| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,523,475 | C→A | 2.9% | P203T (CCG→ACG) | mrcA → | penicillin‑binding protein 1a, murein transglycosylase and transpeptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,523,475 | 0 | C | A | 2.9% | 489.0 / 2.7 | 138 | P203T (CCG→ACG) | mrcA | penicillin‑binding protein 1a, murein transglycosylase and transpeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (59/74); new base A (2/2); total (62/76) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
GTTCTCCGGTCACGCGTCACAAGGGGCAAGTACCATTACCCAGCAGCTGGCGAGAAACTTCTTCCTCAGTCCAGAACGCACGCTGATGCGTAAGATTAAGGAAGTCTTCCTCGCGATTCGCATTGAACAGCTGCTGACGAAAGACGAGATCCTCGAGCTTTATCTGAACAAGATTTACCTTGGTTACCGCGCCTATGGTGTCGGTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACGGTTATCGCATTTACACCACCATCACCCGCAAAGTGCAGCAGGCC > NC_000913/3523195‑3523762 | gTTCTCCGGTCACGCGTCACAAGGGGCAAGTACCATTACCCAGCAGCTGGCGAGAAACTTCTTCCTCAGTCCAGAACGCACGCTGATGCGTAAGATTAAGGAAGTCTTCCTCGCGATTCGCATTGAACAGCTGCTGACGAAAGACGAGATCCTCGAGCTTTATCTGAACAAGATTTACCTTGGTTACCGCGCCTATGGTGTCGGTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAgc > 2:140947/1‑288 (MQ=255) 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GTTCTCCGGTCACGCGTCACAAGGGGCAAGTACCATTACCCAGCAGCTGGCGAGAAACTTCTTCCTCAGTCCAGAACGCACGCTGATGCGTAAGATTAAGGAAGTCTTCCTCGCGATTCGCATTGAACAGCTGCTGACGAAAGACGAGATCCTCGAGCTTTATCTGAACAAGATTTACCTTGGTTACCGCGCCTATGGTGTCGGTGCTGCGGCACAAGTCTATTTCGGAAAAACGGTCGACCAACTGACGCTGAACGAAATGGCGGTGATAGCCGGGCTGCCGAAAGCGCCTTCCACCTTCAACCCGCTCTACTCGATGGATCGTGCCGTCGCGCGGCGTAACGTCGTGCTGTCGCGGATGCTGGATGAAGGGTATATCACCCAACAACAGTTCGATCAGACACGCACTGAGGCGATTAACGCTAACTATCACGCGCCGGAGATTGCTTTCTCTGCGCCGTACCTGAGCGAAATGGTGCGCCAGGAGATGTATAACCGTTATGGCGAAAGTGCCTATGAAGACGGTTATCGCATTTACACCACCATCACCCGCAAAGTGCAGCAGGCC > NC_000913/3523195‑3523762 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |