| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 4102352 = | 87 (0.910) | coding (664/984 nt) | kdgT | 2‑keto‑3‑deoxy‑D‑gluconate transporter | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
TTCCATCATGCAGCAGTACGGCACAAAAGAAGAAGCTGGGGCATTTGTGTTGATGTCGTTGGAGTCCGGGCCGCTCATGACGATGATTATTCTGGGCACTGCCGGGATTGCCTCGTTTGAACCGCATGTTTTCGTCGGCGCAGTATTACCGTTCCTGGTGGGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAGGGGCCGCGGTAGCGACACCTGTGCTGATTGCAGAAATGGTGCCTGCGTTTAAACCGATGGCTCCGGCAGCAACTTCGCTGGTAGCGACGGCGGTCATTGTGACTTCGATTCTGGTGCCAATTCTTACCTCTATCTGGTCACGTAAAGTCAAAGCCAGAGCA > NC_000913/4102069‑4102639 | ttCCAGCATGCAGCATTAAGGAACAAAAGAAGAAGCTGGGGCATTTGTGTGGATGTCGTTGGAGTCCGGGCCGCGCATGACGATGATTATTCTGGGGACTGCCGGGATTGCCTCGGTTGAACCGCATGTTTTCGTCGGCGCAGTATTACCGTTCCTGGTGGGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGt < 2:108244/289‑1 (MQ=255) aagaagaagCTGGGGCATTTGTGTTGATGTCGTTGGAGTCCGGGCCGCTCATGACGATGATTATTCTGGGCACTGCCGGGATTGCCTCGTTTGAACCGCATGTTTTCGTCGGCGCAGTATTACCGTTCCTGGTGGGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGCATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTTGGCACTACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGCCTGGTTTGCTGGGGATCGTCTTGGGTGTGGc > 2:285985/1‑289 (MQ=255) aagaagaagCTGGGGCATTTGTGTTGATGTCGTTGGAGTCCGGGCCGCTCATGACGATGATTATTCTGGGCACTGCCGGGATTGCCTCGTTTGAACCGCATGTTTTCGTCGGCGCAGTATTACCGTTCCTGGTGGGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTgg > 1:246766/1‑270 (MQ=255) aagaagaagCTGGGGCATTTGTGTTGATGTCGTTGGAGTCCGGGCCGCTCATGACGATGATTATTCTGGGCACTGCCGGGATTGCCTCGTTTGAACCGCATGTTTTCGTCGGCGCAGTATTACCGTTCCTGGTGGGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTgg < 2:246766/270‑1 (MQ=255) aTTTGTGTTGATGTCGTTGGAGTCCGGGCCGCTCATGACGATGATTATTCTGGGCACTGCCGGGATTGCCTCGTTTGAACCGCATGTTTTCGTCGGCGCAGTATTACCGTTCCTGGTGGGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGAc < 1:784394/288‑1 (MQ=255) gTTGGAGTCCGGGCCGCTCATGACGATGATTATTCTGGGCACTGCCGGGATTGCCTCGTTTGAACCGCATGTTTTCGTCGGCGCAGTATTACCGTTCCTGGTGGGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGAtt > 2:333837/1‑289 (MQ=255) aGTCCGGGCCGCTCATGACGATGATTATTCTGGGCACTGCCGGGATTGCCTCGTTTGAACCGCATGTTTTCGTCGGCGCAGTATTACCGTTCCTGGTGGGCTTTGCCCTGGGGAACCTTGACCCTGAATTGCGAGAATTTTTCAGCAAAGCGGTGCAAACGCTGATTCCATTCTTTGCCTTCGCGCTGGGCAATACCATTGATTTGACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCg > 1:67372/1‑288 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |