| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1299498 | 2 (0.030) | 89 (1.210) | 70/274 | 0.0 | 98.9% | intergenic (+253/‑1684) | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+1453/‑484) | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
CAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAATTCAGCAGTAAGCGCCGTCAGACCAGAAAAGAGATTTTCTT > NC_000913/1299362‑1299640 | cAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataata > 2:954867‑M1/1‑137 (MQ=255) ataAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgt > 1:811135‑M1/1‑128 (MQ=255) taAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCC‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgtt > 2:838986‑M1/1‑127 (MQ=255) aGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGACACATCATAATCCTGCGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTACCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataacaatcaattgttaa > 2:50819‑M1/1‑125 (MQ=255) tgaTTTCCTTAACTGCTTCTCATGATCATCAGGTTATTTTCTCCACATCATAATACTGGGCTTGTGGAAGAACAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCGTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaa < 2:640190‑M1/142‑20 (MQ=255) gATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaat > 1:651717‑M1/1‑123 (MQ=255) gATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGATAAataataatcaattgttaaat > 1:135208‑M1/1‑123 (MQ=255) gATTTCCTTAACTGATTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTAGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTGCA‑CTGCCTCCGGTAGAGGAAAGTGGTAAaaaatcaccactcgttaaat > 2:569324‑M1/1‑123 (MQ=255) ttCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattat > 2:1123811‑M1/1‑120 (MQ=255) ccTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattg < 2:827166‑M1/143‑26 (MQ=255) aCTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcat > 1:91463‑M1/1‑113 (MQ=255) tGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGTCTTGCTGAAGAATAATTGACATGATATTATTAGTTCCAGCCGGGTTT‑GTAGAGGAAAGTGCTAAataataagcaattgttaaattattgtgcattt < 2:586425‑M1/143‑33 (MQ=255) gCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcattta > 2:900566‑M1/1‑110 (MQ=255) ctcctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcacta > 1:1039112‑M1/1‑106 (MQ=255) cctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaatcgttaaattattgtgcatttcactact > 1:754605‑M1/1‑104 (MQ=255) ctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg < 1:243036‑M1/143‑41 (MQ=255) tcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATCATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcacttgttcaattattgtgcatttcattactgg > 2:517104‑M1/1‑102 (MQ=255) tcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaatttttgtgcatttcactactgg > 1:816488‑M1/1‑102 (MQ=255) cccactatgttattTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAANAATAATGGAAATGATATTATTAAGTCCT‑CNGCCTTTGGTAGAGGAAAGNGCTAAanaataatnaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa < 2:889898‑M1/137‑44 (MQ=255) aCCATCTTGTTATGTTCGTCACATCATAATCCTGGTCGTGCTGAAGAATAAGTGAAATGATATTATTGATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa < 2:990005‑M1/143‑44 (MQ=255) ccctcatgttATTTTCACCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CAGCCGTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaac < 1:779359‑M1/140‑45 (MQ=255) catcatGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaacttattgtgcatttcactactggaact > 2:1039876‑M1/1‑98 (MQ=255) catcatGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCCAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaact < 1:1259394‑M1/143‑46 (MQ=255) catGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgta < 2:104142‑M1/143‑49 (MQ=255) atGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATTATATGATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaa < 1:958907‑M1/143‑50 (MQ=255) tGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaat > 2:630206‑M1/1‑93 (MQ=255) tGTTATTTTAGCAACATCAAAATCATGGGCTTGCATAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaat < 1:69231‑M1/143‑51 (MQ=255) ggtatTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCCGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatc < 1:808992‑M1/141‑52 (MQ=255) ttATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatca > 2:52202‑M1/1‑91 (MQ=255) aTTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcaga > 1:860581‑M1/1‑89 (MQ=255) ttttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaa < 1:32147‑M1/143‑56 (MQ=255) ttttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaa < 1:1103935‑M1/143‑56 (MQ=255) ttttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaa > 2:1302287‑M1/1‑88 (MQ=255) ttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaa > 1:504036‑M1/1‑86 (MQ=255) ccACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagata > 1:647758‑M1/1‑82 (MQ=255) cacaTCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGTCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatag < 2:546546‑M1/143‑63 (MQ=255) cacaTCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGATGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatag < 2:487715‑M1/143‑63 (MQ=255) acgtcataatCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagctaga > 1:518166‑M1/4‑80 (MQ=255) catcatAATTCTGGTGTTGTTGAAGAATAATTGTAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCGTTGGTAGAGGAAAGGGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagac < 1:995000‑M1/143‑65 (MQ=255) tAATCCGGGGCGTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgct < 2:414625‑M1/143‑70 (MQ=255) aaTCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtcatcagaaaagatagacatgctt > 2:295467‑M1/1‑73 (MQ=255) aTCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgctta < 1:279173‑M1/143‑72 (MQ=255) aTCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgctta < 2:816488‑M1/143‑72 (MQ=255) ccTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtactctgagaagatagacatgcttaca > 1:1237423‑M1/1‑70 (MQ=255) tGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaatgataaacatgcttaccca > 2:1183592‑M1/1‑68 (MQ=255) tGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagcca > 1:995383‑M1/1‑68 (MQ=255) gggCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTCAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaa > 2:587030‑M1/1‑67 (MQ=255) ggCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaat < 2:724450‑M1/143‑78 (MQ=255) gCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaac < 1:1058704‑M1/109‑45 (MQ=255) gCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaac > 2:1058704‑M1/1‑65 (MQ=255) cTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatct > 1:1051215‑M1/1‑64 (MQ=255) cTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatct > 1:225980‑M1/1‑64 (MQ=255) gaagaaTAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctattt < 2:605645‑M1/143‑86 (MQ=255) aagaaTAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttg > 2:583358‑M1/1‑57 (MQ=255) agaaTAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTTCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAatcataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttga < 1:838986‑M1/143‑88 (MQ=255) aataatTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgatt > 1:689370‑M1/1‑54 (MQ=255) taatTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattga < 1:1135061‑M1/143‑92 (MQ=255) taatTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattga > 2:372455‑M1/1‑52 (MQ=255) aatTGCAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCGTTTGGTAGAGGAAAGTGCTATatcataatcaattgttaaattattgtgcggttcactactggaactgtaatcagaaaagatagtcatgcttagccaatctctatttgagtgaa < 2:88755‑M1/143‑93 (MQ=255) aagtggagtgatattatTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaa < 2:1198274‑M1/135‑93 (MQ=255) atTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaat > 2:523583‑M1/1‑50 (MQ=255) ttGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaat > 2:946755‑M1/1‑49 (MQ=255) ttGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaat < 1:946755‑M1/142‑94 (MQ=255) aaaaGATATTATTAATTCCC‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaa < 2:725599‑M1/143‑98 (MQ=255) aaaTGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaa < 2:1124887‑M1/143‑98 (MQ=255) ctatgattAATTCCA‑CTGCGTGTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataaacaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatg < 2:212175‑M1/142‑103 (MQ=255) ttattaATTGCT‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgttt < 1:109210‑M1/143‑106 (MQ=255) attaATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagccatgcttagccaatctctatttgcttgaattgaaagatgtttgt > 2:187172‑M1/1‑36 (MQ=255) attaATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctattagcttgaagggaaagatgtttgt > 1:235104‑M1/1‑36 (MQ=255) taATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgtta > 2:973961‑M1/1‑34 (MQ=255) taATTCCA‑CTGCCTTTGGGTGAGGCAACTGCAAActatctatctgatggtaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgtta < 1:954867‑M1/143‑110 (MQ=255) aaTTCCA‑TTGCCGTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcagttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctcaaagtcattgaattgaaagatgtttgttaa < 2:162215‑M1/143‑111 (MQ=255) aTTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaag > 1:313916‑M1/1‑32 (MQ=255) ttCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaagg < 1:475733‑M1/143‑113 (MQ=255) cA‑CTGTCTTTGCCAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactgtaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcat < 1:1119224‑M1/143‑116 (MQ=255) cA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcat < 1:372455‑M1/143‑116 (MQ=255) cTGTCTTTGGTAGTGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatgg < 1:255681‑M1/143‑118 (MQ=255) cTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatgg < 1:491356‑M1/143‑118 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatg > 1:991382‑M1/1‑23 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactcgaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatg > 2:232729‑M1/1‑23 (MQ=255) ttGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgacttgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaa > 1:493529‑M1/1‑20 (MQ=255) ttGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaa > 2:36463‑M1/1‑20 (MQ=255) aacctggtggagctGCCAACGAAGGTGCTAACAAGCGCCTAATCGGAGAACATGTTGGTCAGCTGAACCCATAGAACAGGGTTCATTATTAGTCATCACCTTACCTTCGCCGACAGTGAATTCAGCAGTAAGCGCCGTCAGAc < 2:641825/130‑1 (MQ=2) ggTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgcttgaattgaatgacgtttgttaagccctggatgcaagc > 1:160080‑M1/1‑18 (MQ=255) ggTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagc > 2:752523‑M1/1‑18 (MQ=255) ggTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaacagtaatcagtaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagc < 1:664687‑M1/143‑126 (MQ=255) gagGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctata < 1:112856‑M1/143‑130 (MQ=255) gagGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctata > 2:176689‑M1/1‑14 (MQ=255) gattttGCTAAGGAAGGAGCGAACAAGCCCCCGTGAGGACAGCGTGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGAATCATAATGAGTCCTCAACTTACCTTCGCCGAGCGTGAATACAGCAGTAAGCACCGGCAGACCAGaaaac > 2:1292243/6‑142 (MQ=2) aaaGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgttatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagatt < 1:609344‑M1/143‑134 (MQ=255) gTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagattctg < 1:52202‑M1/143‑137 (MQ=255) ggtaaataatagtcaattgttaaattataatgcgtgtgactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagattctgat < 1:1241616‑M1/141‑139 (MQ=255) tAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagattctgatac > 1:1227031‑M1/1‑3 (MQ=255) tAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagattctgatac > 1:247065‑M1/1‑3 (MQ=255) tAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctataaattctgatac > 2:655849‑M1/1‑3 (MQ=255) aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatacaagctatagattctgatacgg > 2:677173‑M1/1‑1 (MQ=255) | CAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCA‑CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAATTCAGCAGTAAGCGCCGTCAGACCAGAAAAGAGATTTTCTT > NC_000913/1299362‑1299640 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |