATATCCTGAGCCGAGTCTACCGGTGGAACCGGGAAGTAACCGCCTTTCACTGCCGGACGGTGACCTTTGTTACCACCT > NC_000913/4056970‑4057536 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |