Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,792,463 | 0 | A | T | 4.4% | 475.3 / 3.1 | 134 | S30T (TCT→ACT) | kbl | glycine C‑acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (50/77); new base T (5/2); total (55/79) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.23e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
GCACCCAGAAGCGTTTCAAACAGGCCACCGTTAGCATCAAAGCAGGAAGAGTAGAGAATCGCATCTTCCATCCCCAGGAAGGCCGCCAGTTTTTGTTCAAGCTCTTTATGGCTGTCCTGAGTGCCGCAAATAAAACGCACCGAAGCCATGCCGAAACCGTGAGAATCCATTCCCGCCTTTGCCGCCGCAATCAGATCAGGATGATTCGCCAGCCCGAGATAGTTGTTGGCACAAAAGTTAATGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACGTAATAATGCGCTCTTCTTTAAACAACCCTTCCGCCCGTGCGGTTTCCAGATCGTTGGTTAACTGCTGATAAAATTCTCCACGCATTGCGATTCTCCAGACAGGGCAAATTCCAGCACATATTACCCAAACTTATAGGTCGCGACGAGATAACGCGTTAACACTTCTGCAAAATTCAGGATAAATAACGTGTAACTTGATGTCTCTCAACACCTACAGATAGTAGAAAAACTGTACAGTTTTGGCTGGGCATAATGATGATTGATTTTACTGCA > NC_000913/3792177‑3792738 | gtaaccAGAAGTGTGTCAAAAAGGCGACAGTTAGAATCAAGAGAGGAATAGGAGAGATTCGGATCTTCAATCCCCAGAAGTGCAGCCAGTTTTTGTTCAGGCTCTTTATGTCTGTCCTGAGTTCCGCAAATAAAACGCACGGAAGACATGCCGAAACCGTGAGAATCCATTCCCGCCTTTGCAGCCGCAATCAGATCAGGATGATTCGCCAGCGCGAGATAGTTATTGGCACAAAAGTTAATGACGTGGCTTCCATCAGCCACAGTGATATCTGCTTGCTGCGCAGACg < 2:131409/285‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |