New junction evidence
		seq id	position	reads (cov)	reads (cov)	score	skew	freq	annotation	gene	product
*	?	Exported	183922 =	64 (0.870)	68 (1.110) +TTATAACA	14/80	NT	59.5%	intergenic (+8/‑29)	rnhB/dnaE	ribonuclease HII, degrades RNA of DNA‑RNA hybrids/DNA polymerase III alpha subunit
	?	Exported	= 296824	47 (0.640)					intergenic (+125/‑28)	cof/ybaO	thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase/predicted DNA‑binding transcriptional regulator

GACATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑  <  Exported/183955‑183922 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTTAATTTTATTTT  <  Exported/296824‑296810                                   ||||||||                gtCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTT             <  1:121577/44‑1  tCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTT             <  1:242823/44‑1   CATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT    >  1:3831709/1‑53   CATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT    >  1:4188827/1‑53   CATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT    >  1:5021322/1‑53    ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAAT          >  1:3055466/1‑46    ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATT               <  1:3390215/41‑1    ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATT               <  1:3757661/41‑1    ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATT               <  1:4113725/41‑1    ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATT               <  1:4125230/41‑1 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.