| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | Exported | 2,220,149 | T→C | 7.4% | intergenic (+409/‑569) | yhdH → / → accB | predicted oxidoreductase, Zn‑dependent and NAD(P)‑binding/acetyl CoA carboxylase, BCCP subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | Exported | 2,220,149 | 0 | T | C | 7.4% | 268.0 / 8.7 | 94 | intergenic (+409/‑569) | yhdH/accB | predicted oxidoreductase, Zn‑dependent and NAD(P)‑binding/acetyl CoA carboxylase, BCCP subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (52/35); new base C (4/3); total (56/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.82e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CTGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCTTGTCGCGATCCTGGCATCCCTACATTATTT > Exported/2220080‑2220219 | cTGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAAtt > 1:1872685/1‑71 (MQ=255)cTGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAAtt < 1:4757492/71‑1 (MQ=255) tGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTg > 1:240438/1‑71 (MQ=255) tGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTg > 1:4081791/1‑71 (MQ=255) tGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTg > 1:5572976/1‑71 (MQ=255) gCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTggg > 1:1358528/1‑70 (MQ=255) gCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTggg > 1:4081054/1‑70 (MQ=255) aTTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGt < 1:1154700/69‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |