| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | Exported | 1,398,460 | G→A | 7.6% | V262M (GTG→ATG) ‡ | yeiQ → | predicted dehydrogenase, NAD‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | Exported | 1,398,460 | 0 | G | A | 7.6% | 231.1 / 6.2 | 79 | V262M (GTG→ATG) ‡ | yeiQ | predicted dehydrogenase, NAD‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (41/32); new base A (4/2); total (45/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.45e-01 | |||||||||||
GGAAATCAGCCAGCATCTGGGGGTGAATGATCCCTGCGCGATTAGCTGCGAACCGTTTATCCAGTGGGTGGTGGAAGATAACTTCGTCGCTGGGCGTCCTGCCTGGGAAGTCGCAGGTGTACAAATGGTGAATGATGTCCT > Exported/1398390‑1398530 | ggAAATCAGCCAGCATCTGGGGGTGAATGATCCCTGCGCGATTAGCTGCGAACCGTTTATCCAgtgggtgg > 1:4219094/1‑71 (MQ=255) aaaTCAGCCAGCATCTGGGGGTGAATGATCCCTGCGCGATTAGCTGCGAACCGTTTATCCAGTGGgtggtg > 1:2352294/1‑71 (MQ=255) aaTCAGCCAGCATCTGGGGGTGAATGATCCCTGCGCGATTAGCTGCGAACCGTTTATCCAGTGGGtggtgg < 1:4597103/71‑1 (MQ=255) aTCAGCCAGCATCTGGGGGTGAATGATCCCTGCGCGATTAGCTGCGAACCGTTTATCCAgtgggtgg < 1:3399519/67‑1 (MQ=255) agccagcATCTGGGGGTGAATGATCCCTGCGCGATTAGCTGCGAACCGTTTATCCAGTGGGTGGTGGAAg < 1:3657530/70‑1 (MQ=255) agccagcATCTGGGGGTGAATGATCCCTGCGCGATTAGCTGCGAACCGTTTATCCAGTGGGTGGTGGAAg < 1:4715092/70‑1 (MQ=255) agcATCTGGGGGTGAATGATCCCTGCGCGATTAGCTGCGAACCGTTTATCCAGTGGGTGGTGGAAGATAAc > 1:781736/1‑71 (MQ=255) aTCTGGGGGTGAATGATCCCTGCGCGATTAGCTGCGAACCGTTTATCCAGTGGGTGGTGGAAGATAACTtc > 1:4034143/1‑71 (MQ=255) 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GGAAATCAGCCAGCATCTGGGGGTGAATGATCCCTGCGCGATTAGCTGCGAACCGTTTATCCAGTGGGTGGTGGAAGATAACTTCGTCGCTGGGCGTCCTGCCTGGGAAGTCGCAGGTGTACAAATGGTGAATGATGTCCT > Exported/1398390‑1398530 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |